小中大iProtein
尽管乍一看,iProtein的主页平淡无奇,但是这只是假象,那些搞蛋白的肯定会被其内容所吸引。在其主页上有5块可点击的内容:序列、结构、家族、位点和结合配体。在序列和结构选项中,您可以输入一个关键词或PDB代码,页面上将会列出与之匹配的所有蛋白,以氨基酸或结构形式。在序列模式下,点击可下载的序列将启动序列搜索,来寻找相似的序列。在结构模式下,将会出现蛋白名称、分类、来源、参考文献和结构等。在家族选项中,您将了解到不同蛋白家族的成员。
结合配体这个选项可能会对药物学家有用。您可以在上面构建自己的分子,并提交,用于分析潜在的蛋白相互作用。如果您的配体能与蛋白结合,那么程序将会列出这一系列蛋白,以及PDB信息和配体结合的位点。如需查看配体以及蛋白的结构,iProtein将会链接到另一个iPad应用程序Molecules,我们下面将会介绍。
iProtein这款程序是由Eidogen-Sertanty, Inc.为iPad开发的,需要4.99美元,当然,有5天的免费试用,喜欢再买呗。
Molecules
这款程序是由Sunset Lake Software开发的,主要是用来查看蛋白质的三维结构。结构可向不同方向旋转,并随心所欲移动,通过手指滑动,还可轻松放大。速度快得惊人,某一特定氨基酸的放大和缩小似乎只是一瞬间。它还有一个功能,就是鉴定特定结构中关键的氨基酸残基,或只关注蛋白的某一部分。顺便提一句,它是免费的。