小中大1、在文献中看到,对同一个基因,不同的人会用不同的微卫星标记(STR),一个候选基因的STR会有多少,按要做连锁来说,选择的STR越接近候选基因越好。请问我怎样才能选到候选基因附近的STR做连锁呢?一个候选基因一般选几个候选基因好。
2、按您的做法,我在UCSC中查找RHO基因,跳出的界面(cuturl('http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?position=chr3:130730172-130736877&');hgsid=114279453&knownGene=pack&hgFind.matches=uc003emt.1,)有很多的rs号,可没看到STR号。
3、本人也在NCBI MapViewer上点击相应的染色体号(如3号染色体),跳出的图中并没有Marker,而在此(NCBI MapViewer)检索界面输进 D3S3606时就有Marker号,但有很多文献报道都没有的,要直接输进文献中STR号找才行。命名也很多不同(如SHGC-148920,WIAF-2146),文献中多用D?S?形式。
4、所以,还是再次请问:应该如何去找到某一基因(如RHO,3q22.1 )附近的STR呢,本人新手正想做连锁分析,还望各位前辈包容这就话题~希望各位前辈赐教,不胜感激,热切期待中~