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标题:【讨论帖】western blot问题解答

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请问老师几个比较业余的问题吧,做过PTEN蛋白和NF-KB蛋白的吗?是不是都属于磷酸化蛋白,都不太好出啊?谢谢
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请教楼主,我跑western转膜后用ponceau S染色,有的泳道条带发生内缩,条带不实。请问可能是什么原因造成的?跑胶用的Invitrogen NuPAGE System,100V电压,压平后换200V,为提高上样量,用的自己制备的10*loading buffer。


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2013-3-13 17:45
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请问老师几个比较业余的问题吧,做过PTEN蛋白和NF-KB蛋白的吗?是不是都属于磷酸化蛋白,都不太好出啊?谢谢

==============================================

1、这两个蛋白做过,很好做,呵呵
2、有磷酸化形式,看你是不是要检测磷酸化形式了,呵呵
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QUOTE:
原帖由 mickeylin 于 2013-3-13 17:44 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

请教楼主,我跑western转膜后用ponceau S染色,有的泳道条带发生内缩,条带不实。请问可能是什么原因造成的?跑胶用的Invitrogen NuPAGE System,100V电压,压平后换200V,为提高上样量,用的自己制备的10*loading buffer。
...

样品中沉淀太多,离心后上样
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我将X基因分别构建在Invitrogen的pcDNA3.1,还有一个是带Myc标签的,两个载体。

蛋白30kd(分泌蛋白),买的伯乐的胶,配12%的,跑得很开了。伯乐的膜,孔径0.2um转膜350mA,90min(也试过40V,8h,差不
多)。转膜液配方:14.4g Glycine,3g Tris,200ml甲醇。室温用5%脱脂牛奶PBST封闭1h。
一抗(特异抗体购自R&D的和Myc标签抗体购自Invitrogen)6h,洗4*10min;二抗(Santa)3h,洗4*10min。
现在的问题是:
1. 需要很大的上样量(>100ug,用伯乐的染液Bradford测的),少了带出不来
2. 只有表达量很高(瞬转蛋白)的时候才能出带(但效果很好,带很清晰)
3. 试过一抗孵育室温2h,带出不来
4. 都说带标签的western会比较好做,但我做的效果甚至不如特异抗体
5. 好像大家做β-actin的时候一抗室温一个小时,压片的时候5秒钟之内就有很强的带,而我的一般需约1min
怀疑过HRP显色底物,但和别人的比较过,虽然我们的出来没背景带稍弱,但用他们的试了下,有背景也没带。

请问楼主:问题在哪里?该如何改进,才能提高体系的灵敏度啊?

==============================================================================================================

1、100ug蛋白上样量有点大了,一般WB检测时10-20ug总蛋白
2、一抗最好孵育过夜
3、有可能标签抗体不好,或者转染没成功?这几天我在做真核转染的标签IP,效果还不错。如果需要,我可以给你点阳性对照样品(真核或者原核)及想对应的抗体做个对照
4、你的二抗与ECL用的是哪里的?
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417695062 wrote:
我的样品制备好之后,第一次跑电泳之后GAPDH一抗,发光出来,片子上黑的丽春红染的也比较红。但在-70冰箱冻了之后,再跑电泳转膜发光,丽春红染的红的,胶片上反而不那么黑(GAPDH一抗)。如图所示,都是一一对应的。

============

样品降解?
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wood533[使用道具]
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样品降解

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如果样品讲解的话一般是因为什么原因呢?样品降解了有什么特征?谢谢啦~
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jrwyyplt[使用道具]
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我将X基因分别构建在Invitrogen的pcDNA3.1,还有一个是带Myc标签的,两个载体。

蛋白30kd(分泌蛋白),买的伯乐的胶,配12%的,跑得很开了。伯乐的膜,孔径0.2um转膜350mA,90min(也试过40V,8h,差不
多)。转膜液配方:14.4g Glycine,3g Tris,200ml甲醇。室温用5%脱脂牛奶PBST封闭1h。
一抗(特异抗体购自R&D的和Myc标签抗体购自Invitrogen)6h,洗4*10min;二抗(Santa)3h,洗4*10min。
现在的问题是:
1. 需要很大的上样量(>100ug,用伯乐的染液Bradford测的),少了带出不来
2. 只有表达量很高(瞬转蛋白)的时候才能出带(但效果很好,带很清晰)
3. 试过一抗孵育室温2h,带出不来
4. 都说带标签的western会比较好做,但我做的效果甚至不如特异抗体
5. 好像大家做β-actin的时候一抗室温一个小时,压片的时候5秒钟之内就有很强的带,而我的一般需约1min
怀疑过HRP显色底物,但和别人的比较过,虽然我们的出来没背景带稍弱,但用他们的试了下,有背景也没带。

请问楼主:问题在哪里?该如何改进,才能提高体系的灵敏度啊?

fangweibin119 wrote:
1、100ug蛋白上样量有点大了,一般WB检测时10-20ug总蛋白
2、一抗最好孵育过夜
3、有可能标签抗体不好,或者转染没成功?这几天我在做真核转染的标签IP,效果还不错。如果需要,我可以给你点阳性对照样品(真核或者原核)及想对应的抗体做个对照
4、你的二抗与ECL用的是哪里的?

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谢谢你好意,不过我的阳性对照能做的出来,就是需要大量的样品和长时间的抗体孵育, 所以我怀疑wb系统的某个或某几个因素导致灵敏度太低。如何能在更少上样量(如30ug),抗体孵育时间更短的情况下把目的条带做出来? 这就是我想要解决的。
我的二抗是santa c.的, 有驴抗羊,和羊抗鼠的。 ECL是伯乐的。
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wsll[使用道具]
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请问250kd的蛋白,转膜条件是什么? 湿转和干转是什么概念?我用的是1Xtansfer buffer,然后胶完全泡在BUFFER里面转膜,是不是湿转?谢谢~
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wsll[使用道具]
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我不想转膜过夜。。
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