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标题:【求助】IPTG诱导表达的问题

nut6694[使用道具]
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1
 

【求助】IPTG诱导表达的问题


各位高手,小弟最近遇到一个问题:
1. 我将我的目的基因构建到pTrc99A上,是通过去磷酸化连接成功的,经过提质粒,酶切还有PCR检测符合,并确定了目的基因插入的方向.
2.转入到宿主菌内后,也通过一系列检测确定了阳性克隆,所以开始表达.
3.用只含有空载体的受主菌和含有目的基因的受主菌摇菌,在达OD值0.55左右加入1mM IPTG诱导表达.
4.但问题是SDS-PAGE后,找不出两者有什么区别,?
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00无名指00[使用道具]
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2
 

1.可能是含有目的基因的受主菌因为某种原因不表达目的蛋白,或表达的量很少(这时建议你做银染)
2.你诱导表达的时间多长?有没有试过过夜表达?
3.还有你是不是同时加上了相同时间的空质粒的对照?
4.你加没加分子量标准?
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kulee[使用道具]
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3
 

两点,你的宿主菌是不是能够用来诱导表达;OD值其实可以达到0.9左右再诱导,这样可以保证菌的量(一般加了IPTG,菌就不长了)
当然有些情况是蛋白本身的问题,不如不稳定,有毒或者是膜蛋白。这样的话你就必须考虑表达一些truncation的或者是换一套表达系统
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c86v[使用道具]
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4
 
你还可以考虑一下是否存在密码子偏爱性问题,你的外源基因里是否存在几个串联的稀有密码子?
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nut6694[使用道具]
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谢谢大家的精彩解答,本人受益菲浅,对与各位的疑问,大致有以下的解释,请各位深入知道:
 1.诱导表达时,IPTG是在摇菌OD值在0.5-0.6之间的时候加
入的,终浓度为1mM,加入后大概摇了三个小时左右.过夜培养有什么好处呢?
 2. 空载体的对照我是同时在做的.
 3. 分子量标准因为还没到货,所以我暂时没加.但我找不出其中有差别的带啊!!有一条带很明显,但是包括空载体都有那条带.
 4. 宿主菌和载体这套表达系统有人做过,应该没问题,可能存在的问题是我的蛋白可能是一种膜蛋白.是不是相对来讲诱导较难呢?
 5. 我的外源基因里没有什么稀有的密码子啊!!稀有是指哪些呢?
 6. 还有,我裂解的时间是按分子克隆上面指出的,45-55度1小时,有人建议我用100度水浴15分钟左右,因为假如是包涵体可能要那么久才能完全释放出来.你们觉得可行吗?
请各位继续指导.
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6
 

蛋白表达不出来的原因很多:
1、你的目的蛋白分子量多大?原核系统有个最适的表达范围,过小或过大都很难表达.
2、目的蛋白的性质如何?是否对宿主菌的毒性很强?
3、偏爱密码子的问题  最重要的是连续的精氨酸密码子与sd序列相似,严重影响表达的效率。
4、一般裂解大约100度10分钟就可以了
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nut6694[使用道具]
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7
 

还有一点就是:
我的基因假如表达的是膜蛋白,它会不会表达后嵌合到细菌的膜上去了呢?导致我裂解后不能获得此种蛋白质呢?我需要提取细菌的膜蛋白吗?
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owanaka[使用道具]
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8
 

Novagen有专门针对稀有密码子的宿主菌,可以解决由稀有密码子造成的不表达问题,叫Rosetta-gami吧,稀有密码子有AUA ,AGG,AGA,CUA,CCC,GGA等,你可以看一下你的蛋白是否含有几个串联的稀有密码子或稀有密码子含量在20个以上,这样的话你可以试试看这种宿主菌
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1,测序是必须的,如果是读码框架的问题或者突变,你做几年都做不出来。
2,这种膜蛋白以前有人在大肠里表达过吗?查查文献,有些蛋白在大肠里就是不能表达。
3,换载体和宿主,多试几种,或者在真核系统里表达,比如杆状病毒,对不容易表达的蛋白比较有效。
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avi317[使用道具]
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谢谢大家的精彩解答,本人受益菲浅,对与各位的疑问,大致有以下的解释,请各位深入知道:
 1.诱导表达时,IPTG是在摇菌OD值在0.5-0.6之间的时候加
入的,终浓度为1mM,加入后大概摇了三个小时左右.过夜培养有什么好处呢?
 2. 空载体的对照我是同时在做的.
 3. 分子量标准因为还没到货,所以我暂时没加.但我找不出其中有差别的带啊!!有一条带很明显,但是包括空载体都有那条带.
 4. 宿主菌和载体这套表达系统有人做过,应该没问题,可能存在的问题是我的蛋白可能是一种膜蛋白.是不是相对来讲诱导较难呢?
 5. 我的外源基因里没有什么稀有的密码子啊!!稀有是指哪些呢?
 6. 还有,我裂解的时间是按分子克隆上面指出的,45-55度1小时,有人建议我用100度水浴15分钟左右,因为假如是包涵体可能要那么久才能完全释放出来.你们觉得可行吗?
请各位继续指导.
 
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1 关于诱导时间,有时候蛋白质3个小时的时候表达量很低,电泳不易发现,在第一次左右到的时候推荐夺取几个时间点,一般在诱导时,诱导3小时,诱导6小时。当然也可以过夜。对一些容易降解的蛋白要减少时间了。
2 如果蛋白marker没有到货的话,可以用一些已知的相近分子量的蛋白来替代,象BSA,溶菌酶,等等,来做个对比,防止你的蛋白跑出泳道。
3 不管是膜蛋白还是包涵体只要你100度水浴10分钟,就可以了,不存在包涵体不释放的问题。
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