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标题:【求助】western blot奇怪的现象!

扫雷军kuzi[使用道具]
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【求助】western blot奇怪的现象!

本人本人取小鼠肝脏组织,的总蛋白后做 最近做western 有一奇怪现象!
1.作出来的目的条带都很好(86kd),但是 内参actin很模糊,杂带多而且个别样本根本没有actin条带,
2.于是换用了 GAPDH ,结果却很好!!
3。于是又换用了 别人使用过的 能作出来的 actin内参以及相应的二抗,我做了一遍 结果还是模糊杂带多,个别样本没有内参的条带!

请教各位高手,解惑!~!百思不得其解!!
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8princess8[使用道具]
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无论怎么复杂,本质无非两种情况,一是抗原有问题,二是抗体有问题。
对于抗原:
1、转膜时问题;
2、蛋白被降解
3、样品处理过程中蛋白丢失
4、样品中量很少,所用的抗体无法达到足够的检测灵敏度
5、样品处理液的问题,抑制了抗体活性,或者竞争性结合了抗体
验证办法: 取一株细胞,裂解后用你的同样WB条件,包括一抗和二抗去validate抗原的存在与否。如果用细胞的裂解液能够做出完美的结果,那么就是抗原的问题了。可以从以上4个方面去分析,包括重新杀小鼠取肝脏。

抗体问题:
1、抗体储藏时间过长,已经失去了活性
2、抗体质量很差,特异性很低
3、 一抗稀释度和不合适
4、 二抗的稀释度
5、 封闭液的可能问题

你所说的“换用了 别人使用过的 能作出来的 actin内参以及相应的二抗”, 我猜测是用你自己的抗原,用别人的一抗和二抗,也没有做出来。 你这种做法,还是没有办法排除故障。

鉴于beta-actin是个常见的WB内参蛋白,我个人认为很有可能是样品的处理问题。
可参考此文: cuturl('http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2742551/')
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wood533[使用道具]
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这个现象最可能的问题是你的actin的二抗,因为老鼠来源的二抗是针对老鼠的IgG,而在肝脏组织中有大量血液,所以你的sample里面肯定含有大量的IgG,而且IgG有两条band,并且结合特异性肯定比actin强,所以你用鼠源二抗出现非特异性条带可能性很大,而且由于结合特异性不如IgG,所以造成actin显示不清楚,建议换成rabbit来源的二抗试试。
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根据你说的情况,抗体应该没问题,GAPDH能做出来,说明蛋白提取也没有问题,有可能是转膜条件没有控制好,actin 42KD,会不会是转膜时间太长了。
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yjf1026[使用道具]
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肝细胞里beta-Actin的表达量只有平均值的三分之一,内参不清楚是正常的。其实你换GADPH就能做出来也证明了你的操作没有问题
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扫雷军kuzi[使用道具]
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肝细胞里beta-Actin的表达量只有平均值的三分之一,内参不清楚是正常的。其实你换GADPH就能做出来也证明了你的操作没有问题

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谢谢你!! 换GADPH就能做出来,而且目的条带都能作出来了,我认为这充分也证明了我的整个操作没有问题;百思不得解??β-actin 为何会这样结果?? 是否再肝脏 肺脏肾脏 中 actin 含量少?? 不合适作内参??
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扫雷军kuzi[使用道具]
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无论怎么复杂,本质无非两种情况,一是抗原有问题,二是抗体有问题。
对于抗原:
1、转膜时问题;
2、蛋白被降解
3、样品处理过程中蛋白丢失
4、样品中量很少,所用的抗体无法达到足够的检测灵敏度
5、样品处理液的问题,抑制了抗体活性,或者竞争性结合了抗体
验证办法: 取一株细胞,裂解后用你的同样WB条件,包括一抗和二抗去validate抗原的存在与否。如果用细胞的裂解液能够做出完美的结果,那么就是抗原的问题了。可以从以上4个方面去分析,包括重新杀小鼠取肝脏。

抗体问题:
1、抗体储藏时间过长,已经失去了活性
2、抗体质量很差,特异性很低
3、 一抗稀释度和不合适
4、 二抗的稀释度
5、 封闭液的可能问题

你所说的“换用了 别人使用过的 能作出来的 actin内参以及相应的二抗”, 我猜测是用你自己的抗原,用别人的一抗和二抗,也没有做出来。 你这种做法,还是没有办法排除故障。

鉴于beta-actin是个常见的WB内参蛋白,我个人认为很有可能是样品的处理问题。
可参考此文: cuturl('http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2742551/')

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谢谢你的解答!!但是我的 目的条带都有 GAPDH 也有 ,很难解释 个别样本 actin却 没有 而且杂带很多
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扫雷军kuzi[使用道具]
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这个现象最可能的问题是你的actin的二抗,因为老鼠来源的二抗是针对老鼠的IgG,而在肝脏组织中有大量血液,所以你的sample里面肯定含有大量的IgG,而且IgG有两条band,并且结合特异性肯定比actin强,所以你用鼠源二抗出现非特异性条带可能性很大,而且由于结合特异性不如IgG,所以造成actin显示不清楚,建议换成rabbit来源的二抗试试。

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十分感谢!!我的actin是小鼠的二抗,是否有必要换成rabbit来源的二抗试试??
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33号[使用道具]
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谢谢你!! 换GADPH就能做出来,而且目的条带都能作出来了,我认为这充分也证明了我的整个操作没有问题;百思不得解??β-actin 为何会这样结果?? 是否再肝脏 肺脏肾脏 中 actin 含量少?? 不合适作内参??

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ACTB在平滑肌和白细胞这些经常需要改变形态的组织里表达量很高,肺,肠等经常受到拉伸的组织也有表达,但是内脏的软组织表达量则很低。既然用GADPH能做出来就不用纠结了。


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遇到过这种情况,你提取蛋白时候是否按照程序??actin在 内脏的软组织表达量较低。既然用GADPH能做出来就不用纠结了,建议你直接使用GAPDH做内参 就可以了。
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