小中大我选的内参是PRL-TK,上次做冻融40多分钟,出来的结果达到上千万,PGL-control更是overload,可今天由于客观原因,不得已细胞裂解后冻了3个多小时,结果目的质粒检测只有几百,和阴性对照差不多,而内参和阳性对照也只有几万了,很是不解啊,预试验时这个目的质粒是上过几万的啊,自己分析原因如下,请各位指教:
1.转染效率低或失败,因为转染时细胞在6孔板内长得很满,完全超过90%,图省事,转染前没有仔细计数,教训啊?不过奇怪的是,内参居然还有几万?
2.冻融时间过长?-80度冻3-4个小时会对蛋白活性产生明显影响吗?觉得蛋白没这脆弱吧。不解。
3.LAR失活?千万别是这条,以前使用时不熟练,LAR配好后没有分装,今天实验时才分装,总共冻融过3次,平时都是-80度保存的。看说明书好像说过冻融超过3次LAR活性会大损,现在分装好了-80度避光保存着。
请各位帮我分析下,谢谢!
发完贴,发现5.1了,祝各位节假日仍奋斗在实验室,为实验夜不能寐的难兄难弟致以节日问候!!
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1.“内参居然还有几万”,以前是多少?看看目的质粒和内参的比值是否稳定。比如,以前目的质粒几万,而内参上千万;而现在目的质粒几百,而内参几万,则属正常。值都降低了,问题应该出在转染和表达上。根据你的描述,感觉很可能问题在转染,转染效率降低了。
2.冻融时间长短对luciferase活性影响不大,关键在于冻融次数,说明书上写得很明确,建议再仔细看看。我记得细胞裂解液在-80能保持活性几个月吧,反正是很长时间。
3. LAR失活:很可能。不过我没有遇到过,每次都是按说明书使用的,分装后存于-80
希望能对你有帮助,我做启动子有一段时间,也不太顺利啊。共勉!