第三代DNA测序技术获突破

来自华盛顿大学的研究人员发表了题为“Reading DNA at single-nucleotide resolution with a mutant MspA nanopore and phi29 DNA polymerase”的文章,报道了第三代DNA测序技术新机制——纳米孔检测核酸碱基数增加至20-30个,这将激化目前纳米孔测序技术市场竞争,相关成果公布在Nature Biotechnology杂志上。

这一纳米孔检测设备十分简单,而且易于携带,它不需要完整的显微设备,也不需要高功率仪器,唯一需要注意的就是实验细节。不难想象在未来几年里,纳米孔成像技术将对DNA测序,以及其它医学应用产生巨大的影响。

第三代测序技术是基于纳米孔的单分子读取技术,这种方法读取数据更快、有望大大降低测序成本,改变个人医疗的前景。这一技术的研发是系统工程,涉及生物、半导体、计算机、化学、光学等多个领域,需要不同学科顶尖力量的合作。目前市场上已经出现了相关产品。

比如近期Oxford Nanopore Technologies(以下简称Oxford)发布了两款DNA测序仪,高通量的GridION单元和U盘大小的便携式MinION单元。

Gordon Sanghera现任Oxford Nanopore的CEO。他表示:“我们设计的MinION和GridION系统具有一系列新特性。纳米孔非常适合简单的样品制备和新型的信息学流程,系统可设置为运行实验,直到收集了足够数据,才来总结实验。”Oxford Nanopore希望到2013年,整个人类基因组的测序能在15分钟内完成。那将需要20个GridION节点,每个带有8000个纳米孔。 除此之外罗氏也准备开发相关产品,他们去年从亚利桑那州立大学的Biodesign研究所和哥伦比亚大学纳米科学中心获得了一些技术授权,以开发一种全新的DNA测序系统。