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标题:【求助】loading buffer

月牙牙[使用道具]
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【求助】loading buffer

western blot :目的蛋白分子量120(胞内域)和300(膜蛋白),表达量少,请问裂解培养的细胞可以直接用1*蛋白loading buffer裂解细胞提取蛋白吗,之后的蛋白浓度测定可以直接用紫外分光光度法测吗?这种方法提取蛋白与RIPA裂解液相比有什么优缺点吗?新手求助,如果能有具体的操作步骤更好了,先谢过了。
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满意答案
1.请问裂解培养的细胞可以直接用1*蛋白loading buffer裂解细胞提取蛋白吗
——Loading buffer中含有还原剂,可以还原二硫键使得蛋白变性成为亚基,另外可与蛋白结合使之沉于孔底,易于电泳。另外,其中有变性剂,可以使蛋白变性后不沉淀。

2.之后的蛋白浓度测定可以直接用紫外分光光度法测吗?
——如果要测浓度,一般都是在加入loading buffer 之前先用其它裂解液裂解和测浓度,然后再加X*loading buffer 变性(X为1~6多见,应根据所测蛋白浓度情况选择,否则可能导致后面电泳上样体积数过大或过小。我们实验室常用3、4、5*的),混匀,然后90-100℃蒸煮彻底变性。然后再上样电泳、电转.......。直接加了loading buffer 以后的裂解液不能用分光光度计测浓度了。
至于测蛋白浓度的方法很多,我们在实验室那会常用的是马斯亮兰法(Bradford法),提供PPT参考,见附件。还有一些其他的测蛋白浓度的方法,如BCA法等,你可再查查差别和各自优缺点。

3.这种方法提取蛋白与RIPA裂解液相比有什么优缺点吗?
——没有听说用蛋白上样buffer去裂解蛋白的。你根据实验和指标需要,如欲做的是总蛋白、核蛋白或者膜蛋白等选取不同类型和强弱度的RIPA。
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月牙牙[使用道具]
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A general protocol for sample preparation is described below.

Treat cells by adding fresh media containing regulator for desired time.
Aspirate media from cultures; wash cells with 1X PBS; aspirate.
Lyse cells by adding 1X SDS sample buffer (100 μl per well of 6-well plate or 500 μl per plate of 10 cm diameter plate). Immediately scrape the cells off the plate and transfer the extract to a microcentrifuge tube. Keep on ice.
Sonicate for 10–15 seconds for complete cell lysis and to shear DNA (to reduce sample viscosity).
Heat a 20 μl sample to 95–100°C for 5 minutes; cool on ice.
Microcentrifuge for 5 minutes.
Load 20 μl onto SDS-PAGE gel (10 cm x 10 cm). NOTE: CST recommends loading prestained molecular weight markers (#7720, 10 μl/lane) to verify electrotransfer and biotinylated protein ladder (#7727, 10 μl/lane) to determine molecular weights.
Electrotransfer to nitrocellulose or PVDF membrane.


这是在CST公司网页上的protocol其中一部分,其中裂解细胞就用1X SDS sample buffer ,我应该没看错吧,这是蛋白loading buffer吧,难道没有人知道吗,但是没有测浓度,不知道怎么蛋白定量,不知道有没人这样做啊,第4步可以省去吗
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月牙牙[使用道具]
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因为买他们个抗体,所以想按他们的步骤做,不知道可不可以,有需要调整的吗
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以前看到过直接用loading buffer直接裂解细胞的,但是在那之前也多次用RIPA裂解测浓度后摸清条件(比如细胞密度、随后loading buffer用量)再进行的,而且直接裂解时因为DNA链还是比较长的,所以裂解完收集的样品会很粘稠,可以超声一下,意见仅供参考!
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ukonptp[使用道具]
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不知道你所说的1*蛋白loading buffer裂解细胞的配方是怎么样的,我原来就用过自己配的1*loading buffer裂解细胞,裂解完后很粘稠,然后就直接变性再测浓度,仅供参考,
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月牙牙[使用道具]
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谢谢你 可以直接测蛋白浓度吗,这样准吗,很粘稠需要特殊处理吗,我的1*蛋白loading buffer,就是买来的loading buffer
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月牙牙[使用道具]
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煮完会不会就不粘稠了啊,是用紫外分光测的浓度吗,请赐教啊
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am10[使用道具]
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我就是1Xloading buffer裂解的,裂解完是粘稠,冰上放置15分钟,然后煮了,离心,很好
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月牙牙[使用道具]
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那您怎么进行蛋白定量啊,能否告知啊
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