小中大在电镜下可以看到大多数情况下内质网是一种片层状结构，当然也有网管状和囊泡状结构（这些主要位于ER的出口位点），ER内部可能没有特殊的骨架结构，但ER可能与细胞骨架交织或贯穿在一起，我们可以从一些荧光照片中看出细胞骨架和ER在细胞中的分布区域是重叠的。如果你有兴趣的话，研究一下细胞内这些成分的空间布局估计可以发一些质量较高的文章。方法很简单，只要用不同的标记技术（如免疫荧光、酶标记）同时标记，显示微丝、微管、中间纤维、内质网和高尔基体的空间分布，进行图像三维重建即可得到结果，多找几类细胞甚妙，有良好的数学功底会有所帮助。
近年来细菌的细胞骨架也是细胞领域内一个有趣的话题，我见过一些较好的文章。估计线粒体、叶绿体中也有类似于细菌细胞骨架的成分，这对于维持其形态和功能可能是必需的，用已知的细菌骨架研究结果（DNA序列或蛋白）去研究线粒体或叶绿体中对应的成分，估计也可以发表质量很高的文章。
