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标题:【讨论帖】western blot问题解答

orangecake[使用道具]
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老师,我最近做wb,条带两边总是有些翘,如图。
电泳条件:80V 20min;100V,60min 预染marker没问题,就是整体条带是上宽下窄,像是梯形
转膜条件:300MA 60MIN

凝完胶后没有洗加样孔,而是观察了一下每个加样孔,看上去都蛮平整的;我们老板让我用薄滤纸伸到孔里把两边底角多余的胶吸走,但我没见有多余的啊。。。
他说还有可能是样本不均匀,怎么才能弄均匀呢?谢谢!


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2013-3-2 09:10
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我最近提蛋白总出现问题,大鼠小肠组织,220mg组织加1ml裂解液(自己配置的),12000rpm10min,取上清160ul+40ul 5*loading buffer,煮沸5min后冷却,发现全是絮状的东西,上样时样品都下不去,试着跑电泳,结果蓝色的东西跑下去了,而孔里还是留有那些絮状的东西。后来用别人提取的蛋白(已经测试过没问题)+我们的5*loading buffer,同样出现上次问题。loading buffer一直放在4度,出现这样的问题会是什么原因啊?

以前取同样的小肠组织,只是裂解液是直接购买的碧云天的,loading buffer 是2*的,直接和蛋白以1:1的比列加的,没有出现上述问题。
另外我想请教版主loading buffer 的倍数怎么确定的,有用2*,有用5*,为什么用不同倍数的 ?

谢谢

===============================

loading中SDS量少,不能溶解蛋白
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我要做ERK1/2的WB,因为是个新手,能否介绍一下它的WB条件,如胶的浓度,跑胶的时间,干转时间等,还有ERK1/2的分子量为44/42,应该如何解决内参问题。万分感谢

=====================================

12%分离胶
溴酚蓝跑至胶底部转膜
干转:1.2mA每平方厘米膜面积,1h30min
内参选择用beta-tubulin 55K
或者GAPDH 37K
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老师,我最近做wb,条带两边总是有些翘,如图。
电泳条件:80V 20min;100V,60min 预染marker没问题,就是整体条带是上宽下窄,像是梯形
转膜条件:300MA 60MIN

凝完胶后没有洗加样孔,而是观察了一下每个加样孔,看上去都蛮平整的;我们老板让我用薄滤纸伸到孔里把两边底角多余的胶吸走,但我没见有多余的啊。。。
他说还有可能是样本不均匀,怎么才能弄均匀呢?谢谢!

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出现这种情况也正常
你试试分离胶电泳150V
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dog002[使用道具]
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MHC亚型分离,分子量大,现在电泳时间70-80V,18-20小时,作为内参的β-actin很容易跑不见了。有老师建议用梯度胶,可我们实验室没有梯度胶搅拌器,如果手工灌不均匀梯度胶,可行否?具体有没有什么好的建议?

现在买了MHC-I,MHC-II两个一抗,外加抗β-actin的抗体,一下子就3个一抗了,这个在后面WB转膜孵育的时候,怎么操作比较好呢?同时孵,有影响没有呢?

烦请斑竹赐教!

万分感谢!
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NBA[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 dog002 于 2013-3-2 09:13 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
MHC亚型分离,分子量大,现在电泳时间70-80V,18-20小时,作为内参的β-actin很容易跑不见了。有老师建议用梯度胶,可我们实验室没有梯度胶搅拌器,如果手工灌不均匀梯度胶,可行否?具体有没有什么好的建议?

现在买了MHC-I,MHC-II两 ...

你的电泳槽什么型号?
胶的高度有多少?
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请问版主,我W的结果在目的条带的位置全部表现为像大气泡一样的黑色(我也很难描述准确),以前也遇到过。另外的标本相同的指标不是,而且b-actin也是好的,不知是什么原因?如何改良呢?谢谢!
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831226[使用道具]
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图今天没有拷,就是黑色一团,在目的条带的位置100多
k,但是又看着圆圆的。如果实在难以想象那就等明天了呵呵。很为难您啊。谢谢版主!
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831226[使用道具]
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我用的是碧云天的ECL化学发光试剂,以前的时候用的很好,之后条带量。昨天晚上用的时候发现AB液体一混之后,EP管就开始发亮,仿佛荧光棒一样,亮度亮到可以看清楚暗室中的东西。滴到膜上之后不光整张膜都亮,所有沾到发光液的地方都在亮。好像夜空中的繁星。根本就没法曝光,恳请斑竹赐教。
PS:我在加AB液的时候换枪头了,EP管也是新的,刚刚消完毒的。而且我用了实验室的其他不同五个人的,不同批次和厂家的,都出现了这个情况,以前的时后都没有。发光液没有过期。最早的是今年八月份买的。最晚的是十一月份买的。
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mamamiya[使用道具]
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请教大家几个问题:
1、我做的是人肿瘤细胞,钙网蛋白(calreticulin, CRT/CALR),刚开始用的是abcam的兔源多抗ab4,怎么都没有条带,投诉后换了同样是兔多抗的ab2904,条带出来了(单一且位置符合)。但是现在由于做co-IP,换了个其他实验室使用的很好的stressgen的鼠单抗,居然又没有出来(条件和他们实验室一样,甚至增加了3倍的浓度,延长孵育时间都没有),而且用的是同一张膜,先用的abcam的兔多抗,条带很强,但是由于和IgG重链没有分开,所以重新洗膜后再孵stressgen的鼠单抗,结果连阳性对照都没有出来,再用同一张膜重新孵育abcam的兔多抗,又出来了,这是什么原因呢?

2、接上面的问题,对于同一张膜,同一个蛋白使用不同的来源的抗体,条带应该在一个位置吗?

3、再接上面的问题,我的IP目的蛋白是64KDa,IgG重链是50,我现在用的是12.5%的胶,120V跑上层,80V下层跑3小时,结果由于IgG太强,掩盖了目的蛋白的信息,本来想换鼠源性的抗体来回避这个问题的,但是由于那个鼠源性的抗体一直没有出来,那只有在兔源抗体上想办法了。我除了降低IP的抗体浓度以外(厂家只说可以做IP,但是没有推荐浓度,ICC的推荐浓度是1/300,我这次做IP用的是1/100),还想通过改变下层胶的浓度是电泳时间来再将64-50两个条带拉开一些,有没有什么建议啊?有说如果电泳时间过长会使条带弥散,最长可以跑多长时间?

4、在我的试验中,两种不同的细胞A和B蛋白本来表达就有差异,如何做IP,比较这两个不同细胞中A蛋白与B蛋白结合能力的强弱呢?是不是只能靠调整上样量啊?例如在药物处理后的细胞中A蛋白的量是未处理细胞的两倍,那在做IP时,将药物处理后的细胞的蛋白量少上一半啊?有没有其他的办法啊?

5、还有一个ICC的荧光二抗的问题,我使用的是proteintech的cy3兔抗,厂家推荐是1:20-100,我稀释到1:600都有假阳性(用PBS代替一抗),用没有哪位用过该厂家的该荧光二抗啊?
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