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标题:【求助】离子交换去除DNA问题

966735obeng[使用道具]
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【求助】离子交换去除DNA问题


最近试验发现,宿主DNA总是伴随目的物一起洗脱,从盐度0.3一直到1M NaCL,且浓度不一,认为DNA可能片段大小不一,跟柱子的结合力不同,请问,就阴离子柱而言,小片的DNA结合的牢固还是大的染色体DNA结合强呢?

还有一个问题,蛋白与DNA跟阴离子柱结合力那个强?一般是PH低的时候那个会先洗下来,又是为什么呢?谢谢,请指教
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junhun[使用道具]
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无论是核酸还是蛋白质,与离子交换柱结合的强弱与大小无关,只与带电荷的状态有关。

蛋白与DNA跟阴离子柱结合力那个强?这个问题更无法回答。很多蛋白在你的纯化条件下与阴离子交换柱还不吸附呢。

就吸附的情况来说,一般DNA的吸附比较强。应该是蛋白先洗脱。

如果想要用阴离子交换柱来去除DNA,最好选择适合的pH缓冲平衡液,使得目标蛋白穿透或在很低浓度盐条件下洗脱。

反之,如果想要用阳离子交换柱来去除DNA,最好选择适合的pH缓冲平衡液,使得目标蛋白吸附在柱上。

加核酸酶后用分子筛纯化,或在高盐下用疏水层析纯化也可以去除核酸。
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taoshengyijiu[使用道具]
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也有一种情况,你的宿主DNA和目标蛋白有非特异性的结合,可以尝试用些酶后作离子交换。此外,还要测试好你目标蛋白的PI值。这个非常重要。结合柱子强弱与蛋白折叠方式,DNA螺旋方式有关。如果是小段的DNA,则可能带的电荷少,会被先洗下。
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966735obeng[使用道具]
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谢谢两位的解答,还想问一下,用核酸酶的话在后期4FF去小片段DNA的时候,核酸酶能否一块去除,需要做检测么?
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966735obeng[使用道具]
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谢谢两位的解答,还想问一下,用核酸酶的话在后期4FF去小片段DNA的时候,核酸酶能否一块去除,需要做检测么?
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c86v[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 966735obeng 于 2013-6-19 17:19 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
谢谢两位的解答,还想问一下,用核酸酶的话在后期4FF去小片段DNA的时候,核酸酶能否一块去除,需要做检测么?

你多大的蛋白能用4FF纯化?
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huifeng0516[使用道具]
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肯定是病毒了,宿主DNA和病毒混合物的分离在国内还没有结果,所以好多疫苗企业止步不前了
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avi317[使用道具]
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谢谢两位的解答,还想问一下,用核酸酶的话在后期4FF去小片段DNA的时候,核酸酶能否一块去除,需要做检测么?

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核酸酶可以用阴离子纯化去除,有专门的ELISA试剂盒可以检测。
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lixi559[使用道具]
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911[使用道具]
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好多疫苗企业止步不前了
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