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标题:【求助】大分子蛋白的western

chenshuanhe[使用道具]
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【求助】大分子蛋白的western

我要做350KD的蛋白,电泳需要跑到多大的marker出胶为止?我的内参是GAPDH(34KD)能否同时做?
同时,还想弱弱的问一下,在帖子上看大家有的电转是衡流有的是衡压,哪个好?
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youyou99[使用道具]
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这个需要经验吧,恒压恒流其实效果差不多的,一般一块胶就用恒流,2块一起转就用恒压吧,这么大分子量的蛋白真没做过啊。内参是需要同时做的
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u234[使用道具]
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不能一起转,要分为两块胶。因为这么大的蛋白,如果你的技术稍微不好,就需要通过降低胶浓度弥补转膜的低效,因此GAPDH必然跑出去(此外,做DNA、RNA采用GAPDH做内参;蛋白则是核内tubulin,核外actin)。不过如果你用梯度胶,那我就说不上话了,没做过。
应该恒压,因为你必须采用湿转,而湿转通常恒压;而半干一般恒流。
跑多大的出去,看你的胶了,其实不用问这个问题,把溴酚蓝跑到底就对了。
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owanaka[使用道具]
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非常感谢楼上!
我还有些不明白:我用6%的分离胶,溴酚蓝跑到底后,将胶切开,GAPDH和靶蛋白分开转还是用12%的胶再单跑一次GAPDH?
另外,转膜条件30v,4度过夜可否?我们通常用的都是含20%甲醇的转膜液(电转液不含SDS,电泳液含SDS),从网上看有的帖子说大分子蛋白转膜液中可加0.1-0.05%的SDS,正确否?已经做了很多次了,一次也没做出来过。急需帮助!!
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350KD的蛋白和GAPDH不好一起转的,GAPDH(34KD)用一般的电转条件就可以,但是350KD的蛋白,我们做的话一般电泳buffer,电转buffer都是另外配置的和一般的电泳,电转buffer不一样的,蛋白分子太大电转的电压和时间都会不一样的。肯定是要分开转的。
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ffooll[使用道具]
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我以前在一个帖子里提过,没有这个问题切题,我就来稍微叙述一下我的经验:
1.首先是,可以同时跑,我经常做15kD和450kD的两个蛋白,同时在一块胶上做。不需要制备梯度胶,直接制备三层胶即可。最下一层15%分离胶,中间一层8%分离胶,或者优化8% low-bis分离胶,最上一层当然是常规的浓缩胶。这样做出来基本和梯度胶分离效果相当。在跑的时候不需要多大的技巧,你会看到当指示剂进入最下层的15%分离胶后,电泳速度明显变慢,但在上面的大分子量marker还是继续往下跑,最后指示剂不会跑出胶底端,同时250kD(我们的经验)会在距离分离胶/浓缩胶界面下1-1.5cm处,足够做很大分子量的蛋白。

注意一点:该方法对于处于界面的蛋白效果不是很好,可能会有蚯蚓状的条带,我所知道的是如果用8% low-bis和15%分离胶,Actin会出现蚯蚓状条带。不同的组合结果会不一样,大家可以试一下。

2. 第二,可以同时转。没有太多要说的,只是注意我们使用的是NC膜,最近没有试过PVDF膜了(但是我想结果应该是没有太大区别的)。半干转100V恒压,加入搅拌子stir,Bio-Rad小型转膜仪2h足够。20mA恒流cold room过夜也是做过的,效果相当,不推荐,浪费时间。

附上我的low-bis分离胶的配方:
1.5M Tris PH8.8 12.5ml
10% SDS 0.5ml
40% acrylamide 7ml
30% acrylamide/Bis 4ml
H2O 26ml
如果你没有现成配好的纯的acrylamide,可以按照上面配方的计算,效果一样的。

最后附上我的图片:


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我以前在一个帖子里提过,没有这个问题切题,我就来稍微叙述一下我的经验:
1.首先是,可以同时跑,我经常做15kD和450kD的两个蛋白,同时在一块胶上做。不需要制备梯度胶,直接制备三层胶即可。最下一层15%分离胶,中间一层8%分离胶,或者优化8% low-bis分离胶,最上一层当然是常规的浓缩胶。这样做出来基本和梯度胶分离效果相当。在跑的时候不需要多大的技巧,你会看到当指示剂进入最下层的15%分离胶后,电泳速度明显变慢,但在上面的大分子量marker还是继续往下跑,最后指示剂不会跑出胶底端,同时250kD(我们的经验)会在距离分离胶/浓缩胶界面下1-1.5cm处,足够做很大分子量的蛋白。

注意一点:该方法对于处于界面的蛋白效果不是很好,可能会有蚯蚓状的条带,我所知道的是如果用8% low-bis和15%分离胶,Actin会出现蚯蚓状条带。不同的组合结果会不一样,大家可以试一下。

2. 第二,可以同时转。没有太多要说的,只是注意我们使用的是NC膜,最近没有试过PVDF膜了(但是我想结果应该是没有太大区别的)。半干转100V恒压,加入搅拌子stir,Bio-Rad小型转膜仪2h足够。20mA恒流cold room过夜也是做过的,效果相当,不推荐,浪费时间。

附上我的low-bis分离胶的配方:
1.5M Tris PH8.8 12.5ml
10% SDS 0.5ml
40% acrylamide 7ml
30% acrylamide/Bis 4ml
H2O 26ml
如果你没有现成配好的纯的acrylamide,可以按照上面配方的计算,效果一样的。

最后附上我的图片:

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很漂亮的结果!
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6%分离胶适合50-150KD,更大的应该用低浓度的了
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我发现大家对分离胶的浓度与其分离范围的认识都不太一致,什么说法都有,很困惑!
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我以前在一个帖子里提过,没有这个问题切题,我就来稍微叙述一下我的经验:
1.首先是,可以同时跑,我经常做15kD和450kD的两个蛋白,同时在一块胶上做。不需要制备梯度胶,直接制备三层胶即可。最下一层15%分离胶,中间一层8%分离胶,或者优化8% low-bis分离胶,最上一层当然是常规的浓缩胶。这样做出来基本和梯度胶分离效果相当。在跑的时候不需要多大的技巧,你会看到当指示剂进入最下层的15%分离胶后,电泳速度明显变慢,但在上面的大分子量marker还是继续往下跑,最后指示剂不会跑出胶底端,同时250kD(我们的经验)会在距离分离胶/浓缩胶界面下1-1.5cm处,足够做很大分子量的蛋白。

注意一点:该方法对于处于界面的蛋白效果不是很好,可能会有蚯蚓状的条带,我所知道的是如果用8% low-bis和15%分离胶,Actin会出现蚯蚓状条带。不同的组合结果会不一样,大家可以试一下。

2. 第二,可以同时转。没有太多要说的,只是注意我们使用的是NC膜,最近没有试过PVDF膜了(但是我想结果应该是没有太大区别的)。半干转100V恒压,加入搅拌子stir,Bio-Rad小型转膜仪2h足够。20mA恒流cold room过夜也是做过的,效果相当,不推荐,浪费时间。

附上我的low-bis分离胶的配方:
1.5M Tris PH8.8 12.5ml
10% SDS 0.5ml
40% acrylamide 7ml
30% acrylamide/Bis 4ml
H2O 26ml
如果你没有现成配好的纯的acrylamide,可以按照上面配方的计算,效果一样的。

最后附上我的图片:

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真的服了lee800265,我做260的核蛋白,怎么做都不出这种结果,我染过胶,发现250以年蛋白条带就少的可怜,我是湿转,低压过夜跟恒流300ma三小时都试过了,膜上有泳道,不出目的蛋白条带。。。。郁闷中!
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