小中大你的实验目的很大，我其实具体想问的是你的下一步处理所走的路线。
我认为，如果你走2D-Gel的路线，那么找个公司的kit去除IgG和HSA就行了。
如果你对HPLC分离比较熟悉，再加上实验室很有钱的话当然可以考虑买个去高丰度的柱子了。
我要提醒你的是，一般来说去除的种类越多，丢失的非高丰度蛋白也就越多，另外肯定不能完全去除干净。特别要注意的就是在你去除完高丰度后下一步对样品量的需求。
我们实验室有3种去除高丰度的柱子，还有两三种kit，但我是做糖蛋白的所以我一般只用GE的Protein G的小柱把IgG去掉。
关于柱子的具体的用法你应该可以到公司的网站上查到，或者打电话和他们的技术支持直接咨询。比如 Agilent，GenWay的柱子，Biorad, Pall, 等等公司的Kit。
