小中大试试提高一下你的lysis buffer中的imidazole的浓度,从10mmol/L试起,包括20mmol/L、甚至可以到30mmol/L。这样柱子的特异性会提高些,但是,你的目的蛋白可能要损失大一些。对了,目的蛋白与柱子结合的时候最好不要用过柱的形式,把含有目的蛋白的细胞裂解液与柱子颗粒一起放在小锥形瓶中,用摇床孵育1h左右,然后再装柱洗脱,这样可能会好一些。仅供参考!
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关于NI与目的蛋白结合的时间,我有些疑问:Protocol上讲Ni与HIS TAG的结合能力强与抗原抗体反应,我因为作流式较多,知道一般的抗原抗体反应30min就可以得到很好的效果。而Protocol也说反应15-60min。是不是反应的时间过长会造成非特异性结合?一般的反应有必要反应到60min吗?是不是20min就可以了,这样反而可以减少非特异性结合。