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标题:【求助】请教各位大侠GST的蛋白纯化

土豆potato[使用道具]
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【求助】请教各位大侠GST的蛋白纯化


大家好,小弟是个新手,最近用pGEX6P-3载体进行蛋白表达。
首先,做了一个空载体对照菌株的GST纯化,介质是Glutatione Sepharose 4B,与蛋白结合过夜,其他按照说明书进行,用的是过柱纯化,经PAGE电泳检测后,能够获得较纯的GST条带,含量也较高,这说明纯化的体系应该是没问题的;
其次,进行了目的蛋白的纯化,小量菌液(5ml)用0.2mM IPTG,28度,诱导4h后,取1ml菌超声(4S / 6S, 40 times,400W)破碎细胞,经WB检测后,目的蛋白确实是可溶,目的蛋白也具有酶活性,但表达量较低;
然后,进行大体积诱导蛋白(150ml ),用8ml PBS重悬菌体,用上述超声条件进行超声,直到菌液变清(30 min),其他条件和上面一样,也进行了WB确认和酶活检测,然后用Glutatione Sepharose 4B进行纯化回收目的蛋白(与蛋白结合过夜),对分别用PBS和还原型谷胱甘肽(10mM)洗脱buffer洗脱下来的样品进行检测后发现,只有PBS洗脱的样品中有蛋白(但不确定是否有目的蛋白)但没酶活性,而在还原型谷胱甘肽洗脱buffer洗脱下来的样品中,既无蛋白也无酶活性。
这个实验,从蛋白诱导到纯化重复了三次,结果都一样没能成功获得纯化的目的蛋白,重复性非常好,郁闷中。。。
望请各位大侠对上面的实验提些建议,改正和优化。
小弟也对下面的问题有些疑惑:
1. 如果目的蛋白表达量不高,那么一般是诱导多少ml菌进行蛋白纯化的?超声效果好还是用Novagen公司的Bugbuster的裂解液效果好?实验室经费比较紧张。
2. 融合蛋白与树脂结合的时间有具体要求吗?说明书上建议半小时。会不会树脂与蛋白结合得太紧洗脱不下来?
3. 采用不同浓度梯度的还原型谷胱甘肽进行洗脱会有效果吗?
4.再弱弱的问一个问题,是不是只有可溶性的蛋白才能结合上柱?
期待各位的回复,谢谢。
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moonlight45[使用道具]
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1.你经费紧张,你就用实验室普通缓冲液就行。
2.不用那么长时间,填好柱子,样品在上面流过,就有样品吸附了,但也可能循环上样。
3.通常不用那样梯度,直接20mMTris-HCl +10-20mMGSH PH8.0洗脱就可以了。
4.还溶解的蛋白,也不可能吸附在上面。
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am10[使用道具]
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我们一般会做1L摇瓶,300ml菌液。不够可以再摇。
我认为你这个情况应该考虑挂柱、洗脱环节。
GST与Glutatione Sepharose 4B结合不是很紧密的。考虑是挂柱不好。
挂柱效果不好应该考虑你的上样buffer,破菌后的PH值要有变化,需要调整后上柱,

判断你的上清中有杂蛋白,就要用到梯度洗脱。尽量去除杂蛋白。
另外也可以考虑加入蛋白酶抑制剂不足导致蛋白量较少。
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土豆potato[使用道具]
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谢谢楼上两位,这两天我又重做了一次,这次用200ml菌,1mM IPTG,20度,诱导12h后,超声纯化,结合Glutatione Sepharose 4B 4小时,增加了还原型谷胱甘肽浓度(40mM),并且增加了反应时间(30 min,说明书上是10 min),然后能洗脱蛋白,蛋白含量很高,并且酶活性也很高,但跑胶检测后发现,除了融合蛋白外(约60KD),还有一条带是GST标签蛋白(27KD)含量也很高,想请问下为什么会出现这种情况,GST标签蛋白该如何才能去掉,我的下游研究只是拿目的蛋白做酶学性质分析,如底物,Km值,最适PH,温度等分析,这个一块纯化出来的GST标签杂蛋白对我的下游工作有影响吗?能不能通过做GST空载体的对照纯化GST条带,然后分别测定目的蛋白和GST蛋白中的酶活A,相减就是我要的酶活了?
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土豆potato[使用道具]
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理论上在空载体上纯化回收得到的GST蛋白不会有我目的蛋白酶活性,但这样做是不是不太严谨。
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ukonptp[使用道具]
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GST标签蛋白在这个表达体系中一般都有,没办法用亲和去掉,只能过凝胶柱子或离子柱去除,此外如果融合蛋白和GST标签蛋白有一样活性没办法减去的,毕竟不可能表达量一样也未必活性一样。只能纯化融合蛋白后测定。
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你得到的GST蛋白也许不够稳定,容易断裂。
可以考虑构建和表达做一些优化,甚至更换载体和标签,也许比你下游去除GST更容易,你可以试着去除GST看看难度如何
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土豆potato[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 ukonptp 于 2013-5-10 13:29 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

GST标签蛋白在这个表达体系中一般都有,没办法用亲和去掉,只能过凝胶柱子或离子柱去除,此外如果融合蛋白和GST标签蛋白有一样活性没办法减去的,毕竟不可能表达量一样也未必活性一样。只能纯化融合蛋白后测定。 ...

谢谢回复,可能我没表述清楚,我是想分别做有目的蛋白A的GST载体和GST空载体纯化回收,分别测定目的蛋白A的酶活性,然后相减就是我的目的蛋白的酶活了,就是说不通过去掉GST标签杂蛋白的方法,然后做酶学分析,只是这样就可能不严谨了
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感谢楼上几位的回复,现在又有另一个问题了,我同时做了两种植物中的一个蛋白(这个蛋白在两个植物中的同源性是最高的),一个能纯化出来(就是上面说的那个有GST标签杂蛋白的),但另一个纯化不出来,两个蛋白的纯化方法基本是一样的,而且这两个蛋白同源性很高,为什么一个能纯化出来,另一个纯化不出来呢?纠结中。。。
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gmjghh[使用道具]
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各位高手好,我纯化的GST融合蛋白有两条带,一条是目的蛋白,另一个是GST,问了些人说是蛋白分解了,想请教下怎么预防分解降解啊?都加入什么啊?什么时候加入啊?超生需要注意什么吗?缓冲液的PH和成分是不是也需要改变啊 我的是PBS,谢谢 急急急
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