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我想还有一个可能:我曾经有过在荧光下看双染的细胞,红绿两种颜色都有,一种(绿)强,另一种(红)是细胞普遍有弱光,有的地方有星星点点分布的强光,二者分布略有差异.但第一次在激光下扫描出来的与肉眼在荧光镜下看到的不同,是二者共同分布,强度相似.细胞轮廓还比较清晰.当时的扫描模式是普通的模式,即同时进行两种荧光的激发.
可是实际上该标本的荧光标记应该出现在不同部位,在咨询技术支持后他认为可能是荧光串色的问题,即两种染料的发射波长有部分重叠导致的,建议改用顺序扫描的方法.就是先激发一种,进行扫描,再激发一种,进行另一荧光的捕捉,缺点就是扫描速度慢多了.
这样处理后,两种颜色分开了,弱的那个(红色)在共聚焦的扫描视野中几乎没有(其实是凋亡的标记,当时是正常组,本就应该很少).
在这种情况下,我切换到共聚焦显微镜的目镜,用肉眼看荧光,红色的荧光是能看到的,而且细胞表现为弱的全细胞都能看到的颜色,这种情况应该是激发出来的荧光有串色的可能性,即激发的能量较强,使我们能看到较宽的光谱,而在激光扫描的情况下,激发的带宽比较窄,针对染料的特异激发比较强,那么可能扫描出来的不如肉眼看到的东西多,其实是特异性更强了.
另外的一个可能性就是选择的激发光谱与染料的有偏差.对于熟练的操作人员来说,这种可能性不大.你应该将染料的名称或激发\发射光谱准确告知操作人员.