蛋白质与蛋白组学

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赞同~~~~，但是有一个问题，前面群友也有提到，你这个蛋白确定会针对不同的疾病有表达差异么？你给的信息少，我们无从知道，建议你谨慎研究方案再定夺

如果k蛋白已知，那就直接买抗体做ELISA，如果没有商品化的抗体就要自己做了。
如果K蛋白未知，那就是筛选性研究了，方法很多，有商品化蛋白质芯片，缺点是只能筛选已知的蛋白。 还有以前用过serex技术。还有就是蛋白质质谱分析，既然是筛选性的研究，那你肯定不知道这是什么蛋白，也不存在纯化蛋白这一步了。上质谱前可用液相层析 或者二维电泳进行初步筛选 然后在上质谱仪 如果有差异峰 在进行串联质谱鉴定。
顺便提一下 寻找某种疾病血清学诊断指标是很多临床医生想做的课题，因为如果做出来确实能给临床提供帮助，但是做血清学研究干扰因素太多，不建议一上来就在血清里研究。这样风险很大，很难做出结果。最好先在组织中去做，做出有差异后再往血清里做，最好是分泌性的蛋白那更好。这样风险就少很多。要知道做质谱是很烧钱的。国内也没有几家单位拥有自己的质谱平台。所以大部分是叫公司做，然而很多公司都是为了弄钱，如果做不好，可能顺便弄些结果来糊弄你，这种情况也不少见。

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多谢仁兄指点。其实也不是什么k蛋白，就是kappa轻链蛋白。
您说的很对，老板是临床出身，对于科研并不是很在行。他的目的是想把两种不同疾病血清中的kappa蛋白单独提纯，然后用提纯的kappa蛋白进行蛋白组学的双向电泳和质谱分析，寻找差异（我猜测他是想找结构和构象上的差异）。但我觉得一来血清蛋白质组学鉴定出的多数是常见蛋白，很难发现有价值的特异蛋白，二来只是做kappa蛋白的比对，这个还是蛋白质组学吗？我对于结构蛋白质组学不是很了解，故而有所疑惑！
蛋白质组学很烧钱，请公司做，还真要有厚实的家底啊！！！

找出两种疾病k蛋白的差异？

觉得这里有些模糊，不明确。

如果单纯是比较两种疾病状态下k蛋白的含量差异，那采用免疫学方法如Elisa，或WB等就可以解决。

如果是想找不同疾病条件下，与k蛋白形成蛋白复合物组成上的差异（如果k蛋白能与其他蛋白发生粘附，形成复合体），大概需要先进行免疫共沉淀，把k蛋白以及与其相互作用的蛋白富集起来，然后变性，可进行差异分析来分析不同疾病条件下蛋白复合体的组成差异。

不过我觉得楼主需要考虑一个问题：就算找到了差异，能说明什么问题？ 这个与具体的研究背景关联密切了。

如果这个出发点不明确，建议不要贸然下手。

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抱歉，是我没有表述清楚。其实老板的目的就是寻找两中疾病中kappa蛋白的差异何在？这两种疾病相互间有一定的关联，都是由kappa蛋白导致发病的。但是由于都没有细胞株，只好用患者血清，先分别提纯出两种疾病的kappa蛋白，然后把这两种kappa蛋白按照蛋白质组学的模式，双向电泳，再质谱，差异点就是诊断，治疗的可能靶点。。。。。。。。
不过我觉得老板的思路还是有问题：首先怎么纯化kappa蛋白？用kappa蛋白的单抗吗？纯度能达到多少呢？其次，蛋白质组学，在我看来是要比较一组未知的蛋白，而不是比较确定的单个蛋白（如kappa）。老板可能是想比较kappa在空间结构上的差异，但是这个是蛋白组学的内容吗？我对于结构蛋白质组学不是很了解，所以才请教。
我自己是想把这两种病的血清先去除高丰度的白蛋白和免疫球蛋白，然后跑双向，鉴定，再验证结果。不过血清里能鉴定的东西，就像您说的：就算找到了差异，能说明什么问题？，很有可能还是证明kappa蛋白在其中有表达的差异而已！

赞同~~~~，但是有一个问题，前面战友也有提到，你这个蛋白确定会针对不同的疾病有表达差异么？你给的信息少，我们无从知道，建议你谨慎研究方案再定夺

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从理论上看会有表达的差异。不过，我也感觉实际的可操作性不是很强。

谢谢你的提醒！