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标题:【求助】western blot

周伯通pp[使用道具]
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【求助】western blot


求大神们指点迷津!
最近做western blot 总是显不出目的条带,貌似有严重的拖尾现象,我做的是组织的,不知道是什么有原因,还请各位高手指点一二,非常感谢!
组织是:脑海马和杏仁核,要做的抗体是PSD95(突触后膜支架蛋白)和GluR1(谷氨酸受体)。分子量分别是95kd和100kd。
蛋白变性15分钟,与2*sample buffer 1:1混合,上样量80ug,15孔梳子,下层胶10%,上层胶5%。电泳:80v 30分钟,120v 70分钟。转膜,pvdf 膜,300ma 3小时。各种buffer都是新配的,没有循环使用。5%脱脂奶粉常温封闭1小时。然后用tbst洗三个十分钟。抗体用的是PSD95 CST公司的,GluR1是epotomics(abcam国内分装小包装)。用索来宝的一抗稀释液,psd95 1:800,GluR1 1:10000,四度过夜。
第二天用tbst洗三个十分钟,然后加二抗(5%脱脂牛奶),稀释浓度为:均为1:10 000(二抗来自中杉金桥),常温摇床一小时。tbst洗三个十分钟,显影。显影用的是康为的高灵敏度的ECL,压片5-10分钟。
目的条带几乎看不出来,泳道拖尾严重,背景比较深。


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moonlight45[使用道具]
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我想是抗体稀释液不好,
试试这种Western blot 多用途液,很好用。可以帮你节省很多的宝贵时间。
cuturl('http://item.taobao.com/item.htm?spm=2013.1.0.106.XrMJhT&scm=1007.77.0.0&id=19395523424&pvid=8d8bb283-9e8d-41d4-b956-0316cfce5afd&ad_id=&am_id=&cm_id=&pm_id=')
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你可以染下胶看看条带是否正常,如果正常的话做下内参WB,排除操作过程中的错误
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周伯通pp[使用道具]
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我做过内参,用的是actin (43KD),跑的挺好的,胶也染过,目的条带很浅,不过貌似也有,下图从右至左,分子量为170-130-100-70(红色)-55-40-35。


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duoduo[使用道具]
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你的80ug样品上样体积大概是多少,如果量大孔小可以适当把浓缩胶做长点,可能拖尾会好点。另外一个,如果你提的组织煮了后有很多沉淀,也可能导致拖尾。建议顺一下(转速不能太高),吸上清点样。转膜300mA3小时,时间是不是稍微长了一点。如果没条带,除了染胶之外,也可以用丽春红染一下膜,看蛋白有没有转在膜上,或者有没有转过。
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我个人觉得存在如下问题:
1. 浓缩胶是不是电泳的时间过短,在提速前是否看见MAKER都已清晰的分开。
2. 10%的分离胶的最佳分辨率在20~80KD,你的这两个蛋白是不是要考虑用8%(36~94)或者是6%(57~212)的分离胶跑跑。
3.貌似你的这两个蛋白都是膜蛋白,而膜蛋白用温和的PIPA一般不易裂解下来,是不是考虑用比较强的PIPA,加点比较好的PROTEASE INHIBITOR抽提蛋白。
4. 你的样本不多,为什么不考虑用10孔的梳子,你的蛋白上样量这么大(80ug,我一般就上10多ug),这样小孔的胶当然会造成“一坨”带子,而不是一条带子.
拙见。
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蛋白变性15分钟,与2*sample buffer 1:1混合,........

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楼主真的是按照这个顺序作的?先变性,后加buffer?
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周伯通pp[使用道具]
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你的80ug样品上样体积大概是多少,如果量大孔小可以适当把浓缩胶做长点,可能拖尾会好点。另外一个,如果你提的组织煮了后有很多沉淀,也可能导致拖尾。建议顺一下(转速不能太高),吸上清点样。转膜300mA3小时,时间是不是稍微长了一点。如果没条带,除了染胶之外,也可以用丽春红染一下膜,看蛋白有没有转在膜上,或者有没有转过。

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体积是10ul,我提蛋白的时候取的是上清液呀,顺一下是什么意思呢?我也转过两个小时的,但是都没有。膜倒是也染过,看不出很明显的条带呢。
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周伯通pp[使用道具]
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我个人觉得存在如下问题:
1. 浓缩胶是不是电泳的时间过短,在提速前是否看见MAKER都已清晰的分开。
2. 10%的分离胶的最佳分辨率在20~80KD,你的这两个蛋白是不是要考虑用8%(36~94)或者是6%(57~212)的分离胶跑跑。
3.貌似你的这两个蛋白都是膜蛋白,而膜蛋白用温和的PIPA一般不易裂解下来,是不是考虑用比较强的PIPA,加点比较好的PROTEASE INHIBITOR抽提蛋白。
4. 你的样本不多,为什么不考虑用10孔的梳子,你的蛋白上样量这么大(80ug,我一般就上10多ug),这样小孔的胶当然会造成“一坨”带子,而不是一条带子.
拙见。

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哦,那我下次浓缩胶跑的时间长一点试试。 我也用过8%的分离胶,没什么改观。是膜上的受体蛋白。上样量虽然挺大的,可是从染的胶上看,目的条带还是不明显呀。
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周伯通pp[使用道具]
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楼主真的是按照这个顺序作的?先变性,后加buffer?

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是这么做的呀,有什么不妥吗?
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