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标题:【讨论帖】SDS-PAGE电泳求助专用帖

箭头儿[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 dog002 于 2013-6-28 15:02 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
请教一下

目前我在做目标为5000左右的多肽电泳,采用的是Tricine-SDS-PAGE方法。
我想要的多肽一直都跑不出来,甚至配好的标准品(5mg/ml)都跑不出来。
用该方法跑分子量在1.4KD,2KD的样品,都可以跑出清晰的条带。
因为这个 ...

5000多的多肽确实不好跑出来,不知道你用的是多大浓度的胶?我建议你用15%的分离胶。反复冻溶使样品降解的可能性也有,但我认为你的样品中的可能存在的蛋白酶对其降解作用更大。溴芬兰跑的太快可能是因为电压过高,电泳速度过快了。
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dog002[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 箭头儿 于 2013-6-28 15:03 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')



5000多的多肽确实不好跑出来,不知道你用的是多大浓度的胶?我建议你用15%的分离胶。反复冻溶使样品降解的可能性也有,但我认为你的样品中的可能存在的蛋白酶对其降解作用更大。溴芬兰跑的太快可能是因为电压过高,电泳速 ...

我用的就是15%的胶阿。我的分离胶上是有跑过的痕迹的,但是就是没有条带。我现在觉得问题就是出在电泳条件和样品上。我每次只跑2h,恒流20mA是否有可能多肽已经跑出去了?
如果真是被降解了,应该加什么样的蛋白酶抑制剂?主要是以前没做过蛋白
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cj_mondy[使用道具]
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谢谢各位的建议:
1 浓度问题:我想应该不是。我冻干后用500ul的水溶(过去至少5毫升,BCA法测蛋白浓度是400ug/ml),取了30ul上样。
2 样品处理问题:我是煮沸3分钟,加了10ul的上样缓冲液,离心(10000rpm 3分钟)后上样
3 小蚁个问的问题:我是由海洋动物中提取的蛋白,是用50%的丙酮沉淀出来的,然后用PBS 复溶的。然后再上SEPHADEX G-75,分离的不同峰。然后再跑电泳。
我想其中应该有多种蛋白啊,分子量也就无法判断了!
望各位再帮忙!
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我以前做的SDS-PAGE都没问题,今天却发现样品在浓缩胶(80V)里不能压缩成窄的条带,而是很宽很宽。直到进入分离胶用100V电压才慢慢压成一条线。请问是什么原因?我的buffer都是按要求配的,浓缩胶pH6.8,分离胶8.8啊。另外,我的loading buffer里没加DTT,可以吗?谢谢!
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我的目的蛋白不是二十几,我的蛋白是五六十KD的,但是我觉得我的二十几的marker 不能跑下来的话,我的蛋白就不能保证完全跑开。
不是分子量越小,应该跑更大浓度的胶吗?

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不知道你是用多大的分离胶来跑的,从你描述的现象来看,应该是蛋白分子量大小与分离胶的浓度不相适应造成的。
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请教一下

日前做western,66kd的蛋白,用的5%浓缩胶,12%的分离胶,电泳80~120V,2.5小时,转膜是用的半干法,电流=膜长度(cm)*膜宽度(cm)*1.56
,时间1小时。但是结果不理想,估计是转膜的问题,请问用什么样的转膜条件比较合适呢?

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转膜出现了什么问题呢?说的详细一点,看看能不能帮上您。
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我用的就是15%的胶阿。我的分离胶上是有跑过的痕迹的,但是就是没有条带。我现在觉得问题就是出在电泳条件和样品上。我每次只跑2h,恒流20mA是否有可能多肽已经跑出去了?
如果真是被降解了,应该加什么样的蛋白酶抑制剂?主要是以前没做过蛋白

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看看溴芬兰是否跑出去了呢?其分子量要比你的目标蛋白小,保证他没跑出去,应该没有问题的。可能的话,把你图贴上来看看。
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NBA[使用道具]
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谢谢各位的建议:
1 浓度问题:我想应该不是。我冻干后用500ul的水溶(过去至少5毫升,BCA法测蛋白浓度是400ug/ml),取了30ul上样。
2 样品处理问题:我是煮沸3分钟,加了10ul的上样缓冲液,离心(10000rpm 3分钟)后上样
3 小蚁个问的问题:我是由海洋动物中提取的蛋白,是用50%的丙酮沉淀出来的,然后用PBS 复溶的。然后再上SEPHADEX G-75,分离的不同峰。然后再跑电泳。
我想其中应该有多种蛋白啊,分子量也就无法判断了!
望各位再帮忙!

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400ug/ml是层析前的浓度还是层析后的浓度?
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xue258[使用道具]
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层析前为5mg/ml ,400是层析后
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tie8[使用道具]
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请问:Tricine-SDS-PAGE与SDS-PAGE的区别是否只在二者的电极缓冲体系不同?在胶的配方以及实验方法上则是一样的?
谢谢!
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