【讨论帖】StepByStep 学习核酸序列分析软件DNAssist1.0

蛋白质与蛋白组学 » 讨论区 » 经验共享 » 【讨论帖】StepByStep 学习核酸序列分析软件DNAssist1.0

26 1/3 1 2 3 ››

需要登录并加入本群才可以回复和发新贴

打印 | 推荐 | 订阅 | 收藏

标题:【讨论帖】StepByStep 学习核酸序列分析软件DNAssist1.0

气泡[使用道具]
三级
Rank: 3

UID 77464
精华 0
积分 258
帖子 236
信誉分 100
可用分 1946
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-17
状态离线

发表于 2013-7-8 15:43 资料个人空间短消息加为好友

小中大

我始终抱着这样的想法，“一个例子学会一个软件的基本使用”。其实用几分钟就可以学会那些我们经常需要使用的功能：）感谢jnuxz斑竹和zyh961171战友的加盟，让我们把领初学者进门的努力进行到底！
做DNAssist的StepByStep的时候，我想起了刚上博士的时候在实验室里，我们拿到测序结果时，通常要找个师兄弟，一个人“ATGC...”地高声念着期望的序列，一个人听着，“塔塔塔...啪”地三下光标一下空格键地把测序结果分成一个个密码子，看碱基序列和阅读框有没有出现错误。每当有节奏的“塔塔塔...啪”的声音响起，我们就知道，又有人的测序结果来了。那里可是一个巨牛的实验室啊：）直到有一天有个人不经意地说，有个软件可以对测序结果的......

气泡[使用道具]
三级
Rank: 3

UID 77464
精华 0
积分 258
帖子 236
信誉分 100
可用分 1946
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-17
状态离线

发表于 2013-7-8 15:50 资料个人空间短消息加为好友

小中大

DNAssist可不仅仅是对测序结果的。它处理我们平常需要的一些关于DNA，RNA和蛋白质的基本数据，对表达非常有帮助。这里用一个例子来说明它的功能。主要演示①对测序报告（序列比对）；②DNA的物化性质、限制性酶切位点图谱分析；④分析蛋白质的物化性质、抗原性、疏水性。

气泡[使用道具]
三级
Rank: 3

UID 77464
精华 0
积分 258
帖子 236
信誉分 100
可用分 1946
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-17
状态离线

发表于 2013-7-8 15:51 资料个人空间短消息加为好友

小中大

1. 安装好DNAssist1.0后，从开始/程序中打开这个软件。

附件

2013-7-8 15:51

74461451.snap.jpg (64.16 KB)

气泡[使用道具]
三级
Rank: 3

UID 77464
精华 0
积分 258
帖子 236
信誉分 100
可用分 1946
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-17
状态离线

发表于 2013-7-8 15:53 资料个人空间短消息加为好友

小中大

2.打开后的界面如图。

附件

2013-7-8 15:53

41377732.jpg (46.87 KB)

气泡[使用道具]
三级
Rank: 3

UID 77464
精华 0
积分 258
帖子 236
信誉分 100
可用分 1946
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-17
状态离线

发表于 2013-7-8 15:54 资料个人空间短消息加为好友

小中大

3. 现在我们来进行一个序列比对（Align）。我常这样对比测序报告；或看某个基因在融合蛋白基因的哪个位置等。这里说对测序结果。建立一个新的DNA序列，即file/new/DNA。然后把预期的DNA序列（如AB-CTB）拷进去。注意！！只能是纯粹的ATGC，而不能有空格和其他字母！！否则不能拷贝进去！这个问题我们实验室来来去去的人不知道问过我多少遍：（

附件

2013-7-8 15:54

98807380.snap.jpg (47.34 KB)