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标题:【讨论帖】western blot问题解答

junjie05[使用道具]
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这种现象正常的
不能在-20度保存提取的蛋白样品
需要用-80度冰箱或者液氮

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这里有个问题就是保存在-80度冰箱的蛋白样品再拿出来上样的时候,是直接室温融化?还是37度快速溶一下?前提是蛋白样品已经变性用loading buffer保存了。
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ukonptp[使用道具]
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调整二抗至1:10000
孵育时间:30min
室温
洗膜:3min,5-6次

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多谢,尝试之后得到结果,再向老师讨教。
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IAM007[使用道具]
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正在做人白细胞Rho 激酶活性 即利用Western 检测MYPT-1,做了好几次都没结果。
6%的胶(目的蛋白 130KD 内参β-actin 42KD) 电泳90分钟,BIO-rad湿转 2小时 260ma ,一抗 1:300-500都试过(santa公司的 推荐 1:100-1000)孵育过夜,摇床复温2h, 二抗 1:5000-10000(推荐 1:5000-100000) 孵育2h,ECL发光,除目的蛋白有些非特异性的发光外(很少),内参一片空白,请老师解惑。
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请问楼主及各位有识之士,为什么我的蛋白条带跑成这样,是铂丝没洗干净吗?


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最近在做肾组织MCP-1的western,分子量12kd,用15%的分离胶,santa的一抗,都做到1:100了,还是没有带,只有背景。有没有做过这个蛋白的同道给指点一下迷津,还有如果要换一抗的话,有没有哪家公司的一抗可以推荐一下?谢谢。
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楼主你好,我最近在做western-blot,样本是猪的肠道黏膜,现在有个220kDa大小的ZO-1蛋白一直没做出来,现将我的实验条件跟你说明一下,望楼主指点一下:
1、样品制备:裂解液配方50mM Tris-HCl 7.4,150mM NaCl,1% IGEPAL GA-360,0.5% Sodium dexycholate,0.5% SDS,10mM 焦磷酸钠,1% Triton-X 100,样品采集后于-80度保存,裂解时采用液氮研磨后以1:9比例加入裂解液(使用时加入PMSF和cocktail)于冰上裂解30min,期间进行旋涡振荡数次,12000r/min-4度离心,收集上清,分装保存于-80度冰箱,上样前调整蛋白浓度后,以1:4比例加入5X上样缓冲液95度-5min变性,上样量为20ug
2、电泳条件:8%分离胶-5%浓缩胶,80V-20min,120V-1h;转膜:冰上湿转200mA-2.5h,染胶后胶上已经看不到蛋白条带
3、封闭:3%BSA室温封闭1h
4、抗体:ZO-1(santa兔抗和羊抗)、zymed(兔抗),3%BSA稀释:1:1000、1:500,1:250(3种比例都尝试过),4度过夜;二抗(兔抗和羊抗)1:3000,3%BSA
图1

图1是三种抗体,不同裂解液裂解的样品:配为上述裂解液配方裂解,NP-40、中和弱为碧云天裂解液
zymed有淡淡的条带,但不在220kDa位置
图2

图2是采用zymed兔抗的结果,但条带依然不在220kDa位置
本人的疑问:
1、样品裂解问题:ZO-1属于外周膜蛋白,是不是样品裂解时间不够,还是裂解过了,ZO-1蛋白降解成亚基了,不是是没有裂解出来还是裂解过头了,
2,抗体问题:我这种裂解方法做其它蛋白都没问题,有100多kDa的也没问题,目前就这个蛋白很头大,以前我师妹做出来过一次(图3如下)
图3-santa兔抗

图4-zymed兔抗

样品是猪肠上皮细胞样,有进行超声(3s-10次-4度),而我也有作过一次超声裂解的,
如图5

现在真搞不清是什么问题,我师妹细胞样能做出来,但以前我的细胞样也没做出来过,还烦请楼主帮忙分析一下原因,谢谢

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ZO-1我也做过,没做出来
可能表达量小或者抗体没有特异性
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正在做人白细胞Rho 激酶活性 即利用Western 检测MYPT-1,做了好几次都没结果。
6%的胶(目的蛋白 130KD 内参β-actin 42KD) 电泳90分钟,BIO-rad湿转 2小时 260ma ,一抗 1:300-500都试过(santa公司的 推荐 1:100-1000)孵育过夜,摇床复温2h, 二抗 1:5000-10000(推荐 1:5000-100000) 孵育2h,ECL发光,除目的蛋白有些非特异性的发光外(很少),内参一片空白,请老师解惑。

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1、样品跑完电泳后用考马斯亮蓝染过胶吗?
2、转膜后,用丽春红染过膜吗?
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这里有个问题就是保存在-80度冰箱的蛋白样品再拿出来上样的时候,是直接室温融化?还是37度快速溶一下?前提是蛋白样品已经变性用loading buffer保存了。

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放在冰上融化
如果加了loading buffer处理的
可以-20度保存,不会出现沉淀。
如果是蛋白样品,没变性处理的是不行的
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请问楼主及各位有识之士,为什么我的蛋白条带跑成这样,是铂丝没洗干净吗?

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胶的问题
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最近在做肾组织MCP-1的western,分子量12kd,用15%的分离胶,santa的一抗,都做到1:100了,还是没有带,只有背景。有没有做过这个蛋白的同道给指点一下迷津,还有如果要换一抗的话,有没有哪家公司的一抗可以推荐一下?谢谢。

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这个蛋白我好像做过
cuturl('http://www.abcam.com/mcp1-antibody-ab25124.html')
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