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标题:【求助】western-blot检测小分子量蛋白(1.8Kd)的转膜条件?

any333[使用道具]
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1
 

【求助】western-blot检测小分子量蛋白(1.8Kd)的转膜条件?

采用的是tricine-SDS-PAGE胶跑电泳,但是省去了中间的space胶,每孔上样量15ug以上,半干转膜时电流采用60mA,1h,PVDF膜(45nm),电转液按照takara目录后的配方配制,没有加SDS的那种;但是转膜后丽春红S染色基本上看不到条带,一抗二抗继续孵化显色,什么也没有。转膜后的胶快速考染也没有看到蛋白条带残留。

同等条件做分子量为38kd的蛋白就没有问题。

请问:转膜的条件是否有问题?

是否有哪位前辈试过用15%的SDS-PAGE胶跑这种小分子蛋白的电泳?

对于小分子量蛋白,有好用的marker么?(生物通上推荐的santa的,除此之外呢?)

谢谢!
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131415[使用道具]
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2
 

晕,跟偶的问题差不多,,

请教中,

哪位大虾指导一下?

刚才浏览了一些帖子,可能有一下问题

1、蛋白提取问题:量太低或者无;

2、转膜过了。
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yueban-1147[使用道具]
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3
 
建议你采用预染marker,这样就可以看到蛋白质是不是结合到pvdf膜上面。
凝胶中没有蛋白条带,说明已经转移出去了,但是没有结合上去,我看你的pvdf膜是45nm,那就不对了,蛋白质穿过去很正常,太大了,4.5um的膜结合更牢固
还有一个就是操作问题
第一,电极千万不能反了,否则不可能在膜上看到,开始电转前要仔细检查
第二,一直都戴手套操作,手上的油脂对蛋白质结合影响很大,特别是小分子蛋白。
第三,膜与凝胶之间的气泡要排出,这也是影响结合的一个重要因素。
至于电流,应该问题不是很大。
第四,整个电转过程保持四度,可以在冰箱里面转移。
我们做过6kd的蛋白,用300ma电流,转一个小时,效果很好。
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dongdongqiang[使用道具]
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4
 
但是预染marker有好的推荐么?

此外,你做的时候也是用的tricine胶?谢谢!
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我知道的是SIGMA的C6210,最小范围1.4kd,你应该能用
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我看完帖子后觉得问题出在样品上,转膜后膜上和胶上都没有蛋白带,还有你的转膜电流和时间也不是太大和太长,转过的可能性不大,所以建议从提蛋白入手。
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any333[使用道具]
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7
 

谢谢楼上二位。

蛋白样品的制备采用的是2*SDS上样buffer直接裂解细胞,采集悬液超声破碎后沸煮得到的。用来做其它的实验都没有问题。在后续的尝试中考染也看到蛋白条带了,但是转膜后一直用丽春红s染不出明显的条带,继续做下去也没有阳性结果。

所以考虑问题还是出在转膜上。在继续尝试。
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zhenxin[使用道具]
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8
 

对了,,溴酚蓝的分子量只有670,但是与10kd的跑得差不多,,会不会出去了/
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zhenxin[使用道具]
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9
 

CRITICAL STEP The maximal protein load can be limited by large amounts of neutral detergent in the sample and by high
concentrations of lipid when solubilizing biological membranes. SDS must always be in large excess over neutral detergents
and/or lipids. For isolated mitochondrial membranes (70% protein, 30% lipid), for example, the optimized maximal protein load
of sample wells 0.7 × 5 mm is ~20 μg. Increasing the applied amount of protein to
40 μg, for example, may cause the individual protein bands to disappear in a diffuse
background. Around 0.4% neutral detergent in the sample can be tolerated for
direct mixing with SDS-containing sample incubation buffers and application to SDS
gels. The incubation buffers and volumes described in Step 4 set a tenfold excess of
SDS over the neutral detergent. Setting the SDS/neutral detergent ratio to <10 may
result in a surprising result after staining: normally separated, large proteins may
be detected in the upper gel areas, but the lower gel areas may be completely clear
with no small proteins detectable.

是不是这个问题?
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15%的胶,1.8k 的蛋白(多肽)很可能已经跑出去了。丽春红染色能看到marker 吗?
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