蛋白质与蛋白组学 » 讨论区 » 经验共享 » 【求助】关于2-DE与液质联用能否在多肽及蛋白质水平应用

采购询价

点击提交代表您同意 《用户服务协议》 《隐私政策》

 
需要登录并加入本群才可以回复和发新贴
打印 | 推荐 | 订阅 | 收藏

标题:【求助】关于2-DE与液质联用能否在多肽及蛋白质水平应用

68943512yao[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 108886
精华 0
积分 212
帖子 164
信誉分 100
可用分 1557
专家分 0
阅读权限 255
注册 2013-5-15
状态 离线
1

发表于 2013-5-17 13:43 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【求助】关于2-DE与液质联用能否在多肽及蛋白质水平应用


2-DE与质谱联用和液质联用路线是蛋白质组学分析的两大主要方法，分别是在蛋白质水平和多肽水平上进行蛋白质组学分析，2-DE与质谱联用路线能否在多肽水平进行分析，液质联用能否在蛋白质水平进行分析？如果不行，请说明理由，如果可行，请说明技术路线
顶部
了了[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 73224
精华 0
积分 367
帖子 453
信誉分 100
可用分 3031
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-9-20
状态 离线
2

发表于 2013-5-17 13:44 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

质谱是用来鉴定蛋白的，现在比较通用的蛋白鉴定是二级质谱鉴定，是先直接肽段水平上的鉴定，某些色谱可以用于蛋白的分离，但分离的蛋白如何鉴定？直接测蛋白分子量是没有办法进行蛋白鉴定的，如果这样的话那不就变成类似SELDI-芯片了？所以LC-MSMS肯定是肽段水平上的分离了
顶部
u234[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 77031
精华 0
积分 691
帖子 1081
信誉分 100
可用分 6196
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-12
状态 离线
3

发表于 2013-5-17 13:44 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
液质联用不能在蛋白质水平上分析吧，因为它都把蛋白酶切了，空间结构破坏了，只能是多肽水平上的分析吧
顶部
plaa[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 77350
精华 0
积分 464
帖子 588
信誉分 100
可用分 3778
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-16
状态 离线
4

发表于 2013-5-17 13:45 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
看了下面这幅图有点恍然大悟的感觉，其实利用LC-MS研究蛋白组学可转一下思维：先将提取到的蛋白质混合物酶切成肽段后再通过LC-MS的手段进行研究。
色谱分离的蛋白用质谱鉴定也是可行的吧！该网址就是一个例子。
好像这方面的论文也挺多的，方法多样的？

cuturl('http://www.doc88.com/p-807248902551.html')


查看积分策略说明
附件
2013-5-17 13:45
14520879.snap.jpg (64.47 KB)
 
顶部
68943512yao[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 108886
精华 0
积分 212
帖子 164
信誉分 100
可用分 1557
专家分 0
阅读权限 255
注册 2013-5-15
状态 离线
5

发表于 2013-5-17 13:46 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大


QUOTE:
原帖由 plaa 于 2013-5-17 13:45 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
看了下面这幅图有点恍然大悟的感觉，其实利用LC-MS研究蛋白组学可转一下思维：先将提取到的蛋白质混合物酶切成肽段后再通过LC-MS的手段进行研究。
色谱分离的蛋白用质谱鉴定也是可行的吧！该网址就是一个例子。
好像这方面 ...

多维液相色谱好像可以直接测蛋白质，但是电泳能不能用于多肽水平还是不知道诶，你知道了吗现在？
顶部
is2011[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 75851
精华 0
积分 510
帖子 680
信誉分 100
可用分 4233
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-28
状态 离线
6

发表于 2013-5-17 13:46 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

cuturl('http://www.doc88.com/p-662151043657.html')
这篇文章里提到了2DE-LC-MS连用。个人意见：
1）这个问题的中心在2-DE是否可以用于多肽，而实际上2-DE可以用于分离分子量为10-100kD之间的蛋白质。所以用于多肽应该没有什么问题。而对于LC能否用于蛋白质，这需要考虑采用何种色谱的问题了。LC都可以用来分离核算的。
2）但是技术路线就需要很好的去思考了。要考虑具体应用的情况吧。
顶部
qhyu[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 77304
精华 0
积分 705
帖子 1049
信誉分 100
可用分 6111
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-15
状态 离线
7

发表于 2013-5-17 13:47 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

多肽和蛋白的根本区别并不在分子量吧，有些多肽的分子量比蛋白还大。
顶部