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标题:【求助】如何去除蛋白质溶液中的碳酸氢铵

minran_1980[使用道具]
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【求助】如何去除蛋白质溶液中的碳酸氢铵


现在有要对胰酶消化的肽段溶液进行除盐(碳酸氢铵),然后进行后续的实验。鉴于碳酸氢铵具有挥发性的特征,因此有文献介绍可以用真空离心浓缩的方法(但没有细节)!碳酸氢铵的性质比较特殊,在60摄氏度即可完全分解,那么如果真空离心的时候,温度设定为60摄氏度,虽可促进碳酸氢铵的分解,但是否也极有可能应先个肽段的稳定性?请各位大侠,有经验,感兴趣的,畅所欲言!
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8princess8[使用道具]
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买几个小分子量的超滤管,离心去除你不想要的盐
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any333[使用道具]
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C18去除盐份,超滤管 不可以用,因为已经消化为肽段了
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肽稳定的话,直接加热可分解.还可抽真空.因为它是挥发性盐.
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moonlight45[使用道具]
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几乎没有可能影响肽段的稳定性。大部分文献都是用碳酸氢铵做酶解的,还有用iTRAQ时候用TEAB,最后都是真空干燥的,这是标准操作。如果你担心的话可以把温度降到30度以下,或者用冷冻干燥。而且高温就会影响肽段稳定性吗?没有这方面的经验,但是我记得有时候我们还煮肽段做western blotting,好像也没有什么影响。
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minran_1980[使用道具]
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买几个小分子量的超滤管,离心去除你不想要的盐

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超滤管的最小分子量为3KD,对肽段不太适用。
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minran_1980[使用道具]
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C18去除盐份,超滤管 不可以用,因为已经消化为肽段了

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C18除盐也是一个很好的方法,不过这个过程肯定会有肽段的损失。
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minran_1980[使用道具]
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肽稳定的话,直接加热可分解.还可抽真空.因为它是挥发性盐.

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我专门请假了蛋白质组学领域的以为大牛,他说用室温真空离心干燥即可将碳酸氢铵挥发。碳酸氢铵为什么会在真空离心时直接挥发呢?
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minran_1980[使用道具]
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几乎没有可能影响肽段的稳定性。大部分文献都是用碳酸氢铵做酶解的,还有用iTRAQ时候用TEAB,最后都是真空干燥的,这是标准操作。如果你担心的话可以把温度降到30度以下,或者用冷冻干燥。而且高温就会影响肽段稳定性吗?没有这方面的经验,但是我记得有时候我们还煮肽段做western blotting,好像也没有什么影响。

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谢谢,你在真空离心干燥时,采用多少温度呢?我感觉这其中所需的时间太长,比如0.5mL的碳酸氢铵溶液可能需要好几个小时。
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junhun[使用道具]
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因为铵很容易分解,特别是碳酸氢铵,真空或加热可分解为氨气,二氧化碳。
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