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标题:【讨论帖】成功过的战友讨论下,你曾经WESTERN...

nut6694[使用道具]
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【讨论帖】成功过的战友讨论下,你曾经WESTERN...


成功过的战友讨论下,你曾经WESTERN做不出来是那部分出问题了.看看各部分出问题的几率,为还没有成功,仍然苦苦寻找结果的战友提供点参考(由于本人经验有限,不足之处还请斑竹和各位大侠改正):

1、蛋白提取问题,蛋白降解,或者上样量少导致检测失败。
2、蛋白电泳失败。
3、转膜问题:转膜不充分,过转,温度过高导致蛋白结构改变等。
4、抗体问题。
5、显影问题。
6、其它。
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loli[使用道具]
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抗体问题排在第一,抗体的特异性,一抗二抗的比例,这些都需要摸索条件。
蛋白电泳第二,胶的配置,由于APS的失效,tris-Hcl PH不准,丙烯酰胺的氧化(以上问题一般都是配置时间较久以后)导致电泳失败或泳道奇形怪状。
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uuooii[使用道具]
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我认为western bloting 中蛋白提取是关键,最好用试剂盒提取,尤其目的蛋白是在亚细胞器表达的蛋白;其次是一抗二抗,一抗最好单克隆抗体,二抗国产好厂家的也行 ;ECL发光试剂一定要灵敏;制胶,电泳和转膜个实验室都做得比较常规了;显影定影按说明书作做活实验是经验就行。
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89tongzijun[使用道具]
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我做了很久的WB,最大的一个难点感觉在于样品制备上!蛋白的降解有些时候是你想象不到的,可能出奇的糟糕,也可能完全没事~~如果单独做WB的话,感觉以“快速彻底裂解,先变性后保存”的原则比较有效,尽量选择足够强的裂解液,甚至直接给loading buffer裂解,然后取出部分蛋白定量,其余加入loading buffer100度充分变性,再分装保存。有些时候比蛋白酶抑制剂更有效。

另一个感觉就是样品中目的蛋白的量,限于WB的检测下限问题,一般目的蛋白量最好别低于1ng(虽然ECL法下限是0.1ng,即100pg),最好在10ng以上为好。这就要求在做WB之前必须充分考虑目的蛋白的可能丰度,最好充分的准备工作然后再设计细胞量或者组织量,千万别把样品搞稀了,否则就不好办了。

最后,还是多看文献,在做某个蛋白之前最好看看别人是如何做的,有什么特殊要求,内参如何选等等。
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zranqi_1[使用道具]
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我以前做的时候问题主要出现在样品的制备上,也就是如果免疫时用到的蛋白和wb时的蛋白有出入,这样就会导致wb失败,所以后来我就一次性制备足够的蛋白,可以不是很纯,但是一定要和免疫动物时候用的蛋白是同一批的。
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summerxx[使用道具]
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看到好几位战友都对蛋白制备有深刻的印象,也提醒我们正在WESTERN和准备WESTERN的战友,一定要注意过第一关,提出高质量的蛋白对实验成功至关重要!
希望更多的战友参与!
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ha111[使用道具]
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楼上几位战友提出的蛋白制备确实非常重要,但如果在裂解液中加入cocktail的话应该不容易降解,-80度保存几个月都没有问题。
我认为western blotting 中最关键的一步是转膜。我的经验是小分子量的蛋白半干转效果比较好,大分子量(100KD)以上建议湿转。具体转膜条件需要多摸一下。30-80KD半干转恒流1mA/cm2,1-1.5h 都可以,大分子湿转100V,2.5h以上应该可以,转完膜丽春红染出的条带比较清楚的话,一般都能有结果。
抗体一般在其他问题排除后再考虑是否有质量问题。
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moonlight45[使用道具]
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请教一下各位高手,我做WB时,总是内参能出来(有时条带不太完整),目的蛋白老是出不来可能是什么地方出问题?(蛋白应该没问题,同样的蛋白已经做出来几个指标了。)

还有我转膜时一次转好几张,有的出来,有的出不来可能是什么原因?

谢谢了!
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nut6694[使用道具]
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请教一下各位高手,我做WB时,总是内参能出来(有时条带不太完整),目的蛋白老是出不来可能是什么地方出问题?(蛋白应该没问题,同样的蛋白已经做出来几个指标了。)

还有我转膜时一次转好几张,有的出来,有的出不来可能是什么原因?

谢谢了!

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战友,内参一般比较好做,能出来说明整个WB的流程应该没有问题,提的蛋白也可以,但是目的蛋白由于分子量大小不一样可能电泳和转膜条件也不一样,还有蛋白丰度问题导致蛋白量低出检测范围、抗体等环节都应该考虑。具体的问题可以把你详细的条件另辟新贴求助,祝出结果!谢谢!
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mimili_901[使用道具]
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细节地方一定要多注意,比如SDS-PAGE时的缓冲液pH值啊,temed、ap的新鲜程度啊,样品上样前的处理啊,还有转膜时的电压/电流、膜的处理,还有ECL时的抗体孵育时的时间与温度,显影/定影啊等等。其实一般出问题很多时候都是由于在细节地方的疏忽造成的。
希望高手继续补充细节内容:)
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