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标题:【求助】丙酮沉淀的困惑!

uuooii[使用道具]
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【求助】丙酮沉淀的困惑!


丙酮沉淀都说会丢失蛋白质,可是还有这么多人用沉淀法!
1、到底会丢失多少蛋白质??
2、为什么会丢失???
3、尿素和其他裂解液的成分溶于丙酮吗??如果跟着沉淀下来,会不会影响上样液中各种成分的浓度,进而影响聚焦?
4、丙酮风干不充分,会影响IEF聚焦吗??
5、一般你们沉淀多久???最少多久???
6、丙酮沉淀真的可以去除离子吗?我的标本同样沉淀,为什么有时电压上不去有时上的去?
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1,肯定会丢失蛋白质,具体丢多少取决于样品的种类.
2,有些蛋白质一经沉淀之后难以再溶解.
3,应该不会跟着沉淀下来,至少绝大部分不会.
4,一般5分钟风干足够了,尽量充分.
5,最少2小时以上以沉淀完全,减少丢失的蛋白质。偶常用沉淀过夜。
6,可去除大部分离子,但还有一小部分会跟着沉淀。
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uuooii[使用道具]
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谢谢斑竹对新的、大的、经常问菜鸟问题的菜鸟的帮助。
感谢。
您的丙酮中加DTT吗?有必要吗??
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QUOTE:
原帖由 uuooii 于 2013-6-19 14:10 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
谢谢斑竹对新的、大的、经常问菜鸟问题的菜鸟的帮助。
感谢。
您的丙酮中加DTT吗?有必要吗??


您的问题有难度啊。偶的建议仅供参考,具体还需要您自己摸索。
丙酮中可以加DTT,也可以不加。
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kuaizige[使用道具]
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建议还是加,对溶解性有好处.-20度沉淀过夜没问题.
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我用丙酮沉淀发酵液的蛋白质,发酵液含有磷酸盐缓存液,用丙酮沉淀后盐含量很高。我做了一个对照试验,将丙酮直接加在一定浓度磷酸盐缓存液中,明显看到白色的沉淀,我感觉丙酮的去盐不好。
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qumm1985[使用道具]
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我倒经常用TCA和丙酮;
Amersham的clean-up kit也是TCA和丙酮,但还有其它的。斑竹或那位知道它有哪些啊?????(kit好贵啊)
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QUOTE:
原帖由 qumm1985 于 2013-6-19 14:12 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
我倒经常用TCA和丙酮;
Amersham的clean-up kit也是TCA和丙酮,但还有其它的。斑竹或那位知道它有哪些啊?????(kit好贵啊)

您是指KIT的配方吗,不好意思,偶知道的和您一样多,呵呵.
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uuooii[使用道具]
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我用丙酮沉淀发酵液的蛋白质,发酵液含有磷酸盐缓存液,用丙酮沉淀后盐含量很高。我做了一个对照试验,将丙酮直接加在一定浓度磷酸盐缓存液中,明显看到白色的沉淀,我感觉丙酮的去盐不好。

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谢谢你,我也是因为有些怀疑这个才发帖子的。你都用盐溶液试过了,事实胜于雄辩,看来去盐最多只是一部分。
根据你的提示,回头我试试向裂解液中加丙酮,看看尿素等会不会沉淀下来。
另外,丙酮不是夺取水分,蛋白才会沉淀下来吗??所以溶于水的成分必然会沉淀下来。这是我的理论上的推测。(供大家讨论丙酮沉淀的原理)
另外我还觉得,如果裂解液的成分跟着沉淀下来,会影响上样液中各种成分的浓度,进而影响聚焦。
所以我觉得沉淀应该考虑裂解液的成分和浓度。(个人观点,供大家讨论)
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uuooii[使用道具]
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大家继续讨论,TCA/丙酮沉淀和单独丙酮沉淀的比较。
原理,各自特点,以及沉淀过程中注意的问题。
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