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标题:【求助】pet-28a,蛋白表达不出来,大大们帮帮忙

luoliqiong[使用道具]
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【求助】pet-28a,蛋白表达不出来,大大们帮帮忙

小弟最近几个月一直在做原核表达,本打算表达三个蛋白,可就是一个目的蛋白条带都没有出现。相当的郁闷啊。希望各位提一些建议.........
首先从ncbi下载三个基因的cds(从ATG开头到终止密码子)。然后选用新买的pET28a作为载体,设计引物,pcr扩增,跑胶验证都正确。pcr产物纯化(kit),酶切(目的片段、载体),酶切纯化(kit),T4连接酶 16度过夜,取10μL连接产物转DH5a感受态(克隆菌)。接着,挑10个菌落做菌落pcr,进行初步验证,再选择菌落pcr阳性的管,摇菌过夜,提质粒双酶切验证(成功),送公司测序也正确。
测序正确重组质粒再转入表达菌BL21(DE3),挑菌做菌落pcr,菌落pcr阳性的再摇过夜,提质粒双酶切验证(成功),取双酶切验证正确的菌摇过夜,取1ml接种到100mlLB中,od0.4-0.6时添加IPTG,分别取2 4 6 8时段1ml保存。
可是,跑sds-page的时候就是没表达。诱导前后没有特异条带,三个基因都是这样。呕血啊。大大们,帮帮我撒。

后面我又借用别人的PET32a,也进行了上面的实验,结果诱导前后只用表达标签蛋白(20kDa左右),目的蛋白是33kDa左右。
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131415[使用道具]
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你没切信号肽。
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luoliqiong[使用道具]
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原帖由 131415 于 2013-11-9 09:06 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

你没切信号肽。


怎么切信号肽呢?
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131415[使用道具]
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原帖由 luoliqiong 于 2013-11-9 09:07 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')


怎么切信号肽呢?


用信号肽分析软件,预测出你的三段序列各自的信号肽是多少个氨基酸,然后换算成多少个核苷酸(bp),然后设计引物时,上游引物直接从这些个bp之后开始扩增(要自己在上游引物里添加ATG),这样得到的PCR产物是不带有信号肽的。
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luoliqiong[使用道具]
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表达的时候要去除真核的分泌信号肽,真核信号肽在原核中不能识别。?

是这样的吗?师兄你能详细一点跟我解释一下吗?
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caihong[使用道具]
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相关疾病:
错位
个人感觉要注意的是基因序列和实验设计本身。

序列正确情况下要考虑到DNA序列在不同系统表达的差异。信号肽是个问题,但28a开始的那段可能已经把它作用给屏蔽的差不多。终止信号CDS上的是真核系统的,原核强度如何,要不要双终止?

有时也要考虑一个问题,尤其是你插入序列融合在载体自身表达标签时,有没有错位?有时也会犯这种小错误的。

然后,注意到,有的真核蛋白就是在一般的菌株表达不出,这个也不能排除。
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luoliqiong[使用道具]
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用信号肽分析软件,预测出你的三段序列各自的信号肽是多少个氨基酸,然后换算成多少个核苷酸(bp),然后设计引物时,上游引物直接从这些个bp之后开始扩增(要自己在上游引物里添加ATG),这样得到的PCR产物是不带有信号肽的。
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luoliqiong[使用道具]
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原帖由 caihong 于 2013-11-9 09:08 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
相关疾病:
错位
个人感觉要注意的是基因序列和实验设计本身。

序列正确情况下要考虑到DNA序列在不同系统表达的差异。信号肽是个问题,但28a开始的那段可能已经把它作用给屏蔽的差不多。终止信号CDS上的是真核系统的,原 ...

你好,如何考虑到DNA序列在不同系统表达的差异?小弟还不知道。谢谢你教导

没表达,如何判断要不要双终止呢?

错位是没有的,这是我最早考虑的问题,序列连在EcoRI后面。用vector NIT做重组质粒图谱和测序结果比对还是正确的
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131415[使用道具]
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一般来说,真核生物基因要做原核表达,最好都把信号肽去除,这是充分非必要条件。
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luoliqiong[使用道具]
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原帖由 131415 于 2013-11-9 09:11 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
一般来说,真核生物基因要做原核表达,最好都把信号肽去除,这是充分非必要条件。

小弟想和你请教如何预测信号肽?能否教教小弟如何去除信号肽。。。。。谢谢
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