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标题:【讨论帖】western blot问题解答

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你好,我的一抗是Abcam的(ab74734,兔多抗whole serum),二抗Santa,内参博奥森的Beta-actin。目的和内参都做不出,很是着急,不知哪些环节可能有问题。
组织:人心肌组织,目的蛋白是膜蛋白,分子量97KD,用碧云天P0013裂解液提取全蛋白,测浓度20-30mg/ml。
上样量:20微升
电泳仪:Bio-Rad Mini-PROTEAN Tetra
电泳:5%浓缩胶60v、30min,8%分离胶120v、60min(胶用考马斯亮蓝染色后,目的分子量周围条带清晰分明)
转膜:冰浴恒流300mA 60min(0.22的PDVF膜,1.5mm厚胶 转膜后染胶没有条带,染膜隐隐约约有,但不确定是不是)
封闭:碧云天封闭液室温封闭1小时
一抗:碧云天一抗稀释液稀释1:1000(说明书说1:300到1:4000),摇床上4度过夜
内参稀释1:1000(说明书1:1000到1:1500)
洗膜:TBST洗10min*3遍
二抗:碧云天二抗稀释液稀释1:2000,摇床上室温摇1h
洗膜:TBST洗10min*3遍
显色:ECL显色未见荧光,压片10分钟也什么都没有(稀释过的二抗直接加发光剂显影定影没有问题)

请问可能是哪些环节有问题?
1.组织在-80℃放了半年,有无影响?提取蛋白的方法有无问题,膜蛋白能用总蛋白做出来吗?
2.心肌组织是不是不能用Beta-actin作内参?
3.一抗-20℃放了4个月,期间一共就冻融过3次,会不会已经失效,如何验证?
4.转膜条件有无问题?转膜液配方:Tris 3g,甘氨酸14.4g,甲醇200ml,SDS 1g,加水至1000ml,有无问题?
5.Beta-actin和GAPDH 适合的转膜条件是多少?

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1、先检测内参吧,别折腾目的蛋白了。我看了下,这个蛋白做的人很少。
2、心肌组织我们不用actin做内参,我们用tubulin或者GAPDH
3、冻融3次,不会失效
4、转膜没问题,把SDS浓度调整到0.01%
5、湿转,恒流 300mA,30-50min
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老师好,我又来提问啦,我做的是运动对骨骼肌信号通路的影响,运动刺激包括中等、大强度运动,最近我想把内参从beta-actin改成GAPDH,但我犹豫的一点是:GAPDH在肌肉中的表达量是否受运动影响?它是糖代谢中的一种关键酶,那我们的试验中,大鼠进行不同强度运动时,或多或少会影响到骨骼肌糖代谢,那么会影响到GAPDH的表达量吗?我担心,我的内参的不一致不是因为定量不均引起的,而会是运动强度引起的。

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可以用GAPDH或者beta-tubulin呢
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老师你好,请问一抗可以重复使用么?可以的话最多使用几次?

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可以重复使用
但是具体重复几次不同抗体均不同,无任何参考
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老师麻烦帮忙分析下原因!最近在做分子量为115的磷酸化蛋白和非磷酸化蛋白的WB,一般是先显磷酸化蛋白,然后strip,重新封闭孵育抗体再显非磷酸化蛋白。步骤如下:
1.配制10%的分离胶,再灌注5%的分离胶。
2.预电泳30V 10分钟,电泳时间先用60v的跑,待mark分开之后再用80v的跑个120分钟左右待溴酚蓝跑到底部。
3.再200mA转膜120分钟(恒流,冰浴)。最后一般mark也会转过来。
4.转膜后用5%的BSA四度封闭20小时左右(封闭时间略长应该没问题的吧)。
5.5%的BSA孵一抗1:1000(按cst推荐比例)过夜,TBST漂洗10min×3次
6.5%的BSA二抗浓度1:5000(按说明书),室温轻摇60-70分钟,TBST漂洗10min×3次。
8.ECL曝光。
9.然后strip6小时或过夜,重新用5%脱脂奶粉封闭,孵非磷酸化蛋白的一抗,再孵二抗显影。
0.45um的pvdf膜
最后的结果如图背景很深,做了几次都是这样,到底是什么原因呢,抗体都是只有一次的,都不敢回收用,全都买的cst的抗体

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二抗用1:10000
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老师您好,我做WB转膜的时候经常碰到这种问题,Marker在跑电泳的时候都很正常,很直,但是转膜后却出现了问题,观察到的Maker转花掉了,然后上抗出现的就是这样的条带,我的转膜条件是300mA,1h
这个到底是什么问题呢!。我做WB失败的只有这一步了。。。。非常感谢

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有蛋白考马斯亮蓝染胶图吗?
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1、内参条带如何?
2、目的蛋白的一抗孵育建议4度过夜

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内参条带很清楚,背景清晰。目的蛋白是4度过夜的。然后我又做了一个目的蛋白,46KD(内参43KD),有条带,很清 晰。但是之前的两个蛋白(一个71KD,一个68KD),都没有条带。
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有个COIP跑出来的条带问题想问一下楼主,下面上图
在2A拉的泳道中均出现了泳道黑的情况,这可能是什么原因呢?开始怀疑蛋白没煮散,所以加多LB和增加煮的时间,但是没什么效果


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2013-4-3 09:57
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QUOTE:
原帖由 any333 于 2013-4-3 09:57 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
有个COIP跑出来的条带问题想问一下楼主,下面上图
在2A拉的泳道中均出现了泳道黑的情况,这可能是什么原因呢?开始怀疑蛋白没煮散,所以加多LB和增加煮的时间,但是没什么效果 ...

看上去好像是电泳时没浓缩好,浓缩胶是不是太短了?导致分离效果不好。
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楼主,您好,我现在做的蛋白里有184KDa,100KDa,52KDa,还有内参是GAPDH,分子量才35KDa,请问我是否可以在一板胶里跑开这些蛋白,什么浓度最合适,如果实在不行,分成两种浓度的胶跑,最后可以放在一起分析吗?比如184,和100的用低浓度跑,52和内参高浓度跑,最后的结果可以一起分析吗?

还有就是184这么大的蛋白,转膜多久可以转上呢?谢谢楼主
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请教老师:
我的目标蛋白越40kD,10%的胶。电泳80V跑30min,在100跑90min。转膜恒流80mA 90min,电泳液和转膜液都是新配的,用的是普利莱公司的10×浓缩液。甲醇现加。
膜用的是PVDF膜,转完膜后5%脱脂奶粉封闭1h。
加一抗。β-actin用的是碧云天的,抗体及抗体稀释液。1:1000稀释
其他的一抗用的是abcam公司的,用封闭液稀释。这次用的是1:200稀释的。
TBST用的是普利莱公司的10×封闭洗涤缓冲液。
一抗袋4℃ 静置过夜,第二天拿出来再室温摇床1h。
一抗孵育完后再TBST中洗三次,每次20min
二抗用的是碧云天的HRP山羊抗鼠。1:1000用TBST稀释。
室温摇床1h。
再用TBST洗三次,每次20min。

结果是这样的:目标蛋白大小24kd左右 但是抗体说明书上说会在43kd左右观察到条带。


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