小中大可以用western测NF－kB的激活啊，但是测的时候检测的是NF－kB的入核量和IkB的活化。见过用western检测NF－kB的激活过程的英文文献。
EMSA和luicifence也都可以啊。
另外觉得，western是检测的NF-kB入核，EMSA是检测的NF－kB与DNA的结合能力，荧光素酶双报告基因检测的是NF-kB的反式激活能力。这3个实验是从三个不同的角度来检测NF-kB的激活的，一起做最能说明问题，但是不能说谁好谁不好。
另外反对hwclove的说法“2.western blot： 这个抗体应该用磷酸化的P65抗体，，因为只有磷酸化的蛋白才具有活性，你要是有钱的话，可以连总蛋白和磷酸化蛋白一起做，比较完善。”
这个说法我觉得是错误的，P65的磷酸化现在检测出至少有6个位点，不同的刺激都可能会产生不同的一个或者多个位点磷酸化，磷酸化只能说会加强活化，对于NF-kB来言，不能说只有磷酸化的才激活，即使磷酸化不能入核也是没用的。磷酸化只是起到辅助说明的激活的作用，P65不同于胞浆内的其他蛋白，能否入核对于P65才是最重要的。大部分文献报道的时候，都只用的是非磷酸化的P65检测入核的情况来说明问题的。
另外有看过些文章报道，NF-kB由于会导致IkB的转录，刺激过后一段时间激活的NF-kB会被新生成的IkB抑制掉。但是也见过在某些疾病的报道中NF-kB持续性激活。由于看文献有限，不知道你的稳转细胞会怎么样。
