小中大我觉得millipore的ppt讲的两种方法对比其实是两个事情:LCMSMS比较的是试剂盒提供的HCP和自己发酵产生HCP的表达谱差异。2DWB比较的是试剂盒提供的抗体覆盖自己发酵产生HCP的能力。抗体亲和力、蛋白免疫原性的原因覆盖不了这么多蛋白,当然会比LCMSMS结果覆盖率低。
millipore银染的300多种蛋白也比cygnus号称的能检出CHO HCP 700多种蛋白低很多。(不确定是不是用的cygnus盒子)这些可以发给cygnus技术支持问问。
其实不管检出率多少,参考6L所说方法,如果用自己制备CHO HCP定量作为标品,用商业化试剂盒检测,能得到相对浓度,是否可行了?