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标题:【求助】关于小分子量的western

toy[使用道具]
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【求助】关于小分子量的western


请问,我最近做了些western,
小分子量的比如说21kd、20kd和16kd的P21、bax、survivin没有作出来,大一点的没有问题。很迷惑。
我的条件是:上样总蛋白75ug,配10%的胶,电泳时最小为10kd的marker还留着,PVDF转膜湿转300mA 1h或350mA 1.5h都试过,封闭后一抗过夜。TBST洗膜,二抗1.5h,TBST洗膜。而后ECL显影。

内参37KD的GAPDH没有问题。条带很浓。但是小分子的P21,bax,survivin都没有出来。

我仔细搜索了版内大家的讨论:
对于转膜时间和电流大小 没有一致的看法:有人认为半个小时,200mA就够了。也有人转2h。有人用恒压转。那么,到底是恒流好还是恒压好?

我一直都用恒流350mA转膜1.5h的,转30kd以上都没有问题。因为现在要做的是小分子,所以调成300mA 1h试过,虽然GAPDH可以出来,但目的蛋白没有。想问转膜条件到底应该如何?PVDF膜理论上应该不会使得蛋白转过头吧?

我需要做怎样的调整。
我今天做,自己初步的调整如下:
1、胶配成12%
2、加大上样蛋白量100ug
3、转膜时间是否也需要再减少?
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xiaoxiaoniao[使用道具]
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小分子的一定要注意时间不要转过了,我一般都是60分钟150左右的电流就可以了,时间不要太长,要不就把小分子量转丢了。胶最好弄12的。
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toy[使用道具]
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3
 
我自己调整了下条件,目前bax和survivin是可以跑出来的。

调整如下:
1、胶配成12%,确保溴酚蓝跑到中下部没有跑出去,同事marker能明晰的分开就好。电泳条件为80mA 电泳了70min

2、加大上样蛋白量100ug

3、转膜条件:200mA恒流,0.45um的pvdf膜,转1h,采用 biorad的系统 。

转后,用考马斯亮蓝染胶,发现43kd以下的蛋白在胶上已经没有痕迹了,
而43kd以上的蛋白还有残余在胶上的。

之后加抗体没有特别的。

体会:小分子的western还是得专门做,不能企图和大分子的一起做,一次做很多。条件大概还是需要结合自己的系统好好摸索下。
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junjie05[使用道具]
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交流一下,我也是做survivin 的,我也是老做不出来。我的marker最小的11kd,17kd,
我今天就是配的12%的胶,但是还是发光了一个白板。
我们转膜用的是恒压,100v,一个半小时。其他的指标我转的都很好。
我用的santa cruzs的抗体,你用的哪家的抗体??
一抗浓度 和二抗浓度分别是多少??能否告知一二??谢谢!
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toy[使用道具]
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我用的是bioworld的抗体,小包装25ul,1:500稀释。
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junjie05[使用道具]
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相关疾病:
胃癌
我是胃癌细胞,肯定表达这个蛋白的
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kewanqi2011[使用道具]
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你好,我在做17kD的蛋白,有几个问题请教一下。
我用100V恒压至溴芬蓝跑到分离胶下三分之一处,染胶发现17KD以下蛋白较弥散,不像分子量较大的蛋白一条一条的那么清晰,转膜后丽春红染色17KD上下位置很淡,考虑可能跑胶出现问题。园子里搜索发现很多人染胶小分子蛋白位置都有这种现象,想问问你是否也出现过这种现象?怎么克服?
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QUOTE:
原帖由 kewanqi2011 于 2013-6-5 15:26 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

你好,我在做17kD的蛋白,有几个问题请教一下。
我用100V恒压至溴芬蓝跑到分离胶下三分之一处,染胶发现17KD以下蛋白较弥散,不像分子量较大的蛋白一条一条的那么清晰,转膜后丽春红染色17KD上下位置很淡,考虑可能跑胶出现问题 ...

可能是由于电压问题,电压过大,跑的太快就弥散了
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bgf5[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 toy 于 2013-6-5 15:25 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
我自己调整了下条件,目前bax和survivin是可以跑出来的。

调整如下:
1、胶配成12%,确保溴酚蓝跑到中下部没有跑出去,同事marker能明晰的分开就好。电泳条件为80mA 电泳了70min

2、加大上样蛋白量100ug

3、转膜条件:200mA ...

小的分子量你还弄0.45的膜啊,换0.22的
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finger[使用道具]
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是不是转的时间太长了 ,我们老师给我提过1KDa大概对应1min左右,再适当调整下。
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