小中大我做了好大半个月的WB,都只能做出33KD和内参43KD的蛋白,27的和19的一直都不出来,转膜后丽春红也染不出,换了小孔径的膜,转膜条件也调了好多次,结果都一样。
疑小分子量蛋白降解,今天又重新提取了蛋白,裂解液为自配三去污,(我们实验室一直用的配方,先前有人多次做出12KD的条带来),超声打碎(超声的次数多些会不会导致低分子量蛋白降解呢?),加热8分钟,高速离心,去上清,BAC测得浓度分别是10ug/ul,13ug/ul,上样20ul,蛋白总量100ug以上了,12%的胶,80V 30min,100V 到底,切下两个泳道的考马斯亮蓝染色30min,脱色后图片如下。上面的蛋白条带都集中在55到30KD,但在30KD以后蛋白就好像一下消失了样的,一个泳道的蛋白干脆就完全没有,另一个隐隐约约的有一点点。另外的几个泳道都到转到膜上,丽春红染色效果和胶的情况一样,30以上的有条带,以下的一片白板。
为什么我的蛋白在30KD以后就没有了呢?多次提取的蛋白都是这样。
思考:1.我的细胞(A549和A549/DDP)小分子量蛋白表达本来就少?但也不至于跑胶都跑不出来啊。
2.细胞裂解液有问题?但同样配方,师兄们却可以做出小分子量的。而且我自己的33KD的也能做出来。
3.跑胶没跑好,小分子量蛋白可能还在Mark指示的30KD左右?但我用10%的胶跑的效果也差不多。
4.我的细胞是从另一个实验室带去的,中间间隔大概30分钟,我就用一般的盒子装了那过去的,会不会是这里出问题呢?
急啊,总是那两个不出来,折腾我好久了,请各位帮我分析下,谢谢啦!
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从你的图来看电泳就有问题
先解决SDS-PAGE吧
后面的问题再慢慢解决