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标题:【讨论帖】western blot问题解答

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没用过
但是哺乳动物细胞用尿素配方干嘛?
蛋白酶抑制剂cocktail和PMSF要同时加
没有不良后果

===================================================

能否分享一下尿素裂解液配方啊,动物细胞不需要吗?为什么?
非常感谢!
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哺乳动物细胞的我没用过
尿素配方一般用来溶解一些包涵体蛋白
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笑弯了腰[使用道具]
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我做WESTERN 遇到奇怪的问题。

要做一个100左右大小的蛋白,提取蛋白后,先煮沸,后-20度冻存。常规跑胶转膜,加抗体曝光,在需要的位置看到明显的条带,另外50-70左右还有另外一条较弱的条带。后来蛋白又重新解冻,煮沸,重做WESTERN. 这次虽然还是2条条带,可是变成了100左右较弱,50-70左右的那条较强。

问题1 为什么2次结果不一样?
2 上样前煮沸,或者提取蛋白后立刻煮沸冻存,上样前再解冻再次煮沸有区别吗?

还有一个怪现象

我曾经作过几个分泌性蛋白,如IL-10。抗体说明书上指示目标蛋白在20KB左右,可是我做出来在50KB左右有明显条带,20左右没有看到。追溯文献,几乎所有文献都是用ELISA来检测。极少看到用WESTERN的报道。

问题1 为什么我的条带的位置不对?
2 是不是有些蛋白不适合WESTERN?怎样判定适合不适合?

谢谢
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nn255[使用道具]
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你好,我现在在做western,暴光后发现目的带与marker标记的大小不在同一个位置,要比marker标记的偏小约10kd,请问是什么原因引起的,是不是蛋白有可能被降解了,谢谢
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原帖由 nn255 于 2013-1-30 10:36 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
你好,我现在在做western,暴光后发现目的带与marker标记的大小不在同一个位置,要比marker标记的偏小约10kd,请问是什么原因引起的,是不是蛋白有可能被降解了,谢谢 ...

如果条带非常特异,偏小约10K我认为没有问题
同时参考抗体说明书上的条带位置
看看你的参考文献里是否有偏小10K的
另外你要注意的是Marker问题
Marker不是你想像的那样准确
Marker在不同的体系中位置是不一样的
good luck
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QUOTE:
原帖由 笑弯了腰 于 2013-1-30 10:36 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

我做WESTERN 遇到奇怪的问题。

要做一个100左右大小的蛋白,提取蛋白后,先煮沸,后-20度冻存。常规跑胶转膜,加抗体曝光,在需要的位置看到明显的条带,另外50-70左右还有另外一条较弱的条带。后来蛋白又重新解冻,煮沸,重做WESTER ...

你的目的蛋白是不是二聚体?
或许是降解了
分泌型的蛋白质做WB的是不多
我做过PDGF,细胞分泌的,做了细胞裂解液,没有阳性条带
WB首先要确定抗原能通过SDS-PAGE后转移到膜上
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谢谢。有道理。

我做的是磷酸化蛋白。看来蛋白提取后立刻煮沸有利于保护蛋白。实际上,我做了2次试验,一次提取蛋白--立刻煮沸--冻存--测完蛋白浓度后再解冻上样,一次先测蛋白浓度--冻存--解冻煮沸上样,结果就是前一次100KB比70KB浓,后一次正好相反。有意思的是,如同我上文描述,前一次的样本,解冻后再次煮沸上样,得到了和后一次相同的结果。

关于第二个问题,为什么50KB有条带?可以认识这个条带是阳性的马?我用的单克隆抗体,
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QUOTE:
原帖由 loli 于 2013-1-30 10:39 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
谢谢。有道理。

我做的是磷酸化蛋白。看来蛋白提取后立刻煮沸有利于保护蛋白。实际上,我做了2次试验,一次提取蛋白--立刻煮沸--冻存--测完蛋白浓度后再解冻上样,一次先测蛋白浓度--冻存--解冻煮沸上样,结果就是前一次100KB比70KB浓 ...

查看蛋白信息
另外查抗体的说明信息然后确定条带
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western问题求助
蛋白分子量6.9KD,等电点12左右,有磷酸化和非磷酸化两种形式,每次做western只能杂到磷酸化的15KD左右条带,这与文献上讲的磷酸化后的大小一致,但是总是杂不到正常大小即6.9KD左右的条带,一抗是用肽段做的抗体,应该是同时能杂到磷酸化和分磷酸化的,郁闷死了,技术瓶颈,试验拖了大半年,楼主有没有建议
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www.1[使用道具]
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我用的是caps转膜buffer,查过网上说小分子量蛋白转膜要加甲醇,而且甲醇浓度要稍高,利于小分子量蛋白的转膜,但是碱性蛋白转膜是不能用甲醇的,我就被郁闷到了,像我做这个蛋白,分子量又小,等电点又高,到底转膜该用什么进行转膜?
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