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标题:【求助】定量蛋白组学

free[使用道具]
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发表于 2013-4-25 13:42 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【求助】定量蛋白组学

各位学长、师兄们，有哪一位做过定量蛋白组学的相关实验啊？国内哪家公司或实验中心对于定量蛋白组学实验的后续分析内容给的比较详细啊？麻烦给点建议呗！
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zzzz[使用道具]
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发表于 2013-4-25 13:44 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

目前定量蛋白质组学，我了解的做的比较多的是iTRAQ，可实现蛋白的相对和绝对定量，后续可以进行差异蛋白的分析，生物信息学分析：GO,Pastway,转录因子预测，蛋白互作等
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yychen[使用道具]
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发表于 2013-4-25 13:44 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

定量可以用itraq或silac，具体哪家公司我不知道，你找个有IPA软件的吧，这个比较好用
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milkdog[使用道具]
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发表于 2013-4-25 13:45 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
各位学长、师兄们，有哪一位做过定量蛋白组学的相关实验啊？国内哪家公司或实验中心对于定量蛋白组学实验的后续分析内容给的比较详细啊？麻烦给点建议呗！

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北京 BPRC 上海 复旦 中科新生命 广州 暨南大学 都是比较专业而且历史悠久的了，看你在哪了。
华大之类的听说挺不负责的 不推荐。后续分析看你做啥物种了，高等动物IPA，低等生物就比较杂了
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bs4665[使用道具]
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发表于 2013-4-25 13:45 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
谁说华大没保证，华大蛋白做蛋白十年，定量蛋白质组学国内首推iTraq！
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owanaka[使用道具]
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发表于 2013-4-25 13:46 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
我刚在华大蛋白做完iTRAQ，给我的数据量挺大的，后期数据分析也给做GO和Pathway什么的，还讲解的挺清楚呢。
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wmp1234[使用道具]
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发表于 2013-4-25 13:46 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

我们实验室也有师姐去做的，后续还多帮忙分析了一些信息分析的数据，发表文章时候也挺帮忙的，都蛮好的啊
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pencil菲[使用道具]
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发表于 2013-4-25 13:47 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
蛋白组，比较好的是两个选择，iTRAQ，和国外用的很多年了，国内比较新的Label free技术。

Label free技术可以上baidu搜搜，也可以问我们索取资料。有意者咨询：86-0512-62959105

分析内容，定量，鉴定，差异，散点，热图，维恩，GO, pathway, network等。
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kswl870[使用道具]
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发表于 2013-4-25 13:47 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
可以推荐楼主去华大做，华大配备了目前最先进的质谱仪和强大的生物信息分析团队，还免费提供文章修改服务。
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guagua[使用道具]
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发表于 2013-4-25 13:48 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
定量数据分析推荐IPA：
国内公司能做的： 差异数据画热图，GO注释， pathway富集， network构建，转录因子预测等等；
IPA能做的：差异基因诱导产生生物功能变化定量分析和聚类、Pathway中哪些功能被激活和抑制分析、蛋白相互作用准确性分析、转录因子调控关系打分、microRNA靶标定量关系分析、生物标志物筛选等等
相关信息请参考 cuturl('www.ingenuity.com') 有需求请联系 cuturl('www.cloudscientific.com')

2012年Nature及其子刊发表引用IPA文献150余篇，Cell及其子刊20篇，PNAS 37篇，MCP 36篇，Proteomics、J. Proteome Res、J. Proteomics等共100余篇
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