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标题:【讨论帖】western blot问题解答

eric930[使用道具]
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您好,请教下,为什么我的western做出来的图都非常难看,关键是我的marker,我重来没有看见好看的我跑的marker。。无论电流大小。都会出现marker小分子扩散,拖尾。要么就是marker被挤成原点。大分子的都还蛮漂亮。小分子的真是难看,我觉得弄得我的目的蛋白分子量都不准。请您告诉我,如何能够跑出漂亮的marker。
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zwsyrt[使用道具]
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老师您好,再次向您请教western的问题。
我做了很长时间的western,做的蛋白分子量是92KD,一抗的推荐浓度是1:500,但是做的时候背景很高,2抗的浓度也降了一倍,但是背景还是很高,洗膜也洗了很多遍,但出来的片子背景就是黑的,想知道这是为什么。谢谢老师。
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楼主你好,我用BCA法测定的蛋白浓度,根据标准曲线计算出来的浓度比曲线的最高值要大很多(曲线标准品的最高浓度是0.5mg/ml,计算出来的样品浓度最小的是0.85mg/ml,最大的是4mg/ml)这样得到的样品浓度是不是不准呀?

我的样品上样达到了100ug,目的蛋白一抗1:500(推荐浓度为1:1000)但是压片20分钟后条带还是不太清楚,一开始2抗1:10000,后来1:5000还是不行;国外老板用15ug就可以做出来,一抗体1:1000,虽然抗体的公司不一样但是我的这个是CST的也不差呀,他的2抗1:2000.现在很困惑,不知道下一步怎么调整!
内参做出来但是表达不太一致,是不是蛋白测定有问题的原因呀?谢谢楼主!
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您好,请教下,为什么我的western做出来的图都非常难看,关键是我的marker,我重来没有看见好看的我跑的marker。。无论电流大小。都会出现marker小分子扩散,拖尾。要么就是marker被挤成原点。大分子的都还蛮漂亮。小分子的真是难看,我觉得弄得我的目的蛋白分子量都不准。请您告诉我,如何能够跑出漂亮的marker。

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用梯度胶
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老师您好,再次向您请教western的问题。
我做了很长时间的western,做的蛋白分子量是92KD,一抗的推荐浓度是1:500,但是做的时候背景很高,2抗的浓度也降了一倍,但是背景还是很高,洗膜也洗了很多遍,但出来的片子背景就是黑的,想知道这是为什么。谢谢老师。

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1,一抗、二抗孵育在封闭体系中进行
2,在TBST中加入0.5M NaCl,0.2% SDS洗膜试试,这样同时也会降低目的条带的敏感性
3,继续稀释二抗做预实验
4,有些是因为一抗不太好
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楼主你好,我用BCA法测定的蛋白浓度,根据标准曲线计算出来的浓度比曲线的最高值要大很多(曲线标准品的最高浓度是0.5mg/ml,计算出来的样品浓度最小的是0.85mg/ml,最大的是4mg/ml)这样得到的样品浓度是不是不准呀?

我的样品上样达到了100ug,目的蛋白一抗1:500(推荐浓度为1:1000)但是压片20分钟后条带还是不太清楚,一开始2抗1:10000,后来1:5000还是不行;国外老板用15ug就可以做出来,一抗体1:1000,虽然抗体的公司不一样但是我的这个是CST的也不差呀,他的2抗1:2000.现在很困惑,不知道下一步怎么调整!
内参做出来但是表达不太一致,是不是蛋白测定有问题的原因呀?谢谢楼主!

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BCA的标准品梯度为什么不从2mg/ml开始?
一抗CST的倒是不错,但是这里面涉及到目的蛋白的提取,你和国外老板比?
你们的系统条件一样吗?
就连最后一步在ECL的敏感性上都有很大的差别
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3648755[使用道具]
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哦,可我的蛋白浓度已经是100ug啦,我也做过200ug的条带也还是不清楚,那我接下来是不是要做200ug,然后一抗浓度提到1:200?内参会不会太粗啦!
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QUOTE:
原帖由 3648755 于 2013-2-23 11:21 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
哦,可我的蛋白浓度已经是100ug啦,我也做过200ug的条带也还是不清楚,那我接下来是不是要做200ug,然后一抗浓度提到1:200?内参会不会太粗啦!

200ug一个泳道已经over loading了
呵呵
你的系统是不是该调整一下?
我认为你现在的问题可能出现在蛋白提取上
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XYZQ[使用道具]
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谢谢您,我下次用梯度看看,呵呵。对了还要请教您个问题,就是我用braford测蛋白浓度,蛋白的浓度相差很大。最大的有13微克每微升,最小的才3.57.。。这样的话我该如何上样呢,还是按所有的60微克上样?那最大的上5微升,最小的上20微升么
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QUOTE:
原帖由 XYZQ 于 2013-2-23 11:22 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
谢谢您,我下次用梯度看看,呵呵。对了还要请教您个问题,就是我用braford测蛋白浓度,蛋白的浓度相差很大。最大的有13微克每微升,最小的才3.57.。。这样的话我该如何上样呢,还是按所有的60微克上样?那最大的上5微升,最小的上20 ...

建议用BCA来定量
定量后用蛋白抽提试剂与loading buffer把蛋白调整至浓度一致再上样
等体积
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