液质联用

产品名称：LTQ XL增强型线性离子阱质谱仪   文章类型：产品提问

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各位朋友，在下对质谱不甚了解。但是正急于确定用LC-ESI-MS/MS（LTQ）来鉴定并定量细菌分泌的代谢小分子的一些办法。有些问题需要你们的帮助。

我们的仪器是Finnigan的2D LC-ESI-MS/MS （LTQ），反相柱好像是C18氨基柱，只能用NH4Cl这一种盐。不知道哪位有没有什么好的洗脱缓冲液和条件。

另外，ESI-MS/MS （LTQ）往往是用来监测蛋白质的多肽片断的，不知道如果要使用于小分子的鉴别，质谱的参数设置应该是多少。

十分感谢！

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我还算比较熟悉THERMO的LTQ，鉴定小分子化合物与多肽对仪器来说没有根本的区别，主要不同在于多肽在MS/MS中是遵循一定的裂解规律分裂的，从而我们可以通过和数据库的比对，我们可以鉴定多肽或者蛋白。

但是小分子的裂解完全根据化合物结构，从而我们可以推断结构。
当然质谱提供的信息是有限的，需要和其他手段结合。比如核磁、红外。

第二，在于多肽在ESI之中离子化后，都是带两个以上的电荷，但是小分子一般只带一个。所以在选择参数的时候需要当心，特别是设置DATA-DEPENDENT模式，需要特别注意。

对于在C18柱上的洗脱条件，一般来说我们可以借鉴LC-UV上的条件，你可以从文献上找到相关的文章，但是注意的是：一般磷酸盐缓冲液和其他不能挥发的盐不能用在LC-MS的流动相。一般我们根据PH的需要选择，甲酸铵(小于20mM)，乙酸铵(小于20mM)，甲酸(0.1-1%)，乙酸(0.1-1%)，TFA(小于0.01%)。有机相用乙腈或者甲醇。

需要注意的方面很多，最好还是看一些书和相关的文献，再使用仪器，否则会带来很多问题，或者会损坏仪器。