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标题:【求助】帮忙介绍一下蛋白纯化的方法

flower@@[使用道具]
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【求助】帮忙介绍一下蛋白纯化的方法


各位高手,我最近在纯化蛋白。我用的是KG载体进行的表达,SDS-PAGE显示蛋白表达在包涵体里,希望大家告诉我我应该如何纯化蛋白,而且我的蛋白将来要用来做单抗,想将GST标签切掉,请问用什么方法切掉GST标签?我查了很多资料,看得我一头雾水,请高手指点!谢谢!
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eric930[使用道具]
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构建时候就该有酶切位点,不同位点酶不一样。
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flower@@[使用道具]
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问题是我的蛋白表达在包涵体内,包涵体蛋白是不是不能过柱子纯化?我查到GEMED公司有一种GST蛋白酶切试剂盒,需要在柱子中洗脱蛋白之前加入试剂盒中的试剂就可以将标签切掉。可是我现在不知道包涵体蛋白可不可以过柱子。或是我将复兴之后的包涵体蛋白过柱子,这样做可以吗?谢谢!请高手指点!
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huifeng0516[使用道具]
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包涵体在缓冲液中不溶怎么过柱子啊,应该只能复性之后再过柱子。
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包涵体在缓冲液中不溶怎么过柱子啊,应该只能复性之后再过柱子。

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您的理解有点儿偏差。

包涵体的溶解不是复性,而恰恰是叫做变性溶解。

变性液是可以过一些纯化柱的,不一定必需先复性。
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49888[使用道具]
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问题是我的蛋白表达在包涵体内,包涵体蛋白是不是不能过柱子纯化?我查到GEMED公司有一种GST蛋白酶切试剂盒,需要在柱子中洗脱蛋白之前加入试剂盒中的试剂就可以将标签切掉。可是我现在不知道包涵体蛋白可不可以过柱子。或是我将复兴之后的包涵体蛋白过柱子,这样做可以吗?谢谢!请高手指点!

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您的问题要分几个步骤来说明。

1、包涵体蛋白是不是不能过柱子纯化?
但从字面意义上讲,不是。包涵体蛋白当然也是可以纯化的。具体怎么做你要多看一些有关包涵体纯化方面的资料。在版内搜索一下“包涵体”“纯化”关键词,有很多。

2、将标签切掉。
首先要明确两点。
其一,你构建的蛋白序列中有酶切位点存在。这样才有可能将GST标签切除。
其二,你的序列中的酶切位点是针对哪个商品化试剂盒的内切酶的。

3、我现在不知道包涵体蛋白可不可以过柱子。或是我将复性之后的包涵体蛋白过柱子,这样做可以吗?
包涵体蛋白经过变性液,如8M尿素或6M盐酸胍,溶解后,是可以进行柱纯化的。但是,不是所有类型的纯化柱都可以应用。
很可能你想用的是GST亲和层析柱,这种柱子在变性条件下GST的亲和效果很差,恐怕不能完成想要的吸附纯化效果。
包涵体蛋白经变性液溶解后,再去除变性剂进行复性,这样能不能吸附到GST亲和柱呢?答案是不一定。或者说吸附效果难以事先确定。这和你的目标蛋白的性质,以及你复性的方法、效果关系密切。

4、如果复性后的蛋白可以挂GST亲和柱,可以用试剂盒进行酶切去除GST标签吗?
答案依然是不一定。除了明确试剂盒是适用的外,还有下面的因素。
酶切的本质是一种蛋白质内部的水解操作。它和蛋白的性质相关。同样的酶,同样的酶切条件,对不同的带标签蛋白可能有着不同的酶切效果。
而且,就我来说,是不推荐用柱上酶切这种看起来比较“先进”的试验方法。特别是针对试验新手,针对没有做过酶切条件优化的新蛋白,更是不推荐。
将吸附的目标蛋白洗脱后,换液为酶切缓冲液体系。然后取小样做各种酶量和酶切时间的梯度,这是正道。
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我告诉你具体的路线:
1.诱导表达以后,裂解细菌,超声
2.离心,包涵体在沉淀中,所以去上清
3.用缓冲溶液洗涤沉淀,缓冲液的配方可以网上查,如何洗涤:震荡器上震荡使沉淀悬浮与缓
冲液中(沉淀应该尽可能震碎,这样才能洗干净杂质),然后放摇床上要30分钟
4.重复2-3若干次(3次以上)
5.最后一次洗完后,离心,收集沉淀
6.沉淀用2M尿素溶解,具体方法:震荡器上震荡,然后放摇床上要30分钟,跟洗的方法一样
7.离心,收集上清a与沉淀
8.沉淀再用4M尿素溶解,具体方法:震荡器上震荡,然后放摇床上要30分钟,跟洗的方法一样
9.离心,收集上清b与沉淀
10.沉淀再用8M尿素溶解,具体方法:震荡器上震荡,然后放摇床上要30分钟,跟洗的方法一样
11.离心,收集上清c。这时你要的蛋白基本上都在上清a/b/c中了(也就是2/4/8M尿素中)
12.上清c(含8M尿素)用含4M尿素的透析液透析至只含4M尿素
13.透析过的上清c与上清b(都只含4M尿素)用含2M尿素的透析液透析至只含2M尿素
14.透析过的上清c/b与上清a(都只含2M尿素)用不含尿素的透析液透析去除尿素,透析液的配
方网上查
15.(透析的过程就是蛋白复性的过程)透析完以后就可以用GST亲和柱吸附了
如果你做抗体,不建议用GST标签,建议用His标签的载体,His的标签比较小,可以不切除直接做抗原,GST的标签比较大,就不好说了。His标签的融合蛋白洗包涵体跟上面的方法一样。
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您的问题要分几个步骤来说明。

1、包涵体蛋白是不是不能过柱子纯化?
但从字面意义上讲,不是。包涵体蛋白当然也是可以纯化的。具体怎么做你要多看一些有关包涵体纯化方面的资料。在版内搜索一下“包涵体”“纯化”关键词,有很多。

2、将标签切掉。
首先要明确两点。
其一,你构建的蛋白序列中有酶切位点存在。这样才有可能将GST标签切除。
其二,你的序列中的酶切位点是针对哪个商品化试剂盒的内切酶的。

3、我现在不知道包涵体蛋白可不可以过柱子。或是我将复性之后的包涵体蛋白过柱子,这样做可以吗?
包涵体蛋白经过变性液,如8M尿素或6M盐酸胍,溶解后,是可以进行柱纯化的。但是,不是所有类型的纯化柱都可以应用。
很可能你想用的是GST亲和层析柱,这种柱子在变性条件下GST的亲和效果很差,恐怕不能完成想要的吸附纯化效果。
包涵体蛋白经变性液溶解后,再去除变性剂进行复性,这样能不能吸附到GST亲和柱呢?答案是不一定。或者说吸附效果难以事先确定。这和你的目标蛋白的性质,以及你复性的方法、效果关系密切。

4、如果复性后的蛋白可以挂GST亲和柱,可以用试剂盒进行酶切去除GST标签吗?
答案依然是不一定。除了明确试剂盒是适用的外,还有下面的因素。
酶切的本质是一种蛋白质内部的水解操作。它和蛋白的性质相关。同样的酶,同样的酶切条件,对不同的带标签蛋白可能有着不同的酶切效果。
而且,就我来说,是不推荐用柱上酶切这种看起来比较“先进”的试验方法。特别是针对试验新手,针对没有做过酶切条件优化的新蛋白,更是不推荐。
将吸附的目标蛋白洗脱后,换液为酶切缓冲液体系。然后取小样做各种酶量和酶切时间的梯度,这是正道。

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可是如果我只采用一个酶切体系进行酶切的话 将来如何将GST标签的蛋白和我的目的蛋白分开呢?我开始是考虑用一个酶切体系进行酶切,可是考虑到将来还要再次分离两个蛋白比较麻烦,就考虑用过柱,之后从柱上酶切。谢谢,请您指点!
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我告诉你具体的路线:
1.诱导表达以后,裂解细菌,超声
2.离心,包涵体在沉淀中,所以去上清
3.用缓冲溶液洗涤沉淀,缓冲液的配方可以网上查,如何洗涤:震荡器上震荡使沉淀悬浮与缓
冲液中(沉淀应该尽可能震碎,这样才能洗干净杂质),然后放摇床上要30分钟
4.重复2-3若干次(3次以上)
5.最后一次洗完后,离心,收集沉淀
6.沉淀用2M尿素溶解,具体方法:震荡器上震荡,然后放摇床上要30分钟,跟洗的方法一样
7.离心,收集上清a与沉淀
8.沉淀再用4M尿素溶解,具体方法:震荡器上震荡,然后放摇床上要30分钟,跟洗的方法一样
9.离心,收集上清b与沉淀
10.沉淀再用8M尿素溶解,具体方法:震荡器上震荡,然后放摇床上要30分钟,跟洗的方法一样
11.离心,收集上清c。这时你要的蛋白基本上都在上清a/b/c中了(也就是2/4/8M尿素中)
12.上清c(含8M尿素)用含4M尿素的透析液透析至只含4M尿素
13.透析过的上清c与上清b(都只含4M尿素)用含2M尿素的透析液透析至只含2M尿素
14.透析过的上清c/b与上清a(都只含2M尿素)用不含尿素的透析液透析去除尿素,透析液的配
方网上查
15.(透析的过程就是蛋白复性的过程)透析完以后就可以用GST亲和柱吸附了
如果你做抗体,不建议用GST标签,建议用His标签的载体,His的标签比较小,可以不切除直接做抗原,GST的标签比较大,就不好说了。His标签的融合蛋白洗包涵体跟上面的方法一样。

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我在文献里看过这种方法,这种的优点应该比较温和,保证蛋白复性的效果,对吗?我的老师也建议我用his标签的做 就免去切标签这一步,可是我的his标签做的送去测序,一直不能测通,可能是载体有问题,于是就放弃了。那么切掉GST标签您有什么好的建议吗?谢谢!
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wood533[使用道具]
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可是如果我只采用一个酶切体系进行酶切的话 将来如何将GST标签的蛋白和我的目的蛋白分开呢?我开始是考虑用一个酶切体系进行酶切,可是考虑到将来还要再次分离两个蛋白比较麻烦,就考虑用过柱,之后从柱上酶切。谢谢,请您指点!

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柱上酶切为什么可以去除GST标签呢?你想过这个问题没有。

柱外酶切只是把同样的一个过程分成两步走而已。这样做的好处前面的帖子已经说明了。
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