转帖 LCQ DecaXP 二硫键定位

产品名称:LCQ Fleet离子阱液质联用仪   文章类型:导用/使用体会/维护技巧

二硫键定位分析

蛋白理论分子量为M1,有n各半胱氨酸:
1 )直接测定蛋白的分子量,得到Mw-2x,然后用DTT将全部二硫键打开得到M1
x即为该蛋白含有的二硫键的个数

2 )将蛋白利用4-VP处理得到分子量MW+105y,y即为该蛋白含有的游离半胱氨酸个数,x+y=n

3 )将该蛋白利用合适的酶进行酶切(trypsin,chymotrypsin...),联用分析
得到肽谱,计算理论上出现的肽段以及实际得到的肽断.

4 )将酶解得到的多肽混合物用DTT将全部二硫键打开,联用分析,与3得到的肽断混合物比对,计算出现的新肽断,则二硫键位于新出现的肽断之间

5 )如果一个肽断上有两个cys,则需要先利用4-vp处理蛋白,然后酶解,DTT还原,将目标肽断进行MS3分析,即得到同一肽断上那各cys以二硫键的形式存在

6 )如果两个disulfide交叉,则需要利用分部还原,多用TCEP。

7 )常用还原二硫键的试剂DTT,TCEP, 常用还原衍生Cys上的巯基的试剂4-vp等。