小中大问题是我的蛋白表达在包涵体内,包涵体蛋白是不是不能过柱子纯化?我查到GEMED公司有一种GST蛋白酶切试剂盒,需要在柱子中洗脱蛋白之前加入试剂盒中的试剂就可以将标签切掉。可是我现在不知道包涵体蛋白可不可以过柱子。或是我将复兴之后的包涵体蛋白过柱子,这样做可以吗?谢谢!请高手指点!
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您的问题要分几个步骤来说明。
1、包涵体蛋白是不是不能过柱子纯化?
但从字面意义上讲,不是。包涵体蛋白当然也是可以纯化的。具体怎么做你要多看一些有关包涵体纯化方面的资料。在版内搜索一下“包涵体”“纯化”关键词,有很多。
2、将标签切掉。
首先要明确两点。
其一,你构建的蛋白序列中有酶切位点存在。这样才有可能将GST标签切除。
其二,你的序列中的酶切位点是针对哪个商品化试剂盒的内切酶的。
3、我现在不知道包涵体蛋白可不可以过柱子。或是我将复性之后的包涵体蛋白过柱子,这样做可以吗?
包涵体蛋白经过变性液,如8M尿素或6M盐酸胍,溶解后,是可以进行柱纯化的。但是,不是所有类型的纯化柱都可以应用。
很可能你想用的是GST亲和层析柱,这种柱子在变性条件下GST的亲和效果很差,恐怕不能完成想要的吸附纯化效果。
包涵体蛋白经变性液溶解后,再去除变性剂进行复性,这样能不能吸附到GST亲和柱呢?答案是不一定。或者说吸附效果难以事先确定。这和你的目标蛋白的性质,以及你复性的方法、效果关系密切。
4、如果复性后的蛋白可以挂GST亲和柱,可以用试剂盒进行酶切去除GST标签吗?
答案依然是不一定。除了明确试剂盒是适用的外,还有下面的因素。
酶切的本质是一种蛋白质内部的水解操作。它和蛋白的性质相关。同样的酶,同样的酶切条件,对不同的带标签蛋白可能有着不同的酶切效果。
而且,就我来说,是不推荐用柱上酶切这种看起来比较“先进”的试验方法。特别是针对试验新手,针对没有做过酶切条件优化的新蛋白,更是不推荐。
将吸附的目标蛋白洗脱后,换液为酶切缓冲液体系。然后取小样做各种酶量和酶切时间的梯度,这是正道。