蛋白质与蛋白组学 » 讨论区 » 经验共享 » 【讨论帖】SDS-PAGE电泳求助专用帖

采购询价

点击提交代表您同意 《用户服务协议》 《隐私政策》

 
需要登录并加入本群才可以回复和发新贴

标题:【讨论帖】SDS-PAGE电泳求助专用帖

ukonptp[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 103464
精华 5
积分 796
帖子 992
信誉分 110
可用分 5846
专家分 50
阅读权限 255
注册 2013-1-11
状态 离线
361
 
请教版主个问题:
我用的是5%浓缩胶,12%分离胶,恒流,25mV浓缩胶,40mV分离胶。5*loading buffer(0.313M Tris-HCl pH 6.8,10% SDS, 0.05% bromophenol blue, 50% glycerol 0.5M DTT),
Fermentas预染marker。为什么我的marker最后一条11KD带总跑不出来,溴酚兰总和17KD的带在一个水平???
望指教,谢谢!!!

======================================================================

我们前一阶段也遇到类似的问题,你可以把分离胶调整一下,10-15%之间,看看能不能跑出来。
溴芬兰与17KD在一条线上,说明二者没有完全分开,可以提高胶的浓度。
顶部
ukonptp[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 103464
精华 5
积分 796
帖子 992
信誉分 110
可用分 5846
专家分 50
阅读权限 255
注册 2013-1-11
状态 离线
362
 
请教楼主:
我最近跑电泳浓缩胶很好,到分离胶后溴酚蓝在前沿有扩散,是为什么呢?电压小了吗?浓缩胶是60V,分离胶是120V。

=====================================================

应该是弥散吧?这一般是由于分离胶缓冲液pH不准造成的,建议调整一下!
顶部
ukonptp[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 103464
精华 5
积分 796
帖子 992
信誉分 110
可用分 5846
专家分 50
阅读权限 255
注册 2013-1-11
状态 离线
363
 
楼主好啊!
我最近碰到了一个难题,我的胶现在怎么也跑不下来,我的marker 下面有26和20KD的,但是最多能够跑道三分之二左右,就怎么也跑不下来了,我的溴芬兰几乎都快跑出去了,急!
谢谢了!

=============================

分离胶浓度偏大,建议用低浓度的试试
顶部
ii077345[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 108893
精华 0
积分 247
帖子 193
信誉分 100
可用分 1734
专家分 0
阅读权限 255
注册 2013-5-15
状态 离线
364
 
我是新手,目前正在做蛋白质,我现在碰到的问题在你的文章里说了,也就是电压高,但电流却很低,我用的是10%的分离胶,5%的浓缩胶,电压为80V,但电流只有5mA,120V跑浓缩胶时,电流也只有5mA,跑了10个多小时,你罗列了那么多的原因,我只符合一条,那就是没有把那跟塑料条拔掉.但我们这里也有其他的人不拔塑料条,但他们的电流却比我的要高
顶部
plaa[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 77350
精华 0
积分 464
帖子 588
信誉分 100
可用分 3778
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-16
状态 离线
365
 
“我的Marker是七条带的,最小的分子量是14.4KDa,可是每次第七条带都跑不出来,不知什么原因。我要的目的带约17KDa,我提的蛋白中也出不来,是我提的蛋白的事?请帮我分析一下,谢谢"
您建议我用10~12%分离胶的浓度,跑跑看
但是我的Marker建议用15%的分离胶,浓缩胶是5%的。而且我师姐摸的条件,她做出来了。麻烦你。
顶部
ukonptp[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 103464
精华 5
积分 796
帖子 992
信誉分 110
可用分 5846
专家分 50
阅读权限 255
注册 2013-1-11
状态 离线
366
 


QUOTE:
原帖由 ii077345 于 2013-6-28 14:22 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
我是新手,目前正在做蛋白质,我现在碰到的问题在你的文章里说了,也就是电压高,但电流却很低,我用的是10%的分离胶,5%的浓缩胶,电压为80V,但电流只有5mA,120V跑浓缩胶时,电流也只有5mA,跑了10个多小时,你罗列了那么多的 ...

1.如果你制胶的时候是用硅胶条来封闭的话,是一定要去掉的,否则电流无法形成通路。
2.如果硅胶条已经去掉,电压很高,而电流很低的时候,大多就是电泳液少了,同样不能形成电流通路,或通路不好。检查一下内槽或外槽液,是否分别淹没加样孔或电极。
顶部
ukonptp[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 103464
精华 5
积分 796
帖子 992
信誉分 110
可用分 5846
专家分 50
阅读权限 255
注册 2013-1-11
状态 离线
367
 


QUOTE:
原帖由 plaa 于 2013-6-28 14:23 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
“我的Marker是七条带的,最小的分子量是14.4KDa,可是每次第七条带都跑不出来,不知什么原因。我要的目的带约17KDa,我提的蛋白中也出不来,是我提的蛋白的事?请帮我分析一下,谢谢"
您建议我用10~12%分离胶的浓度,跑跑看
但是 ...

没有问题的,试验条件做相应的调整,这是很正常的事,关键是结果是否正常。另外你师姐做的很正常,你也可以和他交流一下,毕竟在论坛上讨论的都是大家比较常见的错误,可能针对性差些。如果再有新的问题再讨论。
顶部
831226[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 79782
精华 0
积分 770
帖子 1240
信誉分 100
可用分 6976
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-12-15
状态 离线
368
 
分离胶浓度偏大,建议用低浓度的试试

=================================================================================================

我的目的蛋白不是二十几,我的蛋白是五六十KD的,但是我觉得我的二十几的marker 不能跑下来的话,我的蛋白就不能保证完全跑开。
不是分子量越小,应该跑更大浓度的胶吗?
顶部
我佛慈悲[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 74054
精华 0
积分 188
帖子 135
信誉分 100
可用分 1401
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-4
状态 离线
369
 

请教一下

日前做western,66kd的蛋白,用的5%浓缩胶,12%的分离胶,电泳80~120V,2.5小时,转膜是用的半干法,电流=膜长度(cm)*膜宽度(cm)*1.56
,时间1小时。但是结果不理想,估计是转膜的问题,请问用什么样的转膜条件比较合适呢?
顶部
dog002[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 76386
精华 0
积分 916
帖子 1452
信誉分 100
可用分 8133
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-4
状态 离线
370
 
请教一下

目前我在做目标为5000左右的多肽电泳,采用的是Tricine-SDS-PAGE方法。
我想要的多肽一直都跑不出来,甚至配好的标准品(5mg/ml)都跑不出来。
用该方法跑分子量在1.4KD,2KD的样品,都可以跑出清晰的条带。
因为这个方法尝试了好多次,我怀疑是不是标准品在反复冻融的过程中降解了?
另外还有一个奇怪的现象,我的溴芬兰跑的太快了,往往不到60min中就跑到头了
顶部