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标题:【讨论帖】western blot问题解答

duoduo[使用道具]
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请教老师!我的目的蛋白18KD,二聚体30KD,跑了很多次都没有目的条带,10分钟时没有条带,30分钟以上则像考染一样都是杂带,内参压出来还可以。
条件:
分离胶12%,上样量40ug,1.5mm厚胶,100V电泳90分钟,250mA湿转2小时,考染见清楚条带,转膜后胶考染未见条带,未作丽春红染色。一抗,SANTA,1:200,二抗:1:5000。5%脱脂奶粉封闭1小时,一抗室温2小时,TBST洗2分钟,10分钟,10分钟,5分钟,5分钟,5分钟,二抗1小时,洗膜同上。ECL反应3分钟。

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用15%分离胶
转膜1h
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duoduo[使用道具]
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补充一下:0.22和0.45的PVDF膜都试过。

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要用0.22um的膜
0.22um膜有个缺点就是背景会比0.45um的要高
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duoduo[使用道具]
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想向楼主请教如何简单快捷的得知蛋白是否降解?如果同时用丽染膜和考染胶没有目的蛋白所在位置的蛋白,是否可以结论降解了呢?有什么办法分辨是抗体不灵还是蛋白降解呢?非常感谢!

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我做过AMPK的蛋白
第一次做条带单一,非常好
-20度冻存的样品冻融了两次做WB AMPK就成两条带了
这是一个最简单的实例了
没有具体的检测方法
如果是纯化的蛋白可以通过电泳来比较有没有降解
一般的样品用考染可以看出来有没有降解
但不是很精确的
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duoduo[使用道具]
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相关疾病:
心肌梗死

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楼主,你好。我是新手,刚做了几次WB。有几个问题希望解答:
1.湿转过程中电转液的甲醛有什么作用?可不可以用SDS替代?
2.我的目的蛋白是63KD,等电点为8.8,请问用什么电转条件(电流,时间)比较合适?
3.电转条件包括电转成分与蛋白的等电点有无关系?
期待您的解答,谢谢

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1,甲醛?是甲醇吧?
2,63K用 300mA 恒流(半干) 1h20min
1.2mA每平方厘米膜面积 1h30min
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duoduo[使用道具]
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楼主,你好。我是新手,刚做了几次WB。有几个问题希望解答:
1.湿转过程中电转液的甲醛有什么作用?可不可以用SDS替代?
2.我的目的蛋白是63KD,等电点为8.8,请问用什么电转条件(电流,时间)比较合适?
3.电转条件包括电转成分与蛋白的等电点有无关系?
期待您的解答,谢谢

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我没有看到过电转语蛋白等电点的资料
不好意思
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duoduo[使用道具]
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请问老师,湿转是这个条件,那半干转呢?

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分子量大的半干转肯定不行
不建议采用
大于150K的蛋白我不会用半干转
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fei1226com[使用道具]
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相关疾病:
心肌梗死
1,不好意思,写错了,是甲醇,请问它的作用什么?解离与蛋白结合的SDS吗?可是我看有的资料显示有些电转液中还同时加有SDS和甲醇?
2,“1.2mA每平方厘米膜面积 1h30min” 指的是湿转电泳条件吗?
3,我用的是PVDF膜,用之前没有用甲醇浸泡,而是直接用电转液浸泡15min,有影响吗?是不是甲醇浸泡效果更好些?
4,我的实验目的是想从植物总蛋白中杂出我的目的蛋白。想请教下,有无办法可以知道自己目的蛋白表达量究竟有多高?(该基因RNA表达水平是比较高的,可是每次都杂不到带,怀疑是不是蛋白表达水平较低)
谢谢解答。
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1,不好意思,写错了,是甲醇,请问它的作用什么?解离与蛋白结合的SDS吗?可是我看有的资料显示有些电转液中还同时加有SDS和甲醇?
2,“1.2mA每平方厘米膜面积 1h30min” 指的是湿转电泳条件吗?
3,我用的是PVDF膜,用之前没有用甲醇浸泡,而是直接用电转液浸泡15min,有影响吗?是不是甲醇浸泡效果更好些?
4,我的实验目的是想从植物总蛋白中杂出我的目的蛋白。想请教下,有无办法可以知道自己目的蛋白表达量究竟有多高?(该基因RNA表达水平是比较高的,可是每次都杂不到带,怀疑是不是蛋白表达水平较低)
谢谢解答。

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1,甲醇起固定作用
2,SDS促进大分子蛋白转移
3,“1.2mA每平方厘米膜面积 1h30min” 指的是半干转电泳条件
4,PVDF用之前必须用无水甲醇活化,不可以直接用电转液浸泡
5,那你就要查你专业的相关文献了,看蛋白表达量的情况
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94kD大小的分子,根据版主的建议改用10%的胶。
用GAPDH做内参,结果很满意。
但是,目标分子却看不见,胶片荧光显色后---全是荧光,或者什么都看不见
santa 的二抗,说明1:2000———1:5000,我现在用的是1:4000
请教,这是什么原因?能否将二抗再稀释,如1:8000---1:10000?
谢谢!
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QUOTE:
原帖由 lgm 于 2013-2-5 10:32 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

94kD大小的分子,根据版主的建议改用10%的胶。
用GAPDH做内参,结果很满意。
但是,目标分子却看不见,胶片荧光显色后---全是荧光,或者什么都看不见
santa 的二抗,说明1:2000———1:5000,我现在用的是1:4000
请教,这是什么原因?能 ...

目的蛋白有条带吗?
对的
全是荧光的话要稀释至1:8000到1:10000
如果在全是荧光的情况下没有条带显示说明上样量不够大或者是一抗浓度不合适
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