小中大楼主你好,我最近在做western-blot,样本是猪的肠道黏膜,现在有个220kDa大小的ZO-1蛋白一直没做出来,现将我的实验条件跟你说明一下,望楼主指点一下:
1、样品制备:裂解液配方50mM Tris-HCl 7.4,150mM NaCl,1% IGEPAL GA-360,0.5% Sodium dexycholate,0.5% SDS,10mM 焦磷酸钠,1% Triton-X 100,样品采集后于-80度保存,裂解时采用液氮研磨后以1:9比例加入裂解液(使用时加入PMSF和cocktail)于冰上裂解30min,期间进行旋涡振荡数次,12000r/min-4度离心,收集上清,分装保存于-80度冰箱,上样前调整蛋白浓度后,以1:4比例加入5X上样缓冲液95度-5min变性,上样量为20ug
2、电泳条件:8%分离胶-5%浓缩胶,80V-20min,120V-1h;转膜:冰上湿转200mA-2.5h,染胶后胶上已经看不到蛋白条带
3、封闭:3%BSA室温封闭1h
4、抗体:ZO-1(santa兔抗和羊抗)、zymed(兔抗),3%BSA稀释:1:1000、1:500,1:250(3种比例都尝试过),4度过夜;二抗(兔抗和羊抗)1:3000,3%BSA
图1
图1是三种抗体,不同裂解液裂解的样品:配为上述裂解液配方裂解,NP-40、中和弱为碧云天裂解液
zymed有淡淡的条带,但不在220kDa位置
图2
图2是采用zymed兔抗的结果,但条带依然不在220kDa位置
本人的疑问:
1、样品裂解问题:ZO-1属于外周膜蛋白,是不是样品裂解时间不够,还是裂解过了,ZO-1蛋白降解成亚基了,不是是没有裂解出来还是裂解过头了,
2,抗体问题:我这种裂解方法做其它蛋白都没问题,有100多kDa的也没问题,目前就这个蛋白很头大,以前我师妹做出来过一次(图3如下)
图3-santa兔抗
图4-zymed兔抗
样品是猪肠上皮细胞样,有进行超声(3s-10次-4度),而我也有作过一次超声裂解的,
如图5
现在真搞不清是什么问题,我师妹细胞样能做出来,但以前我的细胞样也没做出来过,还烦请楼主帮忙分析一下原因,谢谢
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ZO-1我也做过,没做出来
可能表达量小或者抗体没有特异性