小中大我谈一下我的看法的经验:
我曾经用过并且一直在用上海生化所的低分子量标准蛋白,我用的10%分离胶,多数跑出来的MARKER是5个(实际是6个),只有一两次是3个,我用的是定电流24mA或32mA,后来分析了一下原因,其它都很正常,唯一可能就是分离胶的浓度低,不能使低分子量的蛋白质跑出来。我就用12.5%的分离胶,电流还是24mA或32mA,堆积胶的电流是分离胶电流的一半。以后跑出来的胶都很好,MARKER也正常为6条带。
你的情况与电压有关,但不是太大,你应关注的是分离胶的浓度,建议你试一下12.5%的分离胶或更高浓度一点的分离胶!
另外,你最好附图就更明晰一点!