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标题:【求助】actin被降解了,其他蛋白也被降解了吗?

changlhsyo[使用道具]
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1
 

【求助】actin被降解了,其他蛋白也被降解了吗?


呵呵,前段时间也一直在纠结这个蛋白的wb,最近两天用HepG2细胞经过CoCl2处理以后发现结果还行,就是有个问题,低浓度的Cocl2处理Hif1a多,比control多不少,而高浓度处理24小时反而一点都没有了,奇怪。另外我用的是Abcam的一抗,1:2000,目的分子量约为120,背景还算干净。
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fei1226com[使用道具]
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2
 

p38和p-p38我都做过,一开始有点波折但后来条带做出来的挺干净利索。

首先我不知道你为什么要考染,它只能看出有没有蛋白被分离。
你为什么不转膜后用actin抗体来查看它的表达呢?

我个人认为actin不是被降解了,它表达得不均匀可能原因是:
上样不均匀;或是抗体反应时membrane弯曲了;或是显影时酶作用物(substrate)洒得不均匀。

如果这些都不是的话,那么可能你的样品有问题,样品里加的sample buffer(dye) 里应该含有DTT或者b-mecaptoethanol,缺少这些东西的时候会使目的蛋白不出条带。

另外,建议你如果位置可以确定的话,最好把membrane在抗体反应前剪成最小,这样可避免杂条带过分表达,使抗体全部跟目的条带反应,条带出来的更好一些。
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changlhsyo[使用道具]
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3
 
你好,谢谢你的解答。我染色只是为了看下样品蛋白有没有被降解。我的问题是有一组样品用actin做也没有条带,所以其他蛋白就不敢做了。
你也做过p38和p-p38,你的结果如何?是不是p38条带跟actin差不多,还是有些不表达?
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taoshengyijiu[使用道具]
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是,我处理的细胞应该总的p38没有变化(就是跟actin一样,各个条带均匀一直),而磷酸化的p-p38是有变化的,结果出来的根预想的一样顺利,我已经完成了。

你的意思是把上样的胶转膜用actin孵育后压片没压出条带吧?
我想如果你看的actin的位置正确而没有条带的话,那么它就是上样前的sample的问题。western步骤繁多,找出问题所在真是件不容易的事。
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89tongzijun[使用道具]
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5
 
是,我处理的细胞应该总的p38没有变化(就是跟actin一样,各个条带均匀一直),而磷酸化的p-p38是有变化的,结果出来的根预想的一样顺利,我已经完成了。

你的意思是把上样的胶转膜用actin孵育后压片没压出条带吧?
我想如果你看的actin的位置正确而没有条带的话,那么它就是上样前的sample的问题。western步骤繁多,找出问题所在真是件不容易的事。

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你好,非常感谢你!想再问下:你做的时候actin,p38,p-p38三种抗体(你是用哪家公司的抗体?)都得做吗,还是只做p38和p-p38?你做的时候三种抗体分开做的吗?膜有重新使用,换做其他抗体吗?p38和p-p38分子量是38KD吧?呵呵,问题太多,麻烦你了,因为这实验我做了好久了,结果都不好。
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abc816[使用道具]
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p38,p-p38是cell signaling的rabbit抗体;二抗也要用cell signaling的;
actin是sigma的mouse抗体;

我是三样都做了,因为事先我不知道p38会不会有变化,所以用actin来做loading control;

我是把p38和pp38分开做,然后两个膜stripping后做的actin。
p38和pp38分子量都不是38,而是43,跟actin一样,所以需要stripping。
关于stripping的方法你可以在园子里搜一下,会出来很多,或者,我刚给别人答复过,你搜一下我的ID。

祝早日做出好结果!
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changlhsyo[使用道具]
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7
 
p38,p-p38是cell signaling的rabbit抗体;二抗也要用cell signaling的;
actin是sigma的mouse抗体;

我是三样都做了,因为事先我不知道p38会不会有变化,所以用actin来做loading control;

我是把p38和pp38分开做,然后两个膜stripping后做的actin。
p38和pp38分子量都不是38,而是43,跟actin一样,所以需要stripping。
关于stripping的方法你可以在园子里搜一下,会出来很多,或者,我刚给别人答复过,你搜一下我的ID。

祝早日做出好结果!

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谢谢你!
我看文献p38(有几种不同形式如:α,β,γ)分子量在38-43KD,而且我重新利用膜TBST10×3次(抗体应该没洗脱掉),结果用两条带,感觉P38是在actin下面。不知道通常细胞中P38主要是以那种形式存在?


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966735obeng[使用道具]
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8
 

oh, 我没注意p38有这么多种,我没对其深入了解。
我会把我用过的抗体data sheet附上,至于看哪一个p38就取决于你的研究目的。
下面是我做出来的条带,我的p38没出来过杂条带或两条,且就在43的位置出现的,我在43上下把membrane剪成大约1cm宽窄。


[ 本帖最后由 966735obeng 于 2013-5-31 17:32 编辑 ]


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changlhsyo[使用道具]
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真是谢谢你!
你的图挺漂亮的,你actin那图是经过stripping后做的吗?还是另外做的。
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changlhsyo[使用道具]
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我看了你的资料了,我用的p38和p-p38抗体跟你一样。
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