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标题:【讨论帖】western blot问题解答

kuohao17[使用道具]
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头痛
老师你好我一直在做这个分子量为180左右的蛋白(p糖蛋白),做了很多次条带都不干净,条带边上有纵向的黑影,一直不知道怎么解决。头痛哦。
我用的是8%的分离胶,感觉还是没有跑开,是抗体的问题嚒?请问老师要如何解决呢 谢谢哦


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moonlight45[使用道具]
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我配的下胶面倾斜,请问在用酒精压液面时酒精该怎样加可以避免液面倾斜,谢谢!

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如果排除试验台很倾斜的话,你会不会灌胶后没有立即用酒精来压呢?如果是这样的情况,那就是你人为的造成的外力的原因啦。及时压胶就好啦。只是推测,仅供参考,希望有用。
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降低一倍只有两种细胞出来,且很弱

=====================

抗体孵育是否完全?
转膜时气泡赶得干净吗?
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今天被碧云天的裂解液雷到了,说它裂解的蛋白不能用 bradford法测浓度,以前根本没注意。要用它的BCA试剂盒,以前都是用BRADFORD测蛋白浓度的,那看来是不准啊。昏了,那是我试验怎么做出来的啊?BCA从没用过,还要酶标仪?

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没有定量蛋白不是说做不出来
只不过是上样时没有一个统一的量
其实WB预实验后还是要根据内参的量来调整上样量的
可以用酶标仪,也可以用分光光度计
后者需要的样品要多一些
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心肌梗死
我做了好大半个月的WB,都只能做出33KD和内参43KD的蛋白,27的和19的一直都不出来,转膜后丽春红也染不出,换了小孔径的膜,转膜条件也调了好多次,结果都一样。
疑小分子量蛋白降解,今天又重新提取了蛋白,裂解液为自配三去污,(我们实验室一直用的配方,先前有人多次做出12KD的条带来),超声打碎(超声的次数多些会不会导致低分子量蛋白降解呢?),加热8分钟,高速离心,去上清,BAC测得浓度分别是10ug/ul,13ug/ul,上样20ul,蛋白总量100ug以上了,12%的胶,80V 30min,100V 到底,切下两个泳道的考马斯亮蓝染色30min,脱色后图片如下。上面的蛋白条带都集中在55到30KD,但在30KD以后蛋白就好像一下消失了样的,一个泳道的蛋白干脆就完全没有,另一个隐隐约约的有一点点。另外的几个泳道都到转到膜上,丽春红染色效果和胶的情况一样,30以上的有条带,以下的一片白板。
为什么我的蛋白在30KD以后就没有了呢?多次提取的蛋白都是这样。
思考:1.我的细胞(A549和A549/DDP)小分子量蛋白表达本来就少?但也不至于跑胶都跑不出来啊。
2.细胞裂解液有问题?但同样配方,师兄们却可以做出小分子量的。而且我自己的33KD的也能做出来。
3.跑胶没跑好,小分子量蛋白可能还在Mark指示的30KD左右?但我用10%的胶跑的效果也差不多。
4.我的细胞是从另一个实验室带去的,中间间隔大概30分钟,我就用一般的盒子装了那过去的,会不会是这里出问题呢?
急啊,总是那两个不出来,折腾我好久了,请各位帮我分析下,谢谢啦!


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我做了好大半个月的WB,都只能做出33KD和内参43KD的蛋白,27的和19的一直都不出来,转膜后丽春红也染不出,换了小孔径的膜,转膜条件也调了好多次,结果都一样。
疑小分子量蛋白降解,今天又重新提取了蛋白,裂解液为自配三去污,(我们实验室一直用的配方,先前有人多次做出12KD的条带来),超声打碎(超声的次数多些会不会导致低分子量蛋白降解呢?),加热8分钟,高速离心,去上清,BAC测得浓度分别是10ug/ul,13ug/ul,上样20ul,蛋白总量100ug以上了,12%的胶,80V 30min,100V 到底,切下两个泳道的考马斯亮蓝染色30min,脱色后图片如下。上面的蛋白条带都集中在55到30KD,但在30KD以后蛋白就好像一下消失了样的,一个泳道的蛋白干脆就完全没有,另一个隐隐约约的有一点点。另外的几个泳道都到转到膜上,丽春红染色效果和胶的情况一样,30以上的有条带,以下的一片白板。
为什么我的蛋白在30KD以后就没有了呢?多次提取的蛋白都是这样。
思考:1.我的细胞(A549和A549/DDP)小分子量蛋白表达本来就少?但也不至于跑胶都跑不出来啊。
2.细胞裂解液有问题?但同样配方,师兄们却可以做出小分子量的。而且我自己的33KD的也能做出来。
3.跑胶没跑好,小分子量蛋白可能还在Mark指示的30KD左右?但我用10%的胶跑的效果也差不多。
4.我的细胞是从另一个实验室带去的,中间间隔大概30分钟,我就用一般的盒子装了那过去的,会不会是这里出问题呢?
急啊,总是那两个不出来,折腾我好久了,请各位帮我分析下,谢谢啦!

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从你的图来看电泳就有问题
先解决SDS-PAGE吧
后面的问题再慢慢解决
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wood533[使用道具]
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从你的图来看电泳就有问题
先解决SDS-PAGE吧
后面的问题再慢慢解决

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大概是什么的问题呢,SDS?Tris8.8?丙烯?
但是我的蛋白Mark可以跑得很好啊……所以我一直都没想到是胶的问题。
丙烯,Tris8.8和6.8,还有SDS分别要怎样保存呢,保质期大概是多久呢?
谢谢老师!
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大概是什么的问题呢,SDS?Tris8.8?丙烯?
但是我的蛋白Mark可以跑得很好啊……所以我一直都没想到是胶的问题。
丙烯,Tris8.8和6.8,还有SDS分别要怎样保存呢,保质期大概是多久呢?
谢谢老师!

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4度一年没问题
你调整一下后先染胶
把结果图放山来
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am10[使用道具]
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电泳时肉眼能在胶上看到Marker条带吗?
Marker反复冻融了吗?

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相同的marker,电泳后染胶可以看到条带。marker是买回来就分装了,不存在反复冻融的问题。现在在试别的marker,看看有没有改进。
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QUOTE:
原帖由 am10 于 2013-2-8 09:25 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
电泳时肉眼能在胶上看到Marker条带吗?
Marker反复冻融了吗?

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相同的marker,电泳后染胶可以看到条带。mar ...

你的整个胶系统建议重配
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