小中大
1 WB验证你的结果（验证多少蛋白视财力，文献分析而定）
2 参照别人文献，分析蛋白可能涉及相关功能，两个选择:
a: 文献已报道，成功可能性大，但意义小
b：未报道，风险大，但意义也大
3 下游实验具体参照你选择蛋白而设计
tips：
一般而言，对于基于全蛋白的2DE的蛋白组，得到新的标志物可能性很低（全蛋白鉴定蛋白有限，基本已做完，而且现在芯片很成熟）。
个人认为2DE比较让人感兴趣的一个方向是免疫沉淀得到低丰度蛋白再进行2DE。
不过好像做这个的不多，有一个参考是：
Kaboord, B. and M. Perr, Isolation of proteins and protein complexes by immunoprecipitation. Methods Mol Biol, 2008. 424: p. 349-64.
