蛋白质与蛋白组学 » 讨论区 » 经验共享 » 【讨论帖】Tricine-SDS-PAGE胶的使用方法与心得

采购询价

点击提交代表您同意 《用户服务协议》 《隐私政策》

 
需要登录并加入本群才可以回复和发新贴

标题:【讨论帖】Tricine-SDS-PAGE胶的使用方法与心得

nvdabing[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 108897
精华 0
积分 252
帖子 204
信誉分 100
可用分 1787
专家分 0
阅读权限 255
注册 2013-5-15
状态 离线
1
 

【讨论帖】Tricine-SDS-PAGE胶的使用方法与心得

先说一下Tricine胶的好处。
Tricine胶比较容易将样品压平,具体原因我也没有搞清楚,但可以肯定的是这种胶跑出来的Marker又细又直,同样,显出来的条带也压的很好。与普通的SDS-PAGE胶跑出来的结果相比,Marker扩散没有那么厉害,各泳道条带间隔明显,不像普通胶的条带容易连到一起。反正跑出来的条带就是很漂亮。

Tricine-SDS-PAGE胶的配方:(我一直用的就是10%这个浓度,把8KD和280KD都做出来了)
分离胶 积层胶
ddH2O 1.85 mL 2 mL
AB-3 1 mL 250 uL
Gel-Buffer(3*) 1.65 mL 750 uL
甘油 0.5 mL —
10%AP 25 uL 22.5 uL
TEMED 2.5 uL 2.25 uL
(这个配方来自DXY,今天又回来了,呵呵)

3*Gel-Buffer 配方:(200mL量)
Tris-Base 48.44g
Tris-HCl 31.52g
SDS 0.6 g
pH 8.45,很难溶,可以60°C水浴促进溶解。

AB-3 (100mL量)
丙烯 48g
双叉丙烯酰胺 1.5g
注意:丙烯溶解后会使溶液体积增大,故只要用约80mL水溶解即可,完全溶解后再定容。通风橱内操作,注意保护自己!

外槽电泳液(+极)(Anode Buffer)10*
Tris-Base 46.92g
Tris-HCl 17.73g
500mL体积,pH 8.9。

内槽电泳液(-极)(Cathode Buffer)10*
Tris-Base 24.22g
Tricine 35.84g
SDS 2g
200mL体积,pH 约8.25。

(内外槽电泳液的体积这样配,是因为一般电泳槽内槽一次只要150mL液体,而外槽需要400-500mL液体。)
顶部
nvdabing[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 108897
精华 0
积分 252
帖子 204
信誉分 100
可用分 1787
专家分 0
阅读权限 255
注册 2013-5-15
状态 离线
2
 

制胶时,分离胶做好后加水压平,一般20min就凝固了。
这里有个技巧,已经在某个帖子里回答别人了。为了避免样品漏的问题,可在分离胶凝固后(表现为分层处出现一条清晰的分界线),这时候,可以不急着把水控干,而是配置积层胶,但是AP和TEMED先不加,再空出水(枪头沿一边吸尽即可),再在积层胶里加入AP,TEMED,迅速混匀,先取少量胶液灌入板内,轻轻摇晃几下,润一遍,弃掉这些胶液,这时候尽量去干净,动作要快。再正式灌满胶液,插上梳齿。

跑电泳时,可以60V先压约30min,可以看到溴酚蓝变的又细又直,待进入分离胶,可以看到预染的Marker已经分离,就可以将电压调至120V跑完。

转膜与普通的都一样,这里建议30V恒压转2小时(用于80KD以下的蛋白分子),如果有更大的蛋白280KD的mTor,可以再这2h后再加350mA 30min,效果很好,280KD以下90KD以上的都可以加350mA这一步,时间根据分子量来定。90KD加15min即可。

先写这些吧,有什么问题我们再讨论。希望对大家的实验有所帮助。
顶部
xiaoxiaoniao[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 108878
精华 0
积分 509
帖子 677
信誉分 100
可用分 4049
专家分 0
阅读权限 255
注册 2013-5-15
状态 离线
3
 

我想请教一下楼主Tris-Base和Tris-HCl有什么区别?还有就是Tricine-SDS-PAGE系统不是应该有3层胶吗?
小弟最近正在做一个6K分子量小蛋白的western-blot,可用普通的sds-page电泳后所得到的压片条带不是很理想,希望楼主给予帮助,非常感谢。
顶部
greenbee[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 79370
精华 0
积分 710
帖子 1119
信誉分 100
可用分 6368
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-12-10
状态 离线
4
 

你6K分子量小蛋白的western-blot能做出来?能把你方法说说吗?我在做7.5的,普通的sds-page电泳,啥也没有?非常感谢啊!园里说Tricine-SDS-PAGE系统3层胶适合5K以下蛋白。
顶部
nvdabing[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 108897
精华 0
积分 252
帖子 204
信誉分 100
可用分 1787
专家分 0
阅读权限 255
注册 2013-5-15
状态 离线
5
 

6KD的蛋白我没做过,但是应该可以。如果要用孔径更小的膜效果会更好一些
这个系统是很稳定的。
顶部
nvdabing[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 108897
精华 0
积分 252
帖子 204
信誉分 100
可用分 1787
专家分 0
阅读权限 255
注册 2013-5-15
状态 离线
6
 

Tris-Base就是Tris碱,Tris-HCl就是Tris盐酸。
做普通胶不是有PH6.8和8.8的Tris-Hcl吗?配置时好像就是用Tris-base加酸调的PH值就可以了
TAKARA参考书上有这个配方。
我们这个系统里用的Tris-Base和Tris-HCl就是两种不同的粉剂。
3层胶我还没做过,因为这个蛋白分离范围已经很大了,足够了。
顶部
xiaoxiaoniao[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 108878
精华 0
积分 509
帖子 677
信誉分 100
可用分 4049
专家分 0
阅读权限 255
注册 2013-5-15
状态 离线
7
 

多谢楼主回复了。
另回复楼上的问题,我做6kd的蛋白用的是普通的sds-page,分离用的是20%的胶,之所以不满意是因为电泳条带有些弥散,最后压片的结果不是很好看,所以想尝试Tricine-SDS-PAGE。至于电泳条件是恒流11mA 30min,随后15mA 1小时,具体情况可参考预染marker,感觉这个条件和楼主的恒压情况可以基本对应,小分子蛋白又是做western-blot不宜跑得太久。转膜我用的是湿转,20V 1.5-2小时(起始电流大概130mA左右),和楼主的条件也差不多。电泳仪可能比较老了,貌似还是Pharmacia的。
顶部
ALALA[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 77477
精华 0
积分 671
帖子 1002
信誉分 100
可用分 5901
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-17
状态 离线
8
 
楼主,大约17KD左右的蛋白,用0.45um的膜来转会不会转过啊?
顶部
qiangren789[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 73754
精华 0
积分 333
帖子 365
信誉分 100
可用分 2651
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-9-27
状态 离线
9
 
请问小分子量的对照物(肌球蛋白F1\F2\F3)在哪可以买到?价格怎么样?
顶部
skytree[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 76459
精华 0
积分 372
帖子 444
信誉分 100
可用分 3026
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-5
状态 离线
10
 
Tris:三羟甲基氨基甲烷,
分子式:(HOCH2)3CNH2
结构式:


查看积分策略说明
附件
2013-7-31 13:10
78718035.png (2.81 KB)
 
顶部