小中大正在做GST-pull down,请教以下问题:
1,细菌裂解液和细胞裂解液的选择应该注意什么?我的bait蛋白目前研究不是激酶,prey蛋白可能是激酶有酶活性,这样的话蛋白裂解液应该如何选择?希望给推荐一下!
2.在细菌中表达bait蛋白,诱导的量不太多,时间IPTG浓度温度条件都摸索过了,3-6小时差别不大,是不是形成了包涵体?如何优化条件?
3.我用的是细胞裂解液与GST融合蛋白做binding实验,请问有没有较好的protocol?我们实验室多数是做TnT做体外的pull down,参考不多,亟待解决。
4.接问题3,GST融合蛋白与细胞裂解液孵育的体系不知如何着手,用多少的蛋白裂解液合适呢?或者说多少的GSTbeads和多少细胞裂解液做结合?需要测蛋白浓度吗?
谢谢!!
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1,BUFFER 可以多试几种,毕竟有些BUFFER会对相互作用有影响,很难判断,最好多试试
2,如果不想要包涵体,可以试试换载体或者宿主菌,不同诱导起始OD。
3,关键是不要影响蛋白间的相互作用,而非与GST的作用
4,蛋白浓度可以试试,做一个非PD的对照。