Nat Genetics:发现胃癌新基因

近日由来自杜克-新加坡大学医学研究院和新加坡国立癌症中心的研究人员领导的一个国际小组在新研究中利用先进的测序技术对胃癌患者的基因突变进行了筛查,由此发现了数百个新基因突变,并证实其中的FAT4 和ARID1A基因分别在5%和8%的检测样本中存在突变。相关研究成果发表在4月8日的《自然遗传学》(Nature Genetics,)杂志上,从而为开发个体化胃癌治疗新策略铺平了道路。

胃癌是人类健康的最大威胁,全球肿瘤中8%的发病率和10%的死亡率由其引起,是排名第二位的癌症死亡原因,这一疾病在东亚地区尤为常见。由于早期胃癌无明显症状,大多数患者就诊时已到中晚期,且目前对于胃癌的致病原因仍了解甚少,因此导致治疗并不理想。

“直到现在,对于引起胃癌的遗传异常仍知之甚少,这也是导致总体治疗效果不佳的一个重要原因,“文章资深作者、杜克-新加坡大学医学研究院癌症与干细胞生物学计划副教授Patrick Tan说。Tan还是新加坡国立癌症中心基因组肿瘤学计划负责人、新加坡基因组研究所研究组负责人。

在这篇文章中,研究人员利用最先进的DNA测序技术分析了来自15位胃癌患者的肿瘤和正常组织,由此发现了数百个新的基因突变。

“该技术使得我们能够读取每个癌症基因组的基因DNA序列。这项研究是由基础科学家和临床医生组成的一个大型研究团队共同协作的结果,”杜克-新加坡大学医学研究院计算机系统生物学和人类遗传学实验室主任Steven G. Rozen博士说。

Teh 说:“这是首个在单核苷酸水平上调查绝大多数人类基因的胃癌研究。我们对1.8万个人类基因进行了筛查,由此鉴别出了600多个从前未知的胃癌基因突变。”

在这600多个与胃癌相关的基因中,FAT4 和ARID1A基因引起了研究人员的特别关注。在针对约100个胃癌进行的进一步分析结果表明这两个基因分别在5%和8%的胃癌中存在着突变。在某些患者中发现了包含着两个基因的染色体部分缺失,从而提供了更一步的数据表明胃癌中频繁发生了这些基因的遗传缺陷。

实验室实验证明这两个基因对驱动胃癌发生起重要作用,当研究人员对FAT4 和 ARID1A功能进行操控时改变了胃癌细胞的生长状况。

“还需要更多的研究来了解这些研究发现的临床意义。ARID1A 和FAT4也有可能参与了多种其他类型的癌症,而并非仅是胃癌,”Tan指出。目前Tan的研究人员正在积极开展研究工作致力将这些研究成果转化为临床应用。  

每年全球约有超过10万的胃癌新增病例有可能是因为FAT4或 ARID1A突变引起,针对这些靶标的药物或可在某天导致胃癌和其他类型癌症治疗更有效。

(生物通:何嫱)


    新华网华盛顿4月9日电(记者任海军)一个国际研究团队日前报告说,他们利用最新DNA(脱氧核糖核酸)测序技术,确认两个基因变异与胃癌具有较强关联。

    美国杜克大学等机构的研究人员分析了胃癌患者癌变组织和正常部位的组织。他们筛选1.8万个基因后在胃部癌变组织中发现了600多个此前未知的基因变异,其中两个基因FAT4、ARID1A发生变异与胃癌关联性最强。

    在一些胃癌患者中,包含这两个基因的染色体片断甚至消失,这进一步表明,影响这两个基因的遗传缺陷在胃癌患者中可能比较常见。研究人员还在实验中发现,调控这两个基因的功能能影响胃癌细胞的生长。

    相关研究报告已发表在《自然·遗传学》杂志网络版上。研究人员表示,这项研究的临床意义还需要更多研究加以证实。他们推测这两个基因可能与多种癌症相关。

    统计数据显示,胃癌是全球第二大癌症,全球每年约有70万人死于胃癌。胃癌难以治愈,原因在于其很难被早期发现。在美国,接受治疗的胃癌患者5年生存率不超过25%。