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标题:【求助】heLa细胞mTOR 分子的western blot

dream2013[使用道具]
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【求助】heLa细胞mTOR 分子的western blot


想检测hela细胞中mTOR 分子的表达和磷酸化情况,western blo实验做了3次,可是都没有目的条带,很是着急,还请各位帮我分析下啊~~
磷酸化的mTOR或许不好检测,可是我的mTOR的条带也没有,感觉就是很奇怪了。一抗说明书上显示mTOR 235KD, phospho-mTOR 289KD(说明书中phospho-mTOR是293细胞的,289kd,mTOR是大鼠肝脏中的,235kd,热心的iris_palm版主回帖说这个可能是由于组织特异性)

下面是我实验的具体步骤与试剂,各位大侠帮我分析下啊,不胜感激

1.mTOR的一抗是abcam公司的,phospho-mTOR的一抗是cell signaling公司的,二抗是荧光二抗。
2.实验步骤:
1) sample buffer 在60mm皿中裂解细胞,刮板将细胞刮下,吸到1.5ml EP
管,用1ml注射器枕头抽吸细胞,破碎DNA,沸水浴5min。-20度冰箱保存。
2) 电泳 浓缩胶4%,分离胶6%。先是50V跑过浓缩胶,130V电泳3h。上样量是200ug。
3)转膜 pvdf膜,100V,3.5h。
4)5%脱脂奶粉封闭2h。
5) 一抗用脱脂奶粉1:1000稀释4度过夜。PBST洗膜,3次每次5min
6)二抗脱脂奶粉1:5000稀释,室温1h。洗膜,4次,每次5min。

补充一下:
1.本人用的试剂药品荧光二抗之类的应该没有问题,前些天成功地检测到了AKT和phospho-AKT。

2.转膜时marker最大 175kd的,可以转过去的。

3.蛋白胶跑过了,考马斯亮蓝染过,有条带的。至于蛋白上样量,因为觉得这个蛋白的含量可能比较低,所以多加了些。我的蛋白浓度是用nanodrop的仪器测的,当然可能蛋白浓度不是很准,所以就有意多加了些。

4.阳性的话我也考虑过。mTOR的抗体是abcam公司的,推荐
rat liver lysate 做阳性对照,可是这个我没有,phospho-mTOR的抗体是cell
signaling 公司的,它的图是用293细胞饥饿16h做的,其中一张图是染的mTOR。我们实验室不做大鼠,所以我用293细胞,不加血清的DMEM培养基处理16h做的阳性对照,也是没有条带。不知这算不算是阳性对照呢??

5.其实也是看到一篇文章中用过这两个抗体才订的。那篇文章结果还可以的,是我们老板一年前在的实验室发的,所以方法什么的应该也没有太大关系,可是我做的就是没有条带,很是郁闷……

还有我想请教一下
1.转膜完了,胶用考马斯亮蓝染色,不管做哪个蛋白好像总是marker转的最彻底,这是什么原因呢??

2.关于蛋白样本的反复使用问题 我一直在想蛋白样品煮沸之后-20度保存的时候会不会也会使某些蛋白降解啊??即使分装开了,每次拿一管出来用,那剩余的样本即使没有反复冻融会不会也有可能降解掉??

再另:我们实验室几个月前有人买了santa cruze的抗体,wb做了好多次都没有条带,后来向一篇文章的作者要了他们自己做的抗体就染出条带了。联系代理公司又给他们换了一支新的抗体。我的抗体是不是会有问题啊??担心,大把的时间浪费在上面的>_<

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2013-5-28 13:41
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补充一下,本人用的试剂药品之类的应该没有问题,前些天成功地检测到了AKT和phospho-AKT。
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你这个蛋白好大哦,能转上吗?用立春红染染看,用个大分子量的预染marker做个对照。我记得超过120kd的,转膜是需要特殊条件是吧?我也没做过这么大的,只是随便说说,呵呵
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转膜时marker最大 175kd的,可以转过去的。
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转膜时间还可以加大,这样的时间对于289KD还少了些,
为什么磷酸化与非磷酸化的分子量相差这么大呢?绝对不可能, 应该是因为不同公司买的抗体原因,说明书上标的不一样,
还有你蛋白的上样量?200ug, 太多了吧, 你先跑个胶,考染下,看看有没有条带
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QUOTE:
原帖由 bgf5 于 2013-5-28 13:43 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

转膜时间还可以加大,这样的时间对于289KD还少了些,
为什么磷酸化与非磷酸化的分子量相差这么大呢?绝对不可能, 应该是因为不同公司买的抗体原因,说明书上标的不一样,
还有你蛋白的上样量?200ug, 太多了吧, 你先跑个胶,考染下, ...

多谢!胶跑过了,考马斯亮蓝染过,有条带的。至于蛋白上样量,因为觉得这个蛋白的含量可能比较低,所以多加了些。我的蛋白浓度是用nanodrop的仪器测的,当然可能蛋白浓度不是很准,所以就有意多加了些。
还有我想请教一下,转膜完了,胶用考马斯亮蓝染色,不管做哪个蛋白好像总是marker转的最彻底,这是什么原因呢??
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我觉得应该加个阳性对照组织,否则你不知道问题会出在哪里,
我也做过大分子蛋白,一个220KD的,不同批次的细胞结果很不一样,
因为我做的是原代分离的细胞,用传1-3代的,
但是传代次数不同的细胞表达220KD目的蛋白不一样,有时候能在220KD出现很明显的条带,有时候220KD条带干脆没有,只有低分子量处的条带(因为我用SC的抗体)。
为了避免每次条件不一样而导致的不能重复,我干脆把几个批次细胞提的蛋白在同一块胶上跑,结果就是验证了我的想法。

所以强烈建议你加个阳性对照。
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阳性的话我也考虑过这个问题。mTOR的抗体是abcam公司的,推荐
rat liver lysate 做阳性对照,可是这个我没有,phospho-mTOR的抗体是cell
signaling 公司的,它的图是用293细胞饥饿16h做的,其中一张图是染的mTOR。我们实验室不做大鼠,所以我用293细胞,不加血清的DMEM培养基处理16h做的阳性对照,也是没有条带。不知这算不算是阳性对照呢??

另:说明书中phospho-mTOR是293细胞的,289kd,mTOR是大鼠肝脏中的,235kd,这个有没有可能呢??

再另:你刚才说不同批次的细胞蛋白提取物跑一块胶做wb,我一直在想蛋白样品煮沸之后-20度保存的时候会不会也会使某些蛋白降解啊??即使分装开了,每次拿一管出来用,那剩余的样本即使没有反复冻融会不会也有可能降解掉??

十分感谢!!
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相关疾病:
头痛
WB学问大着呢,我也正头疼阿,
我还做一个200KD的,用SC的抗体,结果出了60KD的条带,干干净净一条,
而且因子刺激后10min, 表达骤然增高,重复三四次,都是这样啊,200KD却没有条带,找到抗体具体信息,查了蛋白库,没有收获,SC承诺给我相同蛋白的另外一个抗体,现在还没来,我们这实验条件不行,我也不能接着往下做,只能停了, 再找找资料,

我看了下你的蛋白,应该分子量是大的289KD,大鼠肝组织中235KD,可能是组织特异表达吧,你多看看别人的文献,CST上面是说用293做的,最好让CST给你个阳性对照, 我见了细胞株就讨厌的要死,
还有你旁边没有人杀老鼠么?问同学要一个肝组织蛋白阿,看看235KD有没有条嗲?
荧光二抗有没有问题?
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QUOTE:
原帖由 bgf5 于 2013-5-28 13:44 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

相关疾病:
头痛
WB学问大着呢,我也正头疼阿,
我还做一个200KD的,用SC的抗体,结果出了60KD的条带,干干净净一条,
而且因子刺激后10min, 表达骤然增高,重复三四次,都是这样啊,200KD却没有条带,找到抗体具体信息,查了蛋白库,没有收获,S ...

荧光二抗应该还好,前些天刚染过AKT.
其实也是看到一篇文章中用过这两个抗体才订的。那篇文章结果还可以的,是我们老板一年前在的实验室发的,所以方法什么的应该也没有太大关系,可是我做的就是没有条带,很是郁闷……
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