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标题:【求助】western blot三个月了,一直是目的蛋白还可以

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【求助】western blot三个月了,一直是目的蛋白还可以


我从今年10月份开始做western,可一直没出来什么实质性的结果。内参总是不好。
现在有几个问题想请教一下各位:
昨天做的时候,发现电泳的速度特别慢。我用的是15%的分离胶,5%的基层胶。我用的是BIORAD的垂直电泳装置。梳齿底部到两胶分界处的距离大概有1.5cm,电泳了70分钟才到交界处。后来我换了一下外槽的电泳液,,跑分离胶的时候快了一些。我使用60V恒压跑积层胶,90V跑分离胶。这样可以吗?
电泳速度慢,主要跟什么有关系呢?
还有很多人在论坛里都说要赶走凝固好的胶的底部的气泡,我们实验室的都没赶过。昨天我也发现胶两块玻璃板的底部是有不少气泡,对电泳速度有什么影响?如果要赶得话,那怎么去赶下边的气泡呢?

我的目的蛋白是12KD的,用的内参是β-actin,转膜的时候用38min可以吗?我们实验室用的是BIORAD的半干转膜仪。
昨天我做的过程中,发现转完膜之后,内参的那条带上的marker还有很多停留在胶上,膜上面倒是也有,只是颜色比较淡。我用的是fermentas的预染彩虹marker。后来想一下,我在转膜前用75%的酒精把赶气泡用的玻璃棒擦了一下,紧接着就用来赶气泡了,乙醇会不会对转膜有影响
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我们实验室的设备条件那是没得说,现在试剂也用了不少,可老是没什么实质性的结果,心情很是郁闷!!希望那位老师帮忙指点一下。谢谢~
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是否可换一下条件?

75mA 跑胶,20V转18分钟。

另外,可先做SDS-PAGE.用不同量的样本,考马斯亮蓝染下,看哪个量比较合适。

对于凝固好的胶的底部的气泡,尽量赶走。

WESTERN牵涉环节较多。如无经验,可请师兄师姐先做一遍。
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浓缩胶1cm就够了,分离胶如果是100V左右的话,每小时能跑2cm,你算下时间看你的是不是慢了。

转膜时间延长到1小时试一下吧,感觉38min有点短。
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转膜时间有点短了,建议一个半小时到两个小时试试
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其实跑胶底部的气泡一点都不影响,我经常没赶干净,照样跑胶很整齐,WB结果也很好
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内参是β-actin是有的时候不好做,不知道楼主做实验的材料是什么?
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问题有二:1、不知道为什么beta-actin各上样孔之间会连在一起?而同在一块胶上跑出来的目的蛋白就是分开的。我用的是恒压60V跑5%的积层胶,用90V跑12%的分离胶。也注意了在37度约30min促凝后,让胶在室温冷却约40min。我是用的在鼎国昌盛买的5*的SDS上样缓冲液,是把他终体积到1*用的。2、我是同时跑的两块完全一样的胶,两个的加样量完全一致,样品也是相同的,可我的目的蛋白两个做出来结果却不太一致,这是为什么呢?尤其是第一个问题,请哪位高人可以帮忙指点一下。我也问过师姐,她们也不知道原因。
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我的材料是人肺腺癌细胞和肺鳞癌细胞系
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这次我的上样量是80ug
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