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标题:【求助】白纯化 挂不上柱子的问题

mingming0638[使用道具]
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【求助】白纯化 挂不上柱子的问题


各位大侠,我是个纯化新手,所以希望各位能多多指教
我的蛋白为46KD,感受态用的是BL21,表达载体用的是PET30a,用的是QIAGEN 的Ni-NTA Agarose 柱子,结合Buffer的成分是50mM的NaH2PO4,300mM的NaCL 8M的尿素,但是蛋白缓冲液与镍柱结合作用2个小时,跑完PAGE胶后,发现洗脱液中很少目的蛋白,反而在刚下柱的液体中有很多目的蛋白,还有洗涤缓冲液液中,也是很多,洗涤用5mM的咪唑,洗脱用1M的咪唑,谢了 各位
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是组氨酸标签的吗,PH值很重要,影响组氨酸的电荷
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mingming0638[使用道具]
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是组氨酸 PH值为8.0 而且是包涵体
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1、确定融合表达了吗?------western检测一下
2、各种缓冲液的PH值一定要准确,结合buffer的PH值可以提高。
3、确定洗脱下来了吗?可以把Agarose 取点跑page胶,看看是结合的不好呢还是洗脱的不好?
4、洗涤、洗脱缓冲液可以摸一个梯度,看看什么情况下最好,有时候说明书给的条件并不适用。
在裂解液及洗脱液中加入1%TritonX-100可以使杂蛋白大大减少,提高纯化效果。
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谢谢各位,昨天晚上新做的纯化,发现一个更要命的问题,除了Marker、Agarose中的、过柱刚流出来的液体以外,什么都没有,而且Agarose中的条带较淡,刚流出来的较深,其他的地方什么都没有是连泳道都没有,还有这个填料是刚用过一次的,还是淡蓝色的,一直放在四度中,还需要再生吗?是填料的问题吗?
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mingming0638[使用道具]
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感谢各位对我的帮助
对楼上的回答:是融合表达了,并且做过western;
PH值为8.0,并且是在看过文献和查过镍柱亲和层析原理之后确定的,它的前提就是PH为8.0;
Agarose中条带较淡;
梯度是以前有人摸好的5mM咪唑(洗涤)、1M咪唑(洗脱);
还有您说的裂解液和洗脱液中加TritonX-100,它不是主要针对的膜蛋白吗?我的是糖蛋白
另附上当时第一次做纯化时出现刚流出柱子到洗脱液的图

纯化后的蛋白 从右往左Marker(Marker没跑好)、 刚从树脂脱下来的、经过第一次洗涤液、第二次洗涤液、第三次洗涤液、第一次洗脱液、第二次洗脱液、第三次洗脱液 最后两条甬道什么都不是


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mingming0638[使用道具]
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感谢各位对我的帮助
对楼上的回答:是融合表达了,并且做过western;
PH值为8.0,并且是在看过文献和查过镍柱亲和层析原理之后确定的,它的前提就是PH为8.0;
Agarose中条带较淡;
梯度是以前有人摸好的5mM咪唑(洗涤)、1M咪唑(洗脱);
还有您说的裂解液和洗脱液中加TritonX-100,它不是主要针对的膜蛋白吗?我的是糖蛋白
另附上当时第一次做纯化时出现刚流出柱子到洗脱液的图

纯化后的蛋白 从右往左Marker(Marker没跑好)、 刚从树脂脱下来的、经过第一次洗涤液、第二次洗涤液、第三次洗涤液、第一次洗脱液、第二次洗脱液、第三次洗脱液 最后两条甬道什么都不是


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对了,还想说的是当时不明白结合Buffer的原理,加完结合Buffer也没离心,就把沉淀悬浮了起来,所以就跑出了上面的图
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感谢各位对我的帮助
对楼上的回答:是融合表达了,并且做过western;
PH值为8.0,并且是在看过文献和查过镍柱亲和层析原理之后确定的,它的前提就是PH为8.0;
Agarose中条带较淡;
梯度是以前有人摸好的5mM咪唑(洗涤)、1M咪唑(洗脱);
还有您说的裂解液和洗脱液中加TritonX-100,它不是主要针对的膜蛋白吗?我的是糖蛋白
另附上当时第一次做纯化时出现刚流出柱子到洗脱液的图

纯化后的蛋白 从右往左Marker(Marker没跑好)、 刚从树脂脱下来的、经过第一次洗涤液、第二次洗涤液、第三次洗涤液、第一次洗脱液、第二次洗脱液、第三次洗脱液 最后两条甬道什么都不是

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从图上看,还是结合的不好,有没有用过重力柱啊,结合两个小时以后,装在柱子里,让裂解液随重力自己流下来,可以反复多过几次。另外,我觉得洗涤液的咪唑还可以降低。取出来Ni-NTA Agarose,先离心,去掉保存液,再平衡,再加裂解液。给你一份中文的说明书,我以前就是按照这个做的。
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89tongzijun[使用道具]
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镍离子金属鳌合亲和层析介质(Ni-NTA)说明书


一、 简介

金属螯合亲和层析介质,又称固定金属离子亲和色谱,其原理是利用蛋白质表面的一些氨基酸,如组氨酸能与多种过渡金属离子如Cu2+,Zn2+,Ni2+,Co2+,Fe3+发生特殊的相互作用,能够吸附富含这类氨基酸的蛋白质,从而达到分离纯化的目的。因此,偶联这些金属离子的琼脂糖凝胶就能够选择性地分离出这些含有多个组氨酸的蛋白以及对金属离子有吸附作用的多肽、蛋白和核苷酸。半胱氨酸和色氨酸也能与固定金属离子结合,但这种结合力要远小于组氨酸残基与金属离子的结合力。

镍NTA亲和层析介质(Ni-NTA)具有特异性好、流速快的优点,颗粒粒度均匀,粒径小,并且螯合镍更稳定,能耐受更高的还原剂,物理和化学稳定性好,批次重复性好。本产品已经螯合好镍离子,使用更方便。



二、 性能参数:



特点
基团密度高,载量大,分辨率高,使用方便
基质
6%的交联琼脂糖凝胶
配体


Ni2+
配体密度
20-40μmol /ml
吸附载量


15mg蛋白/ml
介质颗粒大小
45-165μm
最大流速
600cm/h
pH范围
3-10,在位清洗时pH范围可到2-11
保存温度
+4-8℃
保存液体
20%乙醇


三、 适用范围

分离带His标签的重组蛋白及能被金属离子吸附的多肽、蛋白、核苷酸、磷酸化蛋白。

四、 应用实例

实验名称:Ni-NTA 分离带His标签的重组蛋白

实验步骤:

1、Ni-NTA 装柱,1.6×20cm,柱床体积为10ml;

2、用缓冲液1平衡2~5个床体积,流速为2ml/min;

3、将20ml细胞破碎液(50mMPBS,pH7.4,0.5M NaCl)0.45μm滤膜过滤,上样,流速为1ml/min;

4、用缓冲液1再洗2~5个床体积,流速为2ml/min;

5、用分别含10、20、50、100、200、300、400mM咪唑的缓冲液3进行阶段洗脱,流速为2ml/min,收集各阶段洗脱峰,用SDS-PAGE检测融合蛋白的分子量大小和纯度;

6、用纯水流洗5个柱床体积,再用20%的乙醇流洗3个柱床体积,流速为2ml/min,柱子置于+4-8℃环境中保存。



缓冲液组成:

缓冲液1:50mM pH7.4的PBS缓冲液。配制:0.5M NaH2PO4 19ml,0.5M Na2HPO4 81ml,NaCl 29.3g, 加适量水溶解后定容到1000ml。

缓冲液2:50mM磷酸盐缓冲液,pH7.4,即pH7.4的PBS溶液。配制:0.5M NaH2PO4 19ml,0.5M Na2HPO4 81ml,NaCl 29.3g和咪唑34g, 加适量,水调pH后定容到1000ml。
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