蛋白质与蛋白组学 » 讨论区 » 经验共享 » 【求助】重组蛋白不表达怎么办?

采购询价

点击提交代表您同意 《用户服务协议》 《隐私政策》

 
需要登录并加入本群才可以回复和发新贴

标题:【求助】重组蛋白不表达怎么办?

sunshine039[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 74211
精华 0
积分 253
帖子 205
信誉分 100
可用分 1821
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-8
状态 离线
1
 

【求助】重组蛋白不表达怎么办?


我们自己构建了原核表达系统PGEX-4T-1/cypD,经过测序检查表明该系统构建没有问题,然而摸索了快一个学期了,从菌液量,IPTG浓度(0.2 0.6 1.0mM)三个梯度,诱导温度,诱导时间等方面着手。SDS-PAGE检测,用空载质粒做对照,每次GST条带都能出来,重组蛋白就是出不来,请各位高手帮忙分析一下会是什么原因,小女子先谢过了!
顶部
sunnyB[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 77335
精华 0
积分 581
帖子 862
信誉分 100
可用分 5059
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-16
状态 离线
2
 
换一下载体看看
顶部
windy+++[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 74130
精华 0
积分 490
帖子 720
信誉分 100
可用分 4343
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-6
状态 离线
3
 

1.仔细检查下序列,是不是移码等原因导致起始或终止密码子没有了。一般大肠杆菌多多少少能表达点东西出来的,但如果基因的结构不完整就是另外一回事了。
2.如果有稀有密码子,都替换掉。
3.诱导加抗生素没有?是不是表达的过程中质粒丢失非常严重?可铺抗性和非抗性平板检测一下。
顶部
lxh031[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 76425
精华 0
积分 335
帖子 389
信誉分 100
可用分 2726
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-5
状态 离线
4
 
是不是目标蛋白有毒性? 可能导致表达量过低 可以用western检测下
也可以换对毒性蛋白有耐受性的菌株 C43(DE3)
稀有密码子 可以换用rosette菌株

是不是形成包涵体了?

。。。
顶部
sunshine039[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 74211
精华 0
积分 253
帖子 205
信誉分 100
可用分 1821
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-8
状态 离线
5
 
换一下载体看看

=====================================

谢谢,载体是经过挑选的,算是还比较好做的了
顶部
sunshine039[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 74211
精华 0
积分 253
帖子 205
信誉分 100
可用分 1821
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-8
状态 离线
6
 
1.仔细检查下序列,是不是移码等原因导致起始或终止密码子没有了。一般大肠杆菌多多少少能表达点东西出来的,但如果基因的结构不完整就是另外一回事了。
2.如果有稀有密码子,都替换掉。
3.诱导加抗生素没有?是不是表达的过程中质粒丢失非常严重?可铺抗性和非抗性平板检测一下。

===========================================================================================================

谢谢
1.测序结果我们仔细对比了一下,900多bp的序列只错了4个,也没出现终止密码或者是稀有密码呢。
2. 都加了抗生素,我用空质粒摇菌做了对照,GST的蛋白有表达,但是重组蛋白却怎么也出不来。
3.我之前做的都是25°诱导3h,结果提不出重组蛋白;后来查到文献,用20°诱导过夜后提出的蛋白却是GST,我想请问一下,这可以说明我的目的蛋白没表达吗?
非常感谢!
顶部
sunshine039[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 74211
精华 0
积分 253
帖子 205
信誉分 100
可用分 1821
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-8
状态 离线
7
 
是不是目标蛋白有毒性? 可能导致表达量过低 可以用检测下
也可以换对毒性蛋白有耐受性的菌株 C43(DE3)
稀有密码子 可以换用rosette菌株

是不是形成包涵体了?

。。。

==========================================================================================================

谢谢
1.目的蛋白没有毒性,纯化后做western看不到目的条带,
2.包涵体我也做过,没有结果,查了很多文献,我的目的蛋白还是可溶性的,我想就算形成包涵体,上清里应该还是会有一定量存在的,western应该可以检测出来的吧,到目前为止还是什么结果都没有。
顶部
tangxin_80[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 79896
精华 0
积分 549
帖子 757
信誉分 100
可用分 4621
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-12-17
状态 离线
8
 

如果确定构建没有问题,诱导操作没有问题,唯一的出路就是换载体。

即使你感觉这个载体好做那也没办法啊。
顶部
veiwu[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 107977
精华 1
积分 513
帖子 662
信誉分 102
可用分 4122
专家分 10
阅读权限 255
注册 2013-4-27
状态 离线
9
 

呵呵,表达不出来是很正常的。
我之前做的一个蛋白,换了N多个载体,摸索了N多诱导条件,结果还是不表达。
后来我就把这个基因送去公司优化了一下,进行全基因合成。结果还是不表达,同样摸索了N多条件,都不表达。
而且有两个有意思的现象,当我把它连在GST后面融合表达的时候,没有明显表达,于是我用GST柱纯化了一下,发现结合的只有GST。
然后把它连接到NusA这个蛋白后面融合表达,结果诱导出来的是一个比NusA小很多的蛋白,表达量很高。
最后我把这个蛋白接在MBP后面融合表达,37度诱导,发现有少量的表达。20度诱导有大量表达。这些充分说明,蛋白表达与否跟其RNA的二级结构以及稳定性有相当大的关系,不可不察!
顶部
sunshine039[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 74211
精华 0
积分 253
帖子 205
信誉分 100
可用分 1821
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-8
状态 离线
10
 
呵呵,表达不出来是很正常的。
我之前做的一个蛋白,换了N多个载体,摸索了N多诱导条件,结果还是不表达。
后来我就把这个基因送去公司优化了一下,进行全基因合成。结果还是不表达,同样摸索了N多条件,都不表达。
而且有两个有意思的现象,当我把它连在GST后面融合表达的时候,没有明显表达,于是我用GST柱纯化了一下,发现结合的只有GST。
然后把它连接到NusA这个蛋白后面融合表达,结果诱导出来的是一个比NusA小很多的蛋白,表达量很高。
最后我把这个蛋白接在MBP后面融合表达,37度诱导,发现有少量的表达。20度诱导有大量表达。这些充分说明,蛋白表达与否跟其RNA的二级结构以及稳定性有相当大的关系,不可不察!

================================================================================

谢谢

那是不是说融合蛋白的表达与否及量的多少与标签蛋白有关呢?

还有我最近有查到有文献已经做出了这个融合蛋白,可无赖我怎么改变条件就是提不出来啊...还在找原因呢
顶部